镉胁迫下河南华溪蟹肝胰腺microRNA表达谱的研究
发布时间：2023-10-28 16:19
近年来,食品安全作为一项重要的民生问题,广受社会民众的关注。随着经济快速增长,现代工业的不断发展,水生生物重金属镉污染越加严重,对水产品的食品安全造成巨大影响,对人类产生多种健康危害。河南华溪蟹在我国分布广泛,且对重金属非常敏感,是监测水生生物镉污染的理想指示生物。通过研究镉对河南华溪蟹的毒性效应及其分子机制,有助于探究镉污染对水生生物的生产繁殖和对水产品的食品安全的危害作用。肝胰腺是河南华溪蟹镉积累的主要器官,也是镉污染毒性危害的主要靶器官。本研究组前期通过生物化学、细胞生物学等方法揭示了镉对河南华溪蟹肝胰腺的毒性效应,然而对其分子机制了解较少,特别是有关镉污染对河南华溪蟹转录后调控机制的研究。此外,为了更好的模拟水生生物生长环境,本研究采用亚慢性镉暴露方法,并选择低浓度(0.5mg/L)作为镉处理浓度。将河南华溪蟹随机分为两组:对照组和实验组(0.5mg/L),处理30天后取其肝胰腺进行如下实验。(1)河南华溪蟹肝胰腺microRNA(miRNA)序列测定:对其进行RNA的提取、cDNA文库的构建、原始序列的获取、序列数据的筛选以及miRNA的分析。结果表明:在实验组和对照组的两个...
【文章页数】：62 页
【学位级别】：硕士
【文章目录】：
中文摘要
ABSTRACT
第一章 综述
1.1 重金属镉及其危害
1.1.1 重金属镉
1.1.2 镉对食品安全性的影响
1.1.3 镉对人的影响
1.1.3.1 镉对人体器官的影响
1.1.3.2 镉对神经发育的影响
1.1.3.3 镉对儿童智力和行为方面的影响
1.2 膳食镉污染
1.2.1 水环境污染现状
1.2.2 人类膳食结构调整及水产品镉污染情况
1.3 镉对河南华溪蟹的影响研究进展
1.3.1 镉暴露后河南华溪蟹肝胰腺氧化损伤
1.3.2 镉暴露后河南华溪蟹肝胰腺形态学变化
1.3.3 河南华溪蟹肝胰腺转录组测序和基因表达分析
1.4 本学位论文的研究内容与意义
第二章 河南华溪蟹肝胰腺microRNA序列测定
2.1 材料和方法
2.1.1 实验动物
2.1.2 主要试剂及仪器
2.1.3 实验设计
2.1.4 实验方法
2.1.4.1 河南华溪蟹肝胰腺样本RNA的抽提和纯化
2.1.4.2 河南华溪蟹肝胰腺样本c DNA文库的构建
2.1.4.3 数据处理
2.2 实验结果
2.2.1 河南华溪蟹肝胰腺实验组与对照组RNA序列分析
2.2.2 河南华溪蟹肝胰腺实验组和对照组miRNA的验证
2.2.3 样本高质量序列与已知数据库比对分析结果
2.2.4 河南华溪蟹肝胰腺实验组和对照组miRNA基本信息的分析
2.2.5 河南华溪蟹miRNA信息与其他蟹种比对分析结果
2.3 讨论
2.3.1 物种多样性和组织特异性可能导致miRNA峰值的不同
2.3.2 河南华溪蟹肝胰腺中存在的miRNA具有特异性
2.3.3 许多miRNA在多种生物中存在并发挥重要作用
2.4 结论
第三章 河南华溪蟹肝胰腺对照组与实验组差异表达miRNA的鉴定以及qRT-PCR验证
3.1 材料与方法
3.1.1 实验动物
3.1.2 主要试剂及仪器
3.1.3 实验设计
3.1.4 实验方法
3.1.4.1 实验组和对照组中发生差异化表达的miRNA的比较研究
3.1.4.2 qRT-PCR验证
3.1.4.3 数据处理
3.2 实验结果
3.2.1 两组之间发生差异表达的miRNA
3.2.2 通过qRT-PCR验证差异表达的miRNA
3.3 讨论
3.4 结论
第四章 河南华溪蟹镉暴露组肝胰腺组织中差异表达的miRNA生物信息学功能预测
4.1 材料与方法
4.1.1 实验动物
4.1.2 主要试剂与仪器
4.1.3 实验设计
4.1.4 实验方法
4.1.4.1 目的基因预测与分析
4.1.4.2 差异表达基因的GO基因功能分析和KEGG途径富集分析
4.2 实验结果
