内蒙古长蝽总科Lygaeoidea昆虫（昆虫纲：半翅目：异翅亚目）DNA条形码研究

发布时间：2024-01-21 14:52

　　长蝽总科Lygaeoidea,隶属于昆虫纲Insecta半翅目Hemiptera异翅亚目Heteroptera蝽次目Pentatomorpha。广泛分布于内蒙古各地,其中大多数种类为经济害虫,可对农田、草原和森林构成较大威胁。多数种类体色暗、体型微小,形态学特征相似,物种鉴定有一定难度,分类关系存在争议。本研究首次利用DNA条形码对内蒙古长蝽总科昆虫进行分类研究,扩增长蝽总科COI基因序列96条并从GeneBank数据库中下载31条,共127条序列,隶属于6科27属39种,分析了长蝽总科COI基因序列的特征,探究了COI基因作为DNA条形码在长蝽总科昆虫物种鉴定中的适用性,采用邻接法(NJ)、最大简约法(MP)、贝叶斯推论法(BI)讨论长蝽总科系统发育关系,并对谷子小长蝽Nysius ericae6个不同地理种群之间的遗传关系进行分析。主要研究结果如下:通过GeneBank数据库和BOLD数据库相似度比对,并与形态学鉴定相结合,发现Lamproplax picea为中国新纪录种,大盐长蝽Henestaris halophilus为内蒙古新纪录种,Emblethis vicarius和E...

【文章页数】：80 页

【学位级别】：硕士

【文章目录】：
摘要
abstract
一、引言
    1.1 长蝽总科昆虫研究概况
        1.1.1 长蝽总科昆虫研究进展
        1.1.2 长蝽总科昆虫的分类系统
        1.1.3 长蝽总科昆虫的经济意义
    1.2 DNA条形码概述
        1.2.1 DNA条形码技术的提出
        1.2.2 DNA条形码的发展
        1.2.3 DNA条形码原理和技术流程
        1.2.4 DNA条形码技术的优势
        1.2.5 DNA条形码的应用
        1.2.6 DNA条形码在昆虫中的应用研究现状
    1.3 研究的目的与意义
二、材料与方法
    2.1 实验材料
        2.1.1 标本来源
        2.1.2 实验试剂
        2.1.3 实验仪器
    2.2 实验方法
        2.2.1 标本的采集与鉴定
        2.2.2 DNA的提取
        2.2.3 凝胶电泳检测DNA
        2.2.4 COI基因PCR扩增
        2.2.5 扩增产物检测及测序
        2.2.6 数据处理
三、结果与分析
    3.1 形态学鉴定结果
    3.2 总DNA提取结果
    3.3 PCR扩增及测序结果
    3.4 序列比对与物种确定
    3.5 序列收集
    3.6 序列特征分析
        3.6.1 碱基组成
        3.6.2 碱基替换分析
        3.6.3 密码子使用频率与氨基酸组成分析
    3.7 DNA条形码物种鉴定分析
        3.7.1 遗传距离及NJ树分析
        3.7.2 Taxon DNA分析
        3.7.3 jMOTU分析
        3.7.4 ABGD分析
        3.7.5 PTP分析
    3.8 长蝽总科昆虫系统发育分析
        3.8.1 发育信号检测
        3.8.2 构建系统发育树
    3.9 谷子小长蝽Nysius ericae不同地理种群的遗传分析
四、结论
五、讨论
    5.1 DNA条形码在物种划分上有效性
    5.2 DNA条形码与传统分类方法结合鉴定物种
    5.3 基于COI序列的系统发育
    5.4 谷子小长蝽Nysius ericae的遗传多样性
参考文献
附录
    附录1 部分COI基因序列
    附录2 GeneBank下载序列信息
    附录3 长蝽总科氨基酸组成表
    附录4 Cluster结果
    附录5 jMOTU分子种划分结果
    附录6 ABGD鉴定结果
    附录7 PTP鉴定结果
致谢



本文编号：3882197