七鳃鳗乙醛脱氢酶9和谷胱甘肽过氧化物酶4的基因克
发布时间:2022-01-07 08:20
七鳃鳗,现存最古老的无颌类脊椎动物之一,因其独特的进化地位和免疫系统获得了关注,成为研究脊椎动物先天免疫系统、抗氧化系统起源及进化的新型模式生物,因此七鳃鳗的先天免疫防御系统中必然存在一系列与解毒及参与水生动物氧化抗菌反应的相关蛋白。本论文首次从日本七鳃鳗(Lampetra japonica)白细胞中获得了乙醛脱氢酶9(aldehyde dehydrogenase 9,ALDH9)和谷胱甘肽过氧化物酶4(glutathione peroxidase4,GPx4)的同源基因,通过基因克隆、重组表达及生物信息学方法对基因进行分析预测,为更好的了解其活性奠定了基础。乙醛脱氢酶(ALDHs),能够将不同醛类氧化为相应的酸类,在内源性和外源性醛解毒过程中扮演了重要的角色。目前为止ALDH在哺乳动物及微生物中已有所研究,但其在鱼类及两栖类动物中研究较少。本论文首次克隆并原核表达了来自于日本七鳃鳗的ALDH9(Lj ALDH9)基因。LjALDH9 ORF区共1566 bp,编码521个氨基酸,理论分子量为55.68 kDa。LjALDH9蛋白含有信号肽区域(1-29)、Cys315活性位点及Ald...
【文章来源】:辽宁师范大学辽宁省
【文章页数】:88 页
【学位级别】:硕士
【文章目录】:
摘要
Abstract
缩略语表
第1章 引言
1.1 日本七鳃鳗
1.1.1 生活史
1.1.2 组织结构
1.1.3 功能基因
1.1.4 免疫相关基因
1.2 乙醛脱氢酶
1.2.1 乙醛脱氢酶家族蛋白概况
1.2.2 乙醛脱氢酶蛋白功能
1.2.3 鱼类血液中的醛类
1.2.4 乙醛脱氢酶的应用展望
1.3 谷胱甘肽过氧化物酶
1.3.1 GPx蛋白家族概况
1.3.2 GPx蛋白的功能
1.3.3 GPx作用机制
1.3.4 GPx家族蛋白的应用展望
1.4 本研究的目的和意义
第2章 LjALDH9基因的分子克隆、表达及活性分析
2.1 材料
2.1.1 菌株与载体
2.1.2 主要试剂
2.1.3 主要仪器
2.2 方法
2.2.1 LjALDH9基因的分子克隆
2.2.2 LjALDH9生物信息学分析
2.2.3 LjALDH9基因各组织表达量分析
2.2.4 LjALDH9原核表达
2.2.5 LjALDH9活性测定
2.3 实验结果
2.3.1 LjALDH9基因克隆
2.3.2 LjALDH9生物信息学分析
2.3.3 LjALDH9各组织相对表达量
2.3.4 LjALDH9原核表达载体构建
2.3.5 LjALDH9表达和纯化
2.3.6 LjALDH9酶活性检测
2.4 讨论
2.5 小结
第3章 Gpx4基因的分子克隆、表达及进化分析
3.1 材料
3.1.1 菌株与载体
3.1.2 主要试剂
3.1.3 主要仪器
3.2 方法
3.2.1 LjGPx4基因的分子克隆及序列分析
3.2.2 LjGPx4基因各组织表达量分析
3.2.3 LjGPx4基因组结构分析
3.3 实验结果
3.3.1 LjGPx4基因克隆
3.3.2 LjGPx4生物信息学分析
3.3.3 LjGPx4基因的组织表达及免疫前后变化
3.3.4 LjGPx4基因组结构分析
3.4 讨论
第4章 结论
本文创新点
参考文献
附录A pET28a(+)质粒图谱
附录B SanPrep柱式DNA胶回收试剂盒说明
附录C TaKaRA Genomic DNA提取
附录D 不同物种ALDH9的FASTA格式氨基酸序列(NCBI)
附录E 不同物种GPx4的FASTA格式氨基酸序列(NCBI)
附录F 不同物种GPx4的FASTA格式核苷酸序列(NCBI)
攻读硕士学位期间发表学术论文情况
致谢
【参考文献】:
期刊论文
[1]GC-MS法分析南湾鳙鱼鱼肉挥发性成分的组成[J]. 赵亮,马凌云. 食品与机械. 2011(06)