4.2.1 河南华溪蟹镉暴露组肝胰腺差异表达miRNA的靶基因预测
4.2.2 河南华溪蟹镉暴露组肝胰腺miRNA生物信息学功能预测-GO基因功能分析
4.2.3 河南华溪蟹镉暴露组肝胰腺miRNA生物信息学功能预测-KEGG代谢通路分析
4.3 讨论
4.3.1 GO基因功能分类显示,大多数靶基因与氧化还原酶的调控有关
4.3.2 KEGG代谢途径结果表明,许多途径与蛋白的生物合成、降解以及修饰等的调控有关
4.4 结论
参考文献
攻读学位期间取得的研究成果
致谢
个人简况及联系方式
本文编号：3857342
【文章页数】：62 页
【学位级别】：硕士
【文章目录】：
中文摘要
ABSTRACT
第一章 综述
1.1 重金属镉及其危害
1.1.1 重金属镉
1.1.2 镉对食品安全性的影响
1.1.3 镉对人的影响
1.1.3.1 镉对人体器官的影响
1.1.3.2 镉对神经发育的影响
1.1.3.3 镉对儿童智力和行为方面的影响
1.2 膳食镉污染
1.2.1 水环境污染现状
1.2.2 人类膳食结构调整及水产品镉污染情况
1.3 镉对河南华溪蟹的影响研究进展
1.3.1 镉暴露后河南华溪蟹肝胰腺氧化损伤
1.3.2 镉暴露后河南华溪蟹肝胰腺形态学变化
1.3.3 河南华溪蟹肝胰腺转录组测序和基因表达分析
1.4 本学位论文的研究内容与意义
第二章 河南华溪蟹肝胰腺microRNA序列测定
2.1 材料和方法
2.1.1 实验动物
2.1.2 主要试剂及仪器
2.1.3 实验设计
2.1.4 实验方法
2.1.4.1 河南华溪蟹肝胰腺样本RNA的抽提和纯化
2.1.4.2 河南华溪蟹肝胰腺样本c DNA文库的构建
2.1.4.3 数据处理
2.2 实验结果
2.2.1 河南华溪蟹肝胰腺实验组与对照组RNA序列分析
2.2.2 河南华溪蟹肝胰腺实验组和对照组miRNA的验证
2.2.3 样本高质量序列与已知数据库比对分析结果
2.2.4 河南华溪蟹肝胰腺实验组和对照组miRNA基本信息的分析
2.2.5 河南华溪蟹miRNA信息与其他蟹种比对分析结果
2.3 讨论
2.3.1 物种多样性和组织特异性可能导致miRNA峰值的不同
2.3.2 河南华溪蟹肝胰腺中存在的miRNA具有特异性
2.3.3 许多miRNA在多种生物中存在并发挥重要作用
2.4 结论
第三章 河南华溪蟹肝胰腺对照组与实验组差异表达miRNA的鉴定以及qRT-PCR验证
3.1 材料与方法
3.1.1 实验动物
3.1.2 主要试剂及仪器
3.1.3 实验设计
3.1.4 实验方法
3.1.4.1 实验组和对照组中发生差异化表达的miRNA的比较研究
3.1.4.2 qRT-PCR验证
3.1.4.3 数据处理
3.2 实验结果
3.2.1 两组之间发生差异表达的miRNA
3.2.2 通过qRT-PCR验证差异表达的miRNA
3.3 讨论
3.4 结论
第四章 河南华溪蟹镉暴露组肝胰腺组织中差异表达的miRNA生物信息学功能预测
4.1 材料与方法
4.1.1 实验动物
4.1.2 主要试剂与仪器
4.1.3 实验设计
4.1.4 实验方法
4.1.4.1 目的基因预测与分析
4.1.4.2 差异表达基因的GO基因功能分析和KEGG途径富集分析
4.2 实验结果
4.2.1 河南华溪蟹镉暴露组肝胰腺差异表达miRNA的靶基因预测
4.2.2 河南华溪蟹镉暴露组肝胰腺miRNA生物信息学功能预测-GO基因功能分析
4.2.3 河南华溪蟹镉暴露组肝胰腺miRNA生物信息学功能预测-KEGG代谢通路分析
4.3 讨论
4.3.1 GO基因功能分类显示,大多数靶基因与氧化还原酶的调控有关
4.3.2 KEGG代谢途径结果表明,许多途径与蛋白的生物合成、降解以及修饰等的调控有关
4.4 结论
参考文献
攻读学位期间取得的研究成果
致谢
个人简况及联系方式
本文编号：3857342
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