环状RNA circSP3通过作为miR-198的海绵调节CDK4的表达促进肝细胞癌的增殖、迁移和侵袭
发布时间:2021-08-22 04:22
目的:探究在肝细胞肝癌中circSP3的表达、作用以及circSP3通过作为miR-198海绵调节CDK4的表达从而促进肝细胞癌的增殖、迁移和侵袭的相关机制。方法:采用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)实验检测circSP3在肝细胞癌患者癌组织和癌旁肝组织中的表达水平,此外检测4种肝癌细胞(Hep-3B、Huh7、Bel-7402、SMMC-7721)和正常肝细胞(HL-77O2)中的表达水平。使用质粒转染以及慢病毒感染Hep-3B和Huh-7细胞,从而筛选得到过表达以及敲低circSP3表达的肝癌细胞株。同时采用CCK-8实验,Transwell迁移实验和Transwell侵袭实验分别检测circSP3对肝癌细胞增殖、迁移和侵袭的影响。采用裸鼠成瘤实验来验证circSP3在体内对细胞增殖活性的影响。然后使用生物信息学分析,qRT-PCR,双荧光素酶测定和蛋白质印迹分析circSP3,miR-198和CDK4之间的关系。之后的救援实验验证circSP3通过作为miR-198海绵调节CDK4的表达从而促进肝细胞癌的增殖、迁移和侵袭。结果:qRT-PCR结果表明,相比与癌旁肝组织和正常肝...
【文章来源】:重庆医科大学重庆市
【文章页数】:66 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
circSP3在HCC组织中的表达水平Figure1.RelativeexpressionofcircSP3inHCCtissues.qRT-PCR检测50对HCC组织和对应癌旁肝组织中circSP3的表达水平
重庆医科大学硕士研究生学位论文282.2circSP3环状结构确定通过Sanger测序,数据库查询和RNaseR处理确认circSP3的环状结构。CircSP3(chr2:174,819,600–174,820,960)源自SP3基因座中的外显子区域,该区域位于染色体2q31.1(图2A)上。为了确认circSP3的环状结构,我们首先将circSP3的PCR产物插入T载体进行Sanger测序。如图2B所示,测序结果与circBase提供的circSP3的反向剪接区域一致。另外,我们设计了两组引物,一组用于环形转录本的引物,另一组用于线性转录本的引物。然后,我们将circRNA敲低质粒转染到细胞中,并使用RTPCR检测SP3的环状和线性转录表达水平。结果表明,circSP3水平显著降低,而SP3线性转录本的表达水平没有变化(图2C)。最后,对RNA进行RNaseR核酸外切酶的消化抗性实验。结果表明,使用RNaseR核酸外切酶处理之后线性SP3表达水平被明显降低,而circSP3的表达水平没有明显变化(图2D)。总体而言,实验结果证明了circSP3的环状结构。图2.circSP3环状结构确定Figure2.ConfirmationofcircularstructureofcircSP3A,B.Sange测序以及数据库查询验证circSP3的位置以及环化位点。
重庆医科大学硕士研究生学位论文29C,D.qRT-PCR检测circSP3敲低以及RnaseR处理后线性SP3和circSP3的表达。*P<0.05;**P<0.01;***P<0.001。A,B.SangesequencinganddatabasequeryverifythepositionofcircSP3andthecircularizationsite.C,D.qRT-PCRwasusedtodetectcircSP3knockdownandlinearSP3andcircSP3expressionafterRnaseRtreatment.*P<0.05;**P<0.01;***P<0.001.2.3circSP3在HCC细胞中的表达采用qRT-PCR对4种HCC细胞(Hep-3B,Huh7,Bel-7402和SMMC-7721)和正常肝细胞(HL-77O2)中circSP3的表达水平进行检测。结果表明,同正常肝细胞相比,4种HCC细胞中circSP3的表达水平均显著上调;相对于正常肝细胞,Hep-3B(P<0.05),SMMC-7721(P<0.001),Bel-7402(P<0.001)和Huh7(P<0.001),中circSP3的表达量分别为:1.440±0.1286,1.603±0.05783,1.637±0.03180,2.222±0.1931。4种HCC细胞中,Huh-7细胞中circSP3的表达水平最高,而Hep-3B细胞中circSP3的表达水平最低。因此选用Hep-3B细胞和Huh-7细胞作为后续实验对象。图3.circSP3在HCC细胞中的表达水平Figure3.ExpressionofcircSP3inHCCcelllines.qRT-PCR检测4种HCC细胞(Hep-3B,Huh7,Bel-7402和SMMC-7721)和正常肝细胞(HL-77O2)中circSP3的表达水平。*P<0.05;**P<0.01;***P<0.001。RelativecircSP3expressionlevelsinfiveHCCcelllines(Hep-3B,Huh7,SMMC-7721andBel-7402)andonenormalhumanhepatocyte(HL-7702)wasdetectedbyqRT-PCR.*P<0.05;**P<0.01;***P<0.001.
