固本增骨方治疗骨质疏松症的网络药理学研究

发布时间：2021-01-26 06:14

　　目的:基于大数据挖掘固本增骨方防治骨质疏松症的主要活性成分,运用网络药理学构建“药物-疾病-靶点-信号通路”网络,探讨其治疗骨质疏松症的潜在机制和分子学途径。方法:在中药系统药理学数据库TCMSP在线分析平台以“OB≥30%,DL≥0.18和HL≥4.00”作为条件筛选出固本增骨方中黄芪、当归、党参、淫羊藿、熟地黄、肉苁蓉、乌药的有效活性成分,采用人类基因数据库（GeneCards）和人类孟德尔数据库（OMIM）筛选出疾病靶点,使用Cytoscape 3.7.2软件构建“疾病-中药复方-化合物-靶标”调控网络。利用String软件构建交集靶点蛋白互作网络和条形图,分析蛋白的相互作用关系及核心靶点。使用clusterProfiler R包对共同靶点进行GO功能与KEGG通路富集分析,得到固本增骨方治疗骨质疏松症核心基因相关的生物功能和信号通路。在BATMAN-TCM数据库中以“Score cutoff≥30,P-value≤0.05”作为条件筛选出君药黄芪、当归,臣药熟地黄、淫羊藿的活性成分及靶点后,以上述同样的方法进行网络药理学分析,预测“黄芪-淫羊藿”、“当归-熟地黄”两组药对治疗骨... 

【文章来源】： 王凯 甘肃中医药大学

【文章页数】：68 页

【学位级别】：硕士

【部分图文】：

固本增骨方与OP共同靶基因Venny图

固本增骨方治疗骨质疏松症的网络药理学研究20病的交集靶点，数据结果表明固本增骨方可能主要通过这49个有效成分作用于共同靶基因而对OP产生相应的影响，具体见图2。图2固本增骨方-疾病-化合物-靶标调控网络3.4PPI网络构建结果使用String软件交集靶点构建蛋白互作网络，得到132个靶蛋白的相互作用关系，见图3。

固本增骨方治疗骨质疏松症的网络药理学研究21图3蛋白相互作用网络图注：圆圈代表基因，线条代表基因间存在蛋白相互作用，圆圈内部结果代表蛋白结构，线头颜色代表蛋白之间存在相互作用的不同证据。红色线条代表基因融合的证据，绿色线条代表基因染色体位置邻接的证据，蓝色线条代表共同进化的证据，粉色线条代表实验的证据，黄色线条代表文本挖掘的证据，浅蓝色线条代表数据库的证据，黑色线条代表共表达的证据。（smallnodes:proteinofunknown3Dstructure;largenodes:some3Dstructureisknownorpredicted;Aredlineindicatesthepresenceoffusionevidence;agreenline-neighborhoodevidence;ablueline-coocurrenceevidence;apurpleline-experimentalevidence;ayellowline-textminingevidence;alightblueline-databaseevidence;ablackline-coexpressionevidence.）将以上所得数据输入R语言软件绘制蛋白互作网络邻接节点数目条形图，结果表明AKT、IL6、VEGFA、JUN、PTGS2、CASP3、MAPK1、MAPK8、CXCL8、MMP9、EGF、EGFR、MYC、IL1B、ESR1、CCL2、CCND1、MMP2、IL10、MAPK14、PPARG、SERPINE1、RELA、ERBB2、NOS3、AR、ICAM1、IL4、BCL2L1的邻接数目分别为99、96、90、81、79、78、78、78、77、77、76、76、74、72、69、69、67、66、64、63、59、59、59、57、56、56、54、54、54、53个，由图4可以看出AKT、IL6、VEGFA、JUN、PTGS2、CASP3、MAPK1、MAPK8等网络邻接节点数目均大于70，位于网络最核心。

【参考文献】：
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本文编号：3000617