西太深海海山蛇尾种群遗传多样性与线粒体基因组研究
发布时间：2022-01-08 02:10
蛇尾属棘皮动物,是海洋中最重要的生物类群之一。海山是深海生物栖息地,因生物群落丰富而成为独特的生态系统。人类对于海山生态系统的两大关注点是采矿和渔业活动,但这些活动对海山生物群落造成了巨大破坏。本文通过多分子标记,研究西太深海海山蛇尾的遗传多样性,从种群栖息地环境,海山周围的海流运动情况等解释种群连通性水平,为研究深海海山区蛇尾连通性水平提供一定资料。另外,本文通过获取海山区蛇尾线粒体基因组,揭示其基本特征,构建系统发育树,分析了蛇尾遗传进化和分类关系。讨论基因重排,利用蛋白编码基因（PCG）进行正选择分析探讨深海海山蛇尾的适应性进化机制。本文研究成果有助于了解海山生物群落的进化过程和发展历史,对保护脆弱的海山生物群落和生态系统具有重要意义,对开发、评估、保护、管理海山资源提供了重要数据支持。保护砖蛇尾（Ophioplinthaca defensor）种群遗传多样性和线粒体基因组研究结果显示:（1）维嘉和RC海山O.defensor种群单倍型多样性（Hd）较高,核苷酸多样性（π）较低。从空间分布来看,维嘉海山南侧和西南侧样本数和单倍型数都高于东侧和北侧,ROV01的Hd和π最高,ROV...
【文章来源】：中国地质大学(北京)北京市 211工程院校 教育部直属院校
【文章页数】：96 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
蛇尾在全球的分布（Sthr等，2012）
第一章绪论10量测序法完成线粒体基因组的测序，对线粒体基因组进行注释。对线粒体基因组的基因图谱进行对比，对基因重排类型进行简单描述，利用分支模型、分支-位点模型对深海蛇尾的潜在正选择位点进行检验，利用Person相关性检验正选择位点和水深之间的相关性强度。图1-1技术路线图
中国地质大学（北京）工程硕士学位论文13蛇尾样本（图2-1）。所有蛇尾样品采集之后保存在90%的酒精当中以便后续分析。采样站位信息详见表2-1。用于线粒体基因组分析的4个蛇尾样品是用ROVHAIMA和ROVHAILONGIII采集自维嘉、Suda平顶海山，基于形态学和分子特征鉴定为Amphiurasp.、Ophiomusiumsp.、Ophiocamaxsp.和Ophiocreassp.（表2-2）。Amphiurasp.和Ophiomusiumsp.保存在90%的酒精中。Ophiocamaxsp.和Ophiocreassp.用液氮速冻后转移到-80℃超低温冰箱中保存。图2-1海山采样站位示意图表2-1西太海山Ophioplinthacadefensor蛇尾样品采样信息汇总航次站位海山日期经度(oE)纬度(oN)深度(m)个体数量DY35CW-DV81采薇（Caiwei）2014.7.24154.923015.683016601DY41BWJ-ROV01维嘉（Weijia）2017.9.28156.538112.694816708DY41BWJ-ROV04维嘉（Weijia）2017.9.18156.884513.024215714DY41BWJ-ROV05维嘉（Weijia）2017.9.19157.029312.884516431DY41BWJ-ROV06维嘉（Weijia）2017.9.21156.687712.7895193519DY56BG-ROV04巴泽蒂（Batiza）2019.9.11156.540420.015716991DY56RC-ROV06RC*2019.9.17161.753515.529014823DY56RC-ROV07RC*2019.9.19161.794015.495516601CW,采薇平顶海山;WJ,维嘉平顶海山;BG,Batiza平顶海山;RC,RC海山
【参考文献】：
期刊论文
[1]深海海洋生态系统与海洋生态保护区发展趋势[J]. 谢伟,殷克东. 中国工程科学. 2019(06)
[2]采薇平顶海山群的多级山顶平台及成因[J]. 张伙带,姚会强,杨永,张衡. 海洋地质与第四纪地质. 2018(06)
[3]The first record of Ophioleila elegans （Echinodermata:Ophiuroidea） from a deep-sea seamount in the Northwest Pacific Ocean[J]. ZHANG Dongsheng,LU Bo,WANG Chunsheng,O’HARA Timothy D. Acta Oceanologica Sinica. 2018(10)
[4]简化基因组测序技术及其在海洋生物研究中的应用[J]. 边力,王军. 厦门大学学报(自然科学版). 2017(01)
[5]南黄海北部晚更新世以来浮游植物生产力和群落结构变化的生物标志物记录[J]. 梅西,李日辉,张训华. 矿物岩石地球化学通报. 2015(05)
[6]植物亲缘地理学的研究现状与发展趋势[J]. 白伟宁,张大勇. 生命科学. 2014(02)
[7]海山生物多样性研究进展与展望[J]. 张均龙,徐奎栋. 地球科学进展. 2013(11)
