影像遗传学新方法研究-加权距离相关

发布时间：2021-07-16 12:51

　　影像遗传学主要用于揭示神经精神疾病风险基因的发病机制,并了解人脑结构,功能和个体差异之间的关系。越来越多的以体素为单位的全脑成像表型被用于检验与遗传标记的关联,而分析此类数据的挑战在于它们的双重高维性和复杂性。近年来出现了一些非参数的方法来解决两个多元变量之间的相关性分析问题,其中最为典型的是距离相关性[1]。距离相关可以度量两个任意维度的随机变量的线性以及非线性相关性,并且不依赖任何模型假设,这使得它更适用于影像遗传学的分析。但是,对于全脑成像的功能表型,体素的数量可能是数千个甚至更多,在这种高维甚至超高维情况下,距离相关的效果会变差,出现距离相关检验的功效会随着维度的增加而急剧下降[2],这反映了距离相关并不适用于分析这类全脑成像的高维遗传数据。为了有效构建关于影像表型和遗传变异的双重多变量分析方法,我们提出了一种基于加权距离相关（weighted distance correlation,wdCor）的影像遗传学关联分析的新框架。wdCor提出的主要思想是将较大的权重分配给真正和遗传标记有相关性的体素,将可忽略的权重分配给剩余那些体素,从而减少这部分在进行相关性检验时所带来的影响... 

【文章来源】：中国科学技术大学安徽省 211工程院校 985工程院校

【文章页数】：44 页

【学位级别】：硕士

【部分图文】：

图４．１?ｔＷＣｏ／■检验获得的左海马区（左图＞?和右海马区（右图）的Ｑ－Ｑ图??

?第４章ＡＤＮＩ数据集分析???表４．２?ＭＣｏｒ检验和ｄＣｏ／？检验检验出的前５个ＳＮＰ（右海马体）??ＳＮＰ?ＢＰ?ｐ．ｖａｌｕｅ?Ｇｅｎｅ??ｗｄＣｏｒ??ｒｓ２０７５６５０?４５３９５６１９?２．４ｅ－０６?ＴＯＭＭ４０??ｒｓ２０７５７６２?１８９８９８５９?１，６ｅ－０４?Ｎｏｎｅ??ｒｓ９７１０５２０?５８１６８９２２?２．６ｅ－０４?ＺＳＣＡＮ４??ｒｓｌ６８８１１４?３０３７７８７?８．０ｅ－０４?ＴＬＥ２??ｒｓ?１２６１０２９２?５８１６７７５３?ｌ．ｌｅ－０３?ＺＳＣＡＮ４??ｄＣｏｒ??ｒｓ?１６５４６５４?２４３７２２１０?３．７ｅ－０５?Ｎｏｎｅ??ｒｓ２０７５６５０?４５３９５６１９?ｌ．ｌｅ－０４?ＴＯＭＭ４０??ｒｓｌ?５７５８０?４５３９５２６６?２．４ｅ－０４?ＴＯＭＭ４０??ｒｓ?１１６７２３４２?３０２６６６０２?３．１ｅ－０４?Ｎｏｎｅ??ｒｓ２０９７７６５?２８１５６６６６?４．３ｅ－０４?Ｎｏｎｅ??为了更直观的分析ｒｓ２０７５６５０和右海马体的关联，图４．２展示了?ｒｓ２０７５６５０和??右海体切片的最优权重分布。??０．３、??〇．２、．丨．丄；．．：＇?．卜?＇?＇??图４．２右海马切片与ｒｓ２０７５６５０的最优化权重分布??２８??

【参考文献】：
期刊论文
[1]Neurofibrillary tangles in Alzheimer’s disease: elucidation of the molecular mechanism by immunohistochemistry and tau protein phospho-proteomics[J]. Athanasios Metaxas,Stefan J.Kempf.  Neural Regeneration Research. 2016(10)



本文编号：3287045