ABCB1基因多态性与卵巢癌一线方案化疗毒副反应及近期疗效相关性研究

发布时间：2021-03-06 10:13

　　目的1.探讨卵巢癌患者中各基因SNP的基本情况,研究ABCB1在正常组织器官和卵巢癌组织中的表达水平及其与卵巢癌患者临床病例资料及预后的关系。2.探讨ABCB1基因多态性与卵巢癌患者一线方案化疗毒副反应及近期疗效的关系。方法基于TCGA和GTEx数据库,对卵巢癌患者的SNP数据及RNA-seq数据进行生物信息学分析。选取2017年10月至2019年6月就诊于中国人民解放军联勤保障部队第九四〇医院及甘肃省妇幼保健院的40例卵巢癌患者。40例卵巢癌患者均接受手术治疗,术后均给予铂类联合紫杉醇一线方案化疗6个疗程。使用原位杂交技术对样本中ABCB1的G2677T/A、C3435T进行基因型检测,采用c²检验和Logistic回归分析ABCB1基因多态性与卵巢癌患者一线方案化疗毒副反应及近期疗效的关系。结果1.基于TCGA数据库,卵巢癌患者基因突变发生率较高的前15位基因分别为TP53、TTN、MUC16、MUC17、CSMD3、HMCN1、USH2A、FAT3、DST、RYR2、NF1、TOP2A、APOB、MACF1、SYNE2。2.基于GTEx数据库,ABCB1在正... 

【文章来源】：甘肃中医药大学甘肃省

【文章页数】：55 页

【学位级别】：硕士

【部分图文】：

TCGA数据库中卵巢癌样本的SNP情况

ABCB1基因多态性与卵巢癌一线方案化疗毒副反应及近期疗效相关性研究182.公共数据库中ABCB1在卵巢癌的基因表达情况基于GTEx数据库，发现ABCB1在正常肾上腺组织中表达水平最高，在骨组织中表达水平最低。与女性相比，在男性脂肪及乳腺组织中ABCB1显著高表达（P＜0.05）。与男性相比，在女性脑组织中ABCB1显著高表达（P＜0.05）（图2）。GTEx数据库中共获得88例正常卵巢组织样本，与TCGA数据库中379例卵巢癌组织样本相比较，ABCB1在卵巢癌中显著低表达（P＜0.05）。不同分期卵巢癌患者的ABCB1表达水平无显著差异（P＞0.05）。ABCB1的表达水平与卵巢癌患者的总生存期无关（P＞0.05）。ABCB1发生突变的样本与未发生突变的样本相比，其ABCB1的表达水平未见显著差异（P＞0.05）（图3）。图2.基于GTEx数据库ABCB1在正常人体各组织中的表达情况

ABCB1基因多态性与卵巢癌一线方案化疗毒副反应及近期疗效相关性研究19图3.A：ABCB1在正常卵巢组织及卵巢癌中的表达差异；B：GEPIA在线工具分析不同分期卵巢癌中ABCB1的表达水平；C：ABCB1在卵巢癌组织中的表达水平与患者总生存期间的关系；D：ABCB1在突变组与野生组中的表达水平3.ABCB1基因型在研究人群中的分布40例卵巢癌患者中，ABCB1C3435T检测结果为：CC14例（35.0%），CT17例（42.5%），TT9例（22.5%）,CT+TT26例（65.0%），经Hardy-Weinberg遗传平衡定律检验（2=0.75，P＞0.05），该样本达到了遗传平衡；ABCB1G2677T/A检测结果为：GG11例（27.5%），GT14例（35.0%），TT15例（37.5%），GT+TT29例（72.5%），经Hardy-Weinberg遗传平衡定律检验（2=3.43，P＞0.05），该样本达到了遗传平衡（表5）。结合患者一般资料，观察患者一般资料与基因型分布频率的关系。40例卵巢癌患者中，＞50岁者23名（57.5%），≤50岁者17名（42.5%）；病理分期I-II期14名（35.0%），表5.ABCB1基因Hardy-Weinberg遗传平衡定律检验ABCB1基因基因型频数（%）等位基因频数（%）理论频数（%）2PC3435TCC14（35.0）C45（56.25）12.66（31.64）0.75>0.05CT17（42.5）T35（43.75）19.69（49.22）TT9（22.5）7.66（19.14）G2677T/AGG11（27.5）G36（45.0）8.10（20.25）3.43>0.05GT14（35.0）T44（55.0）19.80（49.50）TT15（37.5）12.10（30.25）

【参考文献】：
期刊论文
[1]ABCB1基因C3435T多态性与儿童急性淋巴细胞白血病相关性的分析[J]. 赵富磊,李骞,柳汝明,王茜,张峻.  中国临床药理学杂志. 2018(18)



本文编号：3066914