16S rDNA高通量测序分析肉芽肿性小叶性乳腺炎的菌群特征

发布时间：2021-07-11 04:09

　　目的:探讨改进肉芽肿性小叶性乳腺炎病灶中细菌检测的方法,评估比较肉芽肿性小叶性乳腺炎中的肉芽肿和病灶旁组织中的菌群分布差异,进一步研究肉芽肿性小叶性乳腺炎与细菌感染的关系。方法:收集2018年6月²020年4月于湖南省人民医院初治新发的46例经病理确诊的肉芽肿性小叶性乳腺炎患者的病例资料,选择术前2周内未进行抗感染治疗的14例患者作为研究对象,于手术室无菌条件下收取每例患者的肉芽肿病灶、病灶旁组织（介于正常组织和病灶之间的组织,且距离病灶至少1²cm）以及脓液样本各1份,共取得36份样本（其中脓液样本9份,肉芽肿样本14份,病灶旁组织样本13份）,将收集到的9份脓液样本及时接种于培养基中,进行微生物培养与鉴定。另将收集到的14份肉芽肿组织样本设置为RY组,13份病灶旁组织样本设置为ZF组,提取两组样本的DNA,应用高通量测序技术,对RY及ZF组菌群进行16S rDNA测序,并利用QIIME等软件将测序结果与16S数据库比对进行物种注释,根据物种丰度信息进行物种分类与丰度分析、Alpha多样性分析及Beta多样性分析,进一步对肉芽肿性小叶性乳腺... 

【文章来源】：湖南师范大学湖南省 211工程院校

【文章页数】：57 页

【学位级别】：硕士

【部分图文】：

样本稀释曲线

物种累积箱型图

硕士学位论文14两个指标，以衡量两个样本间的相异系数，在物种多样性方面，其数值大小反映了这两个样本间存在的差异大校并基于Unifrac进行主坐标分析（PCoA，PrincipalCo-ordinatesAnalysis），见图6、图7。图6基于WeightedUnifrac距离的PCoA分析图图7基于UnweightedUnifrac距离的PCoA分析图

【参考文献】：
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硕士论文
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本文编号：3277306