[2]七鳃鳗(Lampetra japonica)白细胞cDNA文库构建及生物信息学分析[J]. 张宁,刘欣,孙晶,刘岑洁,陈操,李竞,芦静,刘慧玲,李庆伟. 辽宁师范大学学报(自然科学版). 2010(02)
[3]日本鳗鲡谷胱甘肽过氧化物酶1和4的克隆、分析和组织表达分布[J]. 刘振兴,柯浩,曹艳林,张健騑,林敏,孟轩. 中国水产科学. 2010(03)
[4]鲤鱼挥发性成分测定及其产生机理初探[J]. 杨玉平,焦春海,廖涛,熊光权,程薇,王易芬,吴文锦,李小定,乔宇,李新,耿胜荣,林若泰. 湖北农业科学. 2010(03)
[5]重组七鳃鳗细胞毒素蛋白rLj-RGD3表达及对Hela细胞活性的影响[J]. 张丕桥,王继红,刘欣,褚丹,李庆伟. 生物工程学报. 2009(05)
[6]谷胱甘肽过氧化物酶和谷胱甘肽转硫酶研究进展[J]. 马森. 动物医学进展. 2008(10)
[7]硒对硒蛋白-谷胱甘肽过氧化物酶基因表达及其酶活性的调节[J]. 于昱,吕林,张亿一,罗绪刚. 动物营养学报. 2007(S1)
[8]Glutathione Peroxidase Revisited—Simulation of the Catalytic Cycle by Computer-Assisted Molecular Modelling[J]. K. -D. AUMANN; N. BEDORF; R. BRIGELIUS-FLOHED;D. SCHOMBURG; AND L. FLOHE(Gesellschaft fur Biotechnologische Forschung mbH (GBF) Mascheroder Weg 1, D-38124 Braunschweig, Germany; Deutsches Institut fur Ernahrungsforschung (DIfE) Arthur-Scheunert-Allee 114. Biomedical and Environmental Sciences. 1997(Z1)
硕士论文
[1]日本七鳃鳗α-天冬氨酰二肽酶和棕榈酰蛋白硫酯酶1的基因克隆、原核表达及生物活性研究[D]. 曹瀛.辽宁师范大学 2013
[2]日本七鳃鳗口腔腺Grimin基因的生物学活性研究[D]. 麻晓庆.辽宁师范大学 2007
[3]人乙醛脱氢酶2基因的克隆及表达[D]. 裘丽珍.浙江大学 2005
本文编号:3574190
【文章来源】:辽宁师范大学辽宁省
【文章页数】:88 页
【学位级别】:硕士
【文章目录】:
摘要
Abstract
缩略语表
第1章 引言
1.1 日本七鳃鳗
1.1.1 生活史
1.1.2 组织结构
1.1.3 功能基因
1.1.4 免疫相关基因
1.2 乙醛脱氢酶
1.2.1 乙醛脱氢酶家族蛋白概况
1.2.2 乙醛脱氢酶蛋白功能
1.2.3 鱼类血液中的醛类
1.2.4 乙醛脱氢酶的应用展望
1.3 谷胱甘肽过氧化物酶
1.3.1 GPx蛋白家族概况
1.3.2 GPx蛋白的功能
1.3.3 GPx作用机制
1.3.4 GPx家族蛋白的应用展望
1.4 本研究的目的和意义
第2章 LjALDH9基因的分子克隆、表达及活性分析
2.1 材料
2.1.1 菌株与载体
2.1.2 主要试剂
2.1.3 主要仪器
2.2 方法
2.2.1 LjALDH9基因的分子克隆
2.2.2 LjALDH9生物信息学分析
2.2.3 LjALDH9基因各组织表达量分析
2.2.4 LjALDH9原核表达
2.2.5 LjALDH9活性测定
2.3 实验结果
2.3.1 LjALDH9基因克隆
2.3.2 LjALDH9生物信息学分析
2.3.3 LjALDH9各组织相对表达量
2.3.4 LjALDH9原核表达载体构建
2.3.5 LjALDH9表达和纯化