[8]棘皮动物线粒体基因组的基因重排、分子标记及系统发生分析[J]. 申欣,田美,孟学平,程汉良,阎斌伦. 海洋学报(中文版). 2013(05)
[9]麦哲伦海山链漂移史及可能的来源[J]. 赵俐红,金翔龙,高金耀,李家彪,初凤友. 海洋学报(中文版). 2010(03)
[10]更新世冰期的全球深海绝灭事件[J]. Bruce W Hayward,周立君. 海洋地质动态. 2001(10)
硕士论文
[1]我国东南沿海厚壳贻贝群体遗传多样性及遗传结构研究[D]. 叶莹莹.浙江海洋学院 2012
本文编号：3575696
【文章来源】：中国地质大学(北京)北京市 211工程院校 教育部直属院校
【文章页数】：96 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
蛇尾在全球的分布（Sthr等，2012）
第一章绪论10量测序法完成线粒体基因组的测序，对线粒体基因组进行注释。对线粒体基因组的基因图谱进行对比，对基因重排类型进行简单描述，利用分支模型、分支-位点模型对深海蛇尾的潜在正选择位点进行检验，利用Person相关性检验正选择位点和水深之间的相关性强度。图1-1技术路线图
中国地质大学（北京）工程硕士学位论文13蛇尾样本（图2-1）。所有蛇尾样品采集之后保存在90%的酒精当中以便后续分析。采样站位信息详见表2-1。用于线粒体基因组分析的4个蛇尾样品是用ROVHAIMA和ROVHAILONGIII采集自维嘉、Suda平顶海山，基于形态学和分子特征鉴定为Amphiurasp.、Ophiomusiumsp.、Ophiocamaxsp.和Ophiocreassp.（表2-2）。Amphiurasp.和Ophiomusiumsp.保存在90%的酒精中。Ophiocamaxsp.和Ophiocreassp.用液氮速冻后转移到-80℃超低温冰箱中保存。图2-1海山采样站位示意图表2-1西太海山Ophioplinthacadefensor蛇尾样品采样信息汇总航次站位海山日期经度(oE)纬度(oN)深度(m)个体数量DY35CW-DV81采薇（Caiwei）2014.7.24154.923015.683016601DY41BWJ-ROV01维嘉（Weijia）2017.9.28156.538112.694816708DY41BWJ-ROV04维嘉（Weijia）2017.9.18156.884513.024215714DY41BWJ-ROV05维嘉（Weijia）2017.9.19157.029312.884516431DY41BWJ-ROV06维嘉（Weijia）2017.9.21156.687712.7895193519DY56BG-ROV04巴泽蒂（Batiza）2019.9.11156.540420.015716991DY56RC-ROV06RC*2019.9.17161.753515.529014823DY56RC-ROV07RC*2019.9.19161.794015.495516601CW,采薇平顶海山;WJ,维嘉平顶海山;BG,Batiza平顶海山;RC,RC海山
【参考文献】：
期刊论文
[1]深海海洋生态系统与海洋生态保护区发展趋势[J]. 谢伟,殷克东. 中国工程科学. 2019(06)
[2]采薇平顶海山群的多级山顶平台及成因[J]. 张伙带,姚会强,杨永,张衡. 海洋地质与第四纪地质. 2018(06)
[3]The first record of Ophioleila elegans （Echinodermata:Ophiuroidea） from a deep-sea seamount in the Northwest Pacific Ocean[J]. ZHANG Dongsheng,LU Bo,WANG Chunsheng,O’HARA Timothy D. Acta Oceanologica Sinica. 2018(10)
[4]简化基因组测序技术及其在海洋生物研究中的应用[J]. 边力,王军. 厦门大学学报(自然科学版). 2017(01)
[5]南黄海北部晚更新世以来浮游植物生产力和群落结构变化的生物标志物记录[J]. 梅西,李日辉,张训华. 矿物岩石地球化学通报. 2015(05)
[6]植物亲缘地理学的研究现状与发展趋势[J]. 白伟宁,张大勇. 生命科学. 2014(02)
[7]海山生物多样性研究进展与展望[J]. 张均龙,徐奎栋. 地球科学进展. 2013(11)
[8]棘皮动物线粒体基因组的基因重排、分子标记及系统发生分析[J]. 申欣,田美,孟学平,程汉良,阎斌伦. 海洋学报(中文版). 2013(05)
[9]麦哲伦海山链漂移史及可能的来源[J]. 赵俐红,金翔龙,高金耀,李家彪,初凤友. 海洋学报(中文版). 2010(03)
[10]更新世冰期的全球深海绝灭事件[J]. Bruce W Hayward,周立君. 海洋地质动态. 2001(10)
硕士论文
[1]我国东南沿海厚壳贻贝群体遗传多样性及遗传结构研究[D]. 叶莹莹.浙江海洋学院 2012
本文编号：3575696
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