本文编号:3356993
【文章来源】:重庆医科大学重庆市
【文章页数】:66 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
circSP3在HCC组织中的表达水平Figure1.RelativeexpressionofcircSP3inHCCtissues.qRT-PCR检测50对HCC组织和对应癌旁肝组织中circSP3的表达水平
重庆医科大学硕士研究生学位论文282.2circSP3环状结构确定通过Sanger测序,数据库查询和RNaseR处理确认circSP3的环状结构。CircSP3(chr2:174,819,600–174,820,960)源自SP3基因座中的外显子区域,该区域位于染色体2q31.1(图2A)上。为了确认circSP3的环状结构,我们首先将circSP3的PCR产物插入T载体进行Sanger测序。如图2B所示,测序结果与circBase提供的circSP3的反向剪接区域一致。另外,我们设计了两组引物,一组用于环形转录本的引物,另一组用于线性转录本的引物。然后,我们将circRNA敲低质粒转染到细胞中,并使用RTPCR检测SP3的环状和线性转录表达水平。结果表明,circSP3水平显著降低,而SP3线性转录本的表达水平没有变化(图2C)。最后,对RNA进行RNaseR核酸外切酶的消化抗性实验。结果表明,使用RNaseR核酸外切酶处理之后线性SP3表达水平被明显降低,而circSP3的表达水平没有明显变化(图2D)。总体而言,实验结果证明了circSP3的环状结构。图2.circSP3环状结构确定Figure2.ConfirmationofcircularstructureofcircSP3A,B.Sange测序以及数据库查询验证circSP3的位置以及环化位点。
重庆医科大学硕士研究生学位论文29C,D.qRT-PCR检测circSP3敲低以及RnaseR处理后线性SP3和circSP3的表达。*P<0.05;**P<0.01;***P<0.001。A,B.SangesequencinganddatabasequeryverifythepositionofcircSP3andthecircularizationsite.C,D.qRT-PCRwasusedtodetectcircSP3knockdownandlinearSP3andcircSP3expressionafterRnaseRtreatment.*P<0.05;**P<0.01;***P<0.001.2.3circSP3在HCC细胞中的表达采用qRT-PCR对4种HCC细胞(Hep-3B,Huh7,Bel-7402和SMMC-7721)和正常肝细胞(HL-77O2)中circSP3的表达水平进行检测。结果表明,同正常肝细胞相比,4种HCC细胞中circSP3的表达水平均显著上调;相对于正常肝细胞,Hep-3B(P<0.05),SMMC-7721(P<0.001),Bel-7402(P<0.001)和Huh7(P<0.001),中circSP3的表达量分别为:1.440±0.1286,1.603±0.05783,1.637±0.03180,2.222±0.1931。4种HCC细胞中,Huh-7细胞中circSP3的表达水平最高,而Hep-3B细胞中circSP3的表达水平最低。因此选用Hep-3B细胞和Huh-7细胞作为后续实验对象。图3.circSP3在HCC细胞中的表达水平Figure3.ExpressionofcircSP3inHCCcelllines.qRT-PCR检测4种HCC细胞(Hep-3B,Huh7,Bel-7402和SMMC-7721)和正常肝细胞(HL-77O2)中circSP3的表达水平。*P<0.05;**P<0.01;***P<0.001。RelativecircSP3expressionlevelsinfiveHCCcelllines(Hep-3B,Huh7,SMMC-7721andBel-7402)andonenormalhumanhepatocyte(HL-7702)wasdetectedbyqRT-PCR.*P<0.05;**P<0.01;***P<0.001.
本文编号:3356993
本文链接:https://www.wllwen.com/shoufeilunwen/mpalunwen/3356993.html
最近更新
教材专著