白色链霉菌和白背飞虱的基因组学研究
发布时间：2017-12-08 02:10
本文关键词：白色链霉菌和白背飞虱的基因组学研究
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【摘要】：第一部分:链霉菌是一类生活在极端复杂土壤环境中的革兰氏阳性菌,能够产生大量的次级代谢产物,是抗生素、抗肿瘤药物及免疫抑制剂等的主要来源之一。本研究从自然界中筛选出一株产量为0.79 g/L的ε-聚赖氨酸(ε-poly-lysine)产生菌S.albulus ZPM。我们对S.albulus ZPM的基因组进行了测序、组装、功能注释和比较基因组学分析。S.albulus ZPM基因组大小为9.78 Mb,GC含量为72.2%,共编码9,073个基因。比较基因组分析显示链霉菌核心基因组区位于S.albulus ZPM染色体的中部,染色体的两端区域含有很多物种特异性的基因。通过分析发现S.albulus ZPM含有44个次级代谢相关基因簇,其中有20个与聚酮化合物(Polyketide)和非核糖体多肽(non-ribosomal peptide)合成相关的基因簇,包括负责ε-聚赖氨酸的PGC(poly-lysine synthase gene cluster)非核糖体多肽基因簇。为了进一步鉴定与ε-聚赖氨酸产量相关的调控基因,我们使用复合诱变的方法筛选获得了180株产量不同的S.albulus ZPM突变体。通过对30株高产突变株组成的混合高产文库和30株低产突变株组成的混合低产文库进行基因组重测序分析,共鉴定出162个具有能导致非同义突变的编码蛋白基因,这些SNP突变分布在高产组和低产组有显著差异,提示这些基因可能参与调控ε-聚赖氨酸生物合成。功能富集分析c彩菊庑┗蛑饕斡胩妓衔镒擞氪弧⒒蜃嫉骺匾约澳芰坎，
本文编号：1264643
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