基于RNA序列特征及多源数据融合的miRNA—疾病关联关系预测研究

发布时间：2021-12-29 16:59

　　microRNA（miRNA）是一类主要功能为在转录后水平上抑制基因表达的内源性小型非编码RNA分子,它在许多重要的生物学过程中的都具有调控作用,其中就包含人类的复杂疾病。最近的研究表明,许多复杂疾病往往伴随着miRNA的异常表达,所以miRNA可以作为一类疾病诊断的潜在生物标记物和分子靶向治疗的靶标位点,来辅助疾病诊断、治疗以及预后。因此,大规模预测潜在的miRNA-疾病关联,对探明致病机制有十分重要的意义。考虑到传统的体外实验存在耗时和成本高昂等问题,研究有效、可行的计算方法来预测miRNA与疾病之间的潜在关联越来越受到人们关注。本文主要研究RNA序列的特征提取以及多源数据融合,提出了3种应用于miRNA-疾病相关性预测的计算模型:1、基于矩阵分解的miRNA-疾病相关性预测算法MLMDA。算法使用k-mer稀疏矩阵提取miRNA序列信息,并将其与miRNA功能相似性、疾病语义相似性和高斯相互作用谱内核相似性信息相结合;然后,通过深度自动编码器神经网络（AE）来从中提取更多具有代表性的特征。最后,采用随机森林分类器来有效预测潜在的miRNA-疾病关联。2、基于混沌博弈和增量学习的m... 

【文章来源】：中国矿业大学江苏省 211工程院校 教育部直属院校

【文章页数】：83 页

【学位级别】：硕士

【部分图文】：

k-mer算法遍历整RNA核苷酸序列的流程图

hsa-mir-135(miRNA)的混沌博弈表示Figure2-2CGRofthemiRNAnamedhsa-mir-135

混沌博弈表示中（hsa-mir-135）各个点坐标的含义Figure2-3ThemeaningofthecoordinatesofeachpointintheChaosGameRepresentation(hsa-mir-135)

【参考文献】：
期刊论文
[1]MicroRNA在肿瘤诊治中的研究进展[J]. 王俊,王岩.  癌症进展. 2016(05)



本文编号：3556516