两个新型硫酸皮肤素裂解酶的鉴定和应用
发布时间:2022-01-01 02:10
硫酸软骨素/硫酸皮肤素(Chondroitin Sulfate/Dermatan Sulfate,CS/DS)是一类直链线性聚阴离子多糖,由重复二糖单位组成。CS二糖单位的结构为由β-1,3糖苷键连接的葡萄糖醛酸(GlcUA)和N-乙酰半乳糖胺(GalNAc),二糖单位之间由β-1,4糖苷键连接而成CS的基本糖链骨架;当CS二糖单位中的GlcUA在C-5差向异构酶的作用下变为艾杜糖醛酸(IdoUA)时,形成了 DS二糖单位。其中,GlcUA或IdoUA的C-2、C-3位和GalNAc的C-4、C-6位在硫酸基转移酶的作用下会发生不同程度的硫酸化而形成不同硫酸化模式的二糖单位,从而产生结构高度复杂的CS/DS糖链结构。CS/DS是一类重要的糖胺聚糖(Glycosaminoglycan,GAG),作为蛋白聚糖(Proteoglycans,PGs)的侧链而存在。CS/DS链的结构高度复杂性赋予了其不同的生物活性,如参与细胞生长,细胞粘附,病毒的侵染,神经系统的发育等等。序列的不均一性,二糖排列的多变,糖醛酸的异构化尤其是硫酸化模式的不同使得CS/DS的结构与功能的研究面临巨大的挑战。CD/D...
【文章来源】:山东大学山东省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校
【文章页数】:78 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
图1-2部分GAGs裂解酶的降解模式[23]??1.3.1?CSaseABC??
山东大硕被第一次鉴定[36],是一种外切型裂解酶,可以将CS糖链中的GalNAc和GIcA??之间的(3-1,4糖苷键断裂,产生一系列的寡糖,主要为不饱和二糖结构,如图1-??3所示。CSase?ACII也对透明质酸有降解活性,可以降解HA中的GlcNAc和??GlcA之间的p-l,4糖苷键,但是它却不可以降解DS。CSaseAClI表现出一种外??切酶的作用模式,它可以从多糖链的非还原端一次切下一个二糖单位。CSaseAC??I发现于肝素黄杆菌?/r/〇fvoAocto"/MW?Aepar/www,是一种内切酶,可以随机切割HA??和CS糖链中己糖胺GlcNAc和GalNAc与己糖醛酸GlcA之间的p-1,4糖苷键,??但同样不能降解DS糖链中GalNAc和IdoUA之间的P-1,4糖苷键137,38】。??
山东大学硕士学位论文??■"…=:“.|??—5S??图2-3?DLase?1?(左)和DLase?2?(右)的表达和纯化后的SDS-PAGE电泳图??泳道1:标准蛋白Marker,?SM0431?(Thermo),其每条条带代表的分子量己在旁边标出;泳??道2:未经诱导的DLase?1细胞裂解液;泳道3:诱导过的DLase?1细胞裂解液;泳道4:诱??导过的DLase?1细胞裂解液上清;泳道5:纯化后的DLase?1蛋白;泳道6:标准蛋白Marker,??SM0431?(Thermo);泳道7:未经诱导的DLase2细胞裂解液;泳道8:诱导过的DLase2细??胞裂解液;泳道9:诱导过的DLase?2细胞裂解液上清;泳道10:纯化后的DLase?2蛋白。??2.4本章小结??本章利用生物信息学分析,从基因数据库中发现了两个疑似DS专一性裂解??酶基因说似ei?(GenBank?编号:WP?013634816.1?)和也观?2?(GenBank?编??号:SCH丨3530.1),这两个候选基因与已鉴定的5的相似度分别为57%和??43%。对两个疑似基因及其编码蛋白序列的分析表明:说似e?7基因全长为1473??bp,?GC含量为49.08%,编码的蛋白包含491个氨基酸,理论分子量为55.35?kDa,??pi为8.60,其N端信号肽包含21个氨基酸;基因全长为1401bp,GC含??量为48.61%,编码的蛋白含有467个氨基酸,理论分子量为52.00?kDa,?pi为??6.18,其N端信号肽包含19个氨基酸。进一步,通过全基因合成,基因重组和??蛋白质亲和纯化等技术,对这两个潜在的新型DS专一性降解酶DLas
【参考文献】:
博士论文
[1]一种硫酸软骨素E降解抗性的糖胺聚糖裂解酶的鉴定与应用[D]. 彭春娥.山东大学 2018
硕士论文
[1]美洲大赤鱿来源新型硫酸软骨素的制备及抗肿瘤转移活性研究[D]. 王庆彬.山东大学 2016
[2]鹅鱼皮胶原蛋白与硫酸皮肤素的同时提取及其结构、活性研究[D]. 杨阳.浙江工商大学 2015
本文编号:3561444
【文章来源】:山东大学山东省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校
【文章页数】:78 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
图1-2部分GAGs裂解酶的降解模式[23]??1.3.1?CSaseABC??
