H1N1亚型流感病毒遗传进化谱系鉴别荧光定量PCR检测方法的建立

发布时间：2021-09-23 02:48

　　H1N1亚型流感病毒是A型流感病毒家族中的重要一员,位于哺乳动物感染流感病毒亚型之首,也是引发大流行性和季节性人流感的最主要亚型。近年来从禽类,尤其是在野鸟和活禽市场中H1N1病毒的分离概率有增高的趋势,由该亚型病毒所带来的公共威胁及其造成的经济损失已远远超过其他亚型流感。目前,H1N1流感病毒已经在人、哺乳动物和禽类群体中建立了相对稳定的遗传进化谱系。因此,了解H1N1流感病毒遗传演化谱系的感染和流行情况,对于我们识别流行毒株的谱系来源,明确在各个群体中流行的优势谱系,选择与流行谱系抗原性相匹配的疫苗以及筛选疫苗种毒等方面将大有裨益。本研究对来自GenBank和GISAID数据库中分离自中国的2,037条H1N1亚型流感病毒HA基因的遗传进化分析显示,该病毒已演化出4个不同的遗传进化谱系,分别是古典猪流感病毒谱系、季节性人流感病毒谱系、禽流感病毒谱系和欧亚类禽猪流感病毒谱系。基于进化树的谱系分析结果,我们对各谱系HA基因的核苷酸序列进行了比对,并选择HA基因的相对保守区域,针对每一谱系设计了多对鉴别引物,拟建立H1N1亚型流感病毒遗传进化谱系鉴别荧光定量PCR检测方法。同时,构建各谱... 

【文章来源】：吉林大学吉林省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校

【文章页数】：63 页

【学位级别】：硕士

【部分图文】：

古典猪流感病毒谱系鉴别引物所处HA基因核苷酸序列的区域Figure1TheregionofHAgenenucleotidesequenceofclassicalswineinfluenzaviruslineageidentificationprimers

第二篇研究内容H1N1亚型流感病毒遗传进化谱系鉴别荧光定量PCR检测方法的建立13的差异位点位于鉴别引物的3′端，有利于降低非特异性PCR扩增出现的概率。针对该区域设计的鉴别引物，可实现H1N1亚型流感病毒古典猪流感谱系的鉴别。图2、图3、图4分别是季节性人流感病毒谱系、禽流感病毒谱系与欧亚类禽猪流感病毒谱系鉴别引物与其他谱系HA基因核酸序列相同位置的差异分析。图1古典猪流感病毒谱系鉴别引物所处HA基因核苷酸序列的区域Figure1TheregionofHAgenenucleotidesequenceofclassicalswineinfluenzaviruslineageidentificationprimers图2季节性人流感病毒谱系鉴别引物所处HA基因核苷酸序列的区域Figure2TheregionofHAgenenucleotidesequenceofseasonalhumaninfluenzaviruslineageidentificationprimers

第二篇研究内容H1N1亚型流感病毒遗传进化谱系鉴别荧光定量PCR检测方法的建立14图3禽流感病毒谱系鉴别引物所处HA基因核苷酸序列的区域Figure3TheregionofHAgenenucleotidesequenceofavianinfluenzaviruslineageidentificationprimers图4欧亚类禽猪流感病毒谱系鉴别引物所处HA基因核苷酸序列的区域Figure4TheregionofHAgenenucleotidesequenceofEurasianavian-likeswineinfluenzaviruslineageidentificationprimers针对H1N1亚型流感病毒HA基因四个不同的遗传进化谱系，各遗传进化谱


本文编号：3404878