2.3.6 LjALDH9酶活性检测
2.4 讨论
2.5 小结
第3章 Gpx4基因的分子克隆、表达及进化分析
3.1 材料
3.1.1 菌株与载体
3.1.2 主要试剂
3.1.3 主要仪器
3.2 方法
3.2.1 LjGPx4基因的分子克隆及序列分析
3.2.2 LjGPx4基因各组织表达量分析
3.2.3 LjGPx4基因组结构分析
3.3 实验结果
3.3.1 LjGPx4基因克隆
3.3.2 LjGPx4生物信息学分析
3.3.3 LjGPx4基因的组织表达及免疫前后变化
3.3.4 LjGPx4基因组结构分析
3.4 讨论
第4章 结论
本文创新点
参考文献
附录A pET28a(+)质粒图谱
附录B SanPrep柱式DNA胶回收试剂盒说明
附录C TaKaRA Genomic DNA提取
附录D 不同物种ALDH9的FASTA格式氨基酸序列(NCBI)
附录E 不同物种GPx4的FASTA格式氨基酸序列(NCBI)
附录F 不同物种GPx4的FASTA格式核苷酸序列(NCBI)
攻读硕士学位期间发表学术论文情况
致谢
【参考文献】:
期刊论文
[1]GC-MS法分析南湾鳙鱼鱼肉挥发性成分的组成[J]. 赵亮,马凌云. 食品与机械. 2011(06)
[2]七鳃鳗(Lampetra japonica)白细胞cDNA文库构建及生物信息学分析[J]. 张宁,刘欣,孙晶,刘岑洁,陈操,李竞,芦静,刘慧玲,李庆伟. 辽宁师范大学学报(自然科学版). 2010(02)
[3]日本鳗鲡谷胱甘肽过氧化物酶1和4的克隆、分析和组织表达分布[J]. 刘振兴,柯浩,曹艳林,张健騑,林敏,孟轩. 中国水产科学. 2010(03)
[4]鲤鱼挥发性成分测定及其产生机理初探[J]. 杨玉平,焦春海,廖涛,熊光权,程薇,王易芬,吴文锦,李小定,乔宇,李新,耿胜荣,林若泰. 湖北农业科学. 2010(03)
[5]重组七鳃鳗细胞毒素蛋白rLj-RGD3表达及对Hela细胞活性的影响[J]. 张丕桥,王继红,刘欣,褚丹,李庆伟. 生物工程学报. 2009(05)
[6]谷胱甘肽过氧化物酶和谷胱甘肽转硫酶研究进展[J]. 马森. 动物医学进展. 2008(10)
[7]硒对硒蛋白-谷胱甘肽过氧化物酶基因表达及其酶活性的调节[J]. 于昱,吕林,张亿一,罗绪刚. 动物营养学报. 2007(S1)
[8]Glutathione Peroxidase Revisited—Simulation of the Catalytic Cycle by Computer-Assisted Molecular Modelling[J]. K. -D. AUMANN; N. BEDORF; R. BRIGELIUS-FLOHED;D. SCHOMBURG; AND L. FLOHE(Gesellschaft fur Biotechnologische Forschung mbH (GBF) Mascheroder Weg 1, D-38124 Braunschweig, Germany; Deutsches Institut fur Ernahrungsforschung (DIfE) Arthur-Scheunert-Allee 114. Biomedical and Environmental Sciences. 1997(Z1)
硕士论文
[1]日本七鳃鳗α-天冬氨酰二肽酶和棕榈酰蛋白硫酯酶1的基因克隆、原核表达及生物活性研究[D]. 曹瀛.辽宁师范大学 2013
[2]日本七鳃鳗口腔腺Grimin基因的生物学活性研究[D]. 麻晓庆.辽宁师范大学 2007
[3]人乙醛脱氢酶2基因的克隆及表达[D]. 裘丽珍.浙江大学 2005
本文编号:3574190
本文链接:https://www.wllwen.com/shoufeilunwen/benkebiyelunwen/3574190.html