山东大硕被第一次鉴定[36],是一种外切型裂解酶,可以将CS糖链中的GalNAc和GIcA??之间的(3-1,4糖苷键断裂,产生一系列的寡糖,主要为不饱和二糖结构,如图1-??3所示。CSase?ACII也对透明质酸有降解活性,可以降解HA中的GlcNAc和??GlcA之间的p-l,4糖苷键,但是它却不可以降解DS。CSaseAClI表现出一种外??切酶的作用模式,它可以从多糖链的非还原端一次切下一个二糖单位。CSaseAC??I发现于肝素黄杆菌?/r/〇fvoAocto"/MW?Aepar/www,是一种内切酶,可以随机切割HA??和CS糖链中己糖胺GlcNAc和GalNAc与己糖醛酸GlcA之间的p-1,4糖苷键,??但同样不能降解DS糖链中GalNAc和IdoUA之间的P-1,4糖苷键137,38】。??
山东大学硕士学位论文??■"…=:“.|??—5S??图2-3?DLase?1?(左)和DLase?2?(右)的表达和纯化后的SDS-PAGE电泳图??泳道1:标准蛋白Marker,?SM0431?(Thermo),其每条条带代表的分子量己在旁边标出;泳??道2:未经诱导的DLase?1细胞裂解液;泳道3:诱导过的DLase?1细胞裂解液;泳道4:诱??导过的DLase?1细胞裂解液上清;泳道5:纯化后的DLase?1蛋白;泳道6:标准蛋白Marker,??SM0431?(Thermo);泳道7:未经诱导的DLase2细胞裂解液;泳道8:诱导过的DLase2细??胞裂解液;泳道9:诱导过的DLase?2细胞裂解液上清;泳道10:纯化后的DLase?2蛋白。??2.4本章小结??本章利用生物信息学分析,从基因数据库中发现了两个疑似DS专一性裂解??酶基因说似ei?(GenBank?编号:WP?013634816.1?)和也观?2?(GenBank?编??号:SCH丨3530.1),这两个候选基因与已鉴定的5的相似度分别为57%和??43%。对两个疑似基因及其编码蛋白序列的分析表明:说似e?7基因全长为1473??bp,?GC含量为49.08%,编码的蛋白包含491个氨基酸,理论分子量为55.35?kDa,??pi为8.60,其N端信号肽包含21个氨基酸;基因全长为1401bp,GC含??量为48.61%,编码的蛋白含有467个氨基酸,理论分子量为52.00?kDa,?pi为??6.18,其N端信号肽包含19个氨基酸。进一步,通过全基因合成,基因重组和??蛋白质亲和纯化等技术,对这两个潜在的新型DS专一性降解酶DLas
【参考文献】:
博士论文
[1]一种硫酸软骨素E降解抗性的糖胺聚糖裂解酶的鉴定与应用[D]. 彭春娥.山东大学 2018
硕士论文
[1]美洲大赤鱿来源新型硫酸软骨素的制备及抗肿瘤转移活性研究[D]. 王庆彬.山东大学 2016
[2]鹅鱼皮胶原蛋白与硫酸皮肤素的同时提取及其结构、活性研究[D]. 杨阳.浙江工商大学 2015
本文编号:3561444
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