突触粘附分子编码基因NRXN转录调控机制研究
发布时间:2021-06-17 15:00
目的:本研究的目的是探索是否存在新的NRXN基因的转录本,分析NRXN基因相关的启动子功能区域,以探究突触粘附分子编码基因NRXN的转录调控机制。方法:通过对NRXN3基因7个转录本的序列和蛋白结构域比对分析,以及PCR扩增特异的外显子区域确定NRXN3基因新型转录本。通过构建荧光素酶报告质粒,转染细胞并检测荧光素酶活性确定NRXN3δ和NRXN2α启动子活性区域,在构建的启动子报告基因质粒的基础上对DNA序列进行进一步删切和点突变鉴定功能区域和顺式作用元件。通过对核心启动子区域进行序列分析和查询dbTSS数据库分析典型和非典型的核心启动子元件。结果:对NRXN3基因的分析,我们发现了从未报道过的人类NRXN3基因的第三种独特的转录本,命名为δ-NRXN3。我们进一步鉴定了δ-NRXN3的最强启动子活性区域,最小启动子区域和具有基础活性的核心启动子区域以及三个NRXN3δ基因正向调控功能区域和四个负向调控功能区域。此外,我们在NRXN3δ基因的核心启动子区域中鉴定了两个非典型的核心启动子元件和典型的Inr基序。对NRXN2α基因的启动子分析,我们确定了NRXN2α基因的启动子活性区域和...
【文章来源】:重庆医科大学重庆市
【文章页数】:83 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
SignalP5.0neurexins蛋白信号肽预测结果
重庆医科大学硕士研究生学位论文67并非都是常规的“一对一”模式。根据是否参与突触以外功能可以将突触细胞粘附分子分成以突触功能为主的粘附分子(例如neurexins和neuroligins)和非突触功能为主粘附分子(例如dystroglycan,teneurins或LAR型PTPR)。部分突触细胞粘附分子也可能参与大脑的发育,特别是神经元的迁移(例如MDGA和FLRT)[21]。图1跨突触分子相互作用网络示意图Figure1.Schematicdiagrammolecularnetworkoftrans-synapticinteractionNeurexins基因和蛋白结构Neurexins是特异性表达于神经元表面的跨膜蛋白,在哺乳动物中由3个非连锁的基因组成,分别为NRXN1、NRXN2、NRXN3,其中NRXN1和NRXN3是已知人类基因中分子量最大的基因,在人类基因组中的大小分别为1.1Mb和1.7Mb,覆盖整个人类基因组近0.1%,而NRXN2相对较小,仅有110kb。NRXN1和NRXN2
重庆医科大学硕士研究生学位论文69图2Neurexins家族基因结构示意图Figure2.SchematicdiagramofthegenestructureoftheNeurexins图3Neurexins家族蛋白结构域以及剪切位点示意图Figure3.SchematicdiagramofneurexinsproteindomainsandalternativesplicingsitesNeurexins的可变剪切与分子多样性Neurexins经6个经典的剪切位点选择性剪切生成数千种亚型,其中α-NRXN包含剪切位点SS#1-SS#6,β-NRXN包含剪切点SS#4和SS#5,而γ-NRXN1包含剪切点SS#5[26,27](图3)。不同的亚型在大脑的不同部位表达不同,对于确定的神经元和确定的剪切位点,neurexin的可变剪切通常是连续进行的,并非为“全或无”的模式。不同类型的神经元对于确定的剪切位点表达的mRNA不同,可能包括或不包括相应的剪切位点[28]。Neurexins家族三个基因NRXN1,NRXN2和NRXN3在大
【参考文献】:
期刊论文
[1]48孔板荧光素酶报告基因实验边缘效应[J]. 廖丹,徐云飞,孟莎莎,周卫辉. 基因组学与应用生物学. 2018(09)
本文编号:3235416
【文章来源】:重庆医科大学重庆市
【文章页数】:83 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
SignalP5.0neurexins蛋白信号肽预测结果
重庆医科大学硕士研究生学位论文67并非都是常规的“一对一”模式。根据是否参与突触以外功能可以将突触细胞粘附分子分成以突触功能为主的粘附分子(例如neurexins和neuroligins)和非突触功能为主粘附分子(例如dystroglycan,teneurins或LAR型PTPR)。部分突触细胞粘附分子也可能参与大脑的发育,特别是神经元的迁移(例如MDGA和FLRT)[21]。图1跨突触分子相互作用网络示意图Figure1.Schematicdiagrammolecularnetworkoftrans-synapticinteractionNeurexins基因和蛋白结构Neurexins是特异性表达于神经元表面的跨膜蛋白,在哺乳动物中由3个非连锁的基因组成,分别为NRXN1、NRXN2、NRXN3,其中NRXN1和NRXN3是已知人类基因中分子量最大的基因,在人类基因组中的大小分别为1.1Mb和1.7Mb,覆盖整个人类基因组近0.1%,而NRXN2相对较小,仅有110kb。NRXN1和NRXN2
重庆医科大学硕士研究生学位论文69图2Neurexins家族基因结构示意图Figure2.SchematicdiagramofthegenestructureoftheNeurexins图3Neurexins家族蛋白结构域以及剪切位点示意图Figure3.SchematicdiagramofneurexinsproteindomainsandalternativesplicingsitesNeurexins的可变剪切与分子多样性Neurexins经6个经典的剪切位点选择性剪切生成数千种亚型,其中α-NRXN包含剪切位点SS#1-SS#6,β-NRXN包含剪切点SS#4和SS#5,而γ-NRXN1包含剪切点SS#5[26,27](图3)。不同的亚型在大脑的不同部位表达不同,对于确定的神经元和确定的剪切位点,neurexin的可变剪切通常是连续进行的,并非为“全或无”的模式。不同类型的神经元对于确定的剪切位点表达的mRNA不同,可能包括或不包括相应的剪切位点[28]。Neurexins家族三个基因NRXN1,NRXN2和NRXN3在大
【参考文献】:
期刊论文
[1]48孔板荧光素酶报告基因实验边缘效应[J]. 廖丹,徐云飞,孟莎莎,周卫辉. 基因组学与应用生物学. 2018(09)
本文编号:3235416
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