胆囊切除术后肠道菌群改变与结直肠癌的关系
发布时间:2021-08-25 19:18
目的:结直肠癌(colorectal cancer,CRC)是发病及死亡率均呈持续上升态势的恶性消化道肿瘤之一。研究认为多因素参与了CRC的发生发展,近年来研究发现胆囊切除术可导致肠道微生物失调,继而胆酸代谢障碍,使患者处于结直肠癌的高危状态,然而究其肠道菌群特征变化是否因胆囊切除术后改变知之甚少。鉴于此,本研究采用高通量测序技术,探寻胆囊切除术后患者肠道菌群的一些改变在多样性、分布及相对丰度的方面,目的研究结直肠癌发病原因是否涵盖胆囊切除术后影响菌群变化这一方面。方法:选取在山西省人民医院就诊的,位于2018年3月至2019年9月时间段内,并符合要求的入组人员20例,其中健康志愿者4例、LC术后患者5例、结直肠癌患者6例、LC术后结直肠癌患者5例,并采集相应粪便标本20例,对采集的粪便样本分组(A、B、C、D组)。再对样本相关细菌进行DNA提取与检测,PCR扩增、产物纯化等相关操作,再通过生物信息学分析获得特定实验样品中细菌物种组成、复杂性及分布变化等诸多信息。结果:实验共得到了835502条高质量扩增特征序列(即OTU),后按99%序列相似性聚类,为获得物种注释信息对比核糖体RNA...
【文章来源】:山西医科大学山西省
【文章页数】:37 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
B分别为各组在门、AB
6本研究的Alphal稀释曲线走势趋于平缓,表明此次测序结果的已经可以代表样本的复杂程度,继续增加测序深度将无意义。我们对Group1(A组、B组、C组、D组)、Group2(健康组、肿瘤组)、Group3(A组、B组)、Group4(A组、C组)、Group5(B组、D组)、Group6(C组、D组)的相关菌群的物种多样性进行了比较分析。在得到整体的Alpha多样性指数后,比较各分组之间多样性指数用KruskalWallis方法差异无统计学差异(P>0.05)。详见图2及表1.A图1A、B分别为各组在门、属水平上的菌群组成及相对丰度A图2(A)稀释性曲线。(B)shnnon指数的箱型图。(C)shnnon指数的组间多重比较。BACGroupsB
7图3LEfSe分析LDA柱状图(LDA>2,物种在组间具有统计学差异)图4LEfSe分析的cladogram图说明:cladogram图由内到外,对应界门纲目科属不同的分类层级,层级间连线表所属关系。每个圆圈节点代表一个物种,节点为黄色代表在分组间差异不显著,不为黄色则代表该物种是对应颜色分组的特征微生物(在该分组丰度显著较高)。有颜色的扇形区域标注了特征微生物的下属分类区间。表1各组间物种多样性差异分析结果Group1Group2SamplesizePermutationsPseudo-FP-valueAB99991.380.175C109990.980.430D99991.210.263ABC
【参考文献】:
期刊论文
[1]肠道菌群与疾病相关性的研究进展[J]. 张静,王肖枭,周怡,王雪,顾开明,叶迎春. 基础医学与临床. 2020(02)
[2]肠道菌群检测与临床应用的研究进展[J]. 吴培东. 医疗装备. 2020(01)
[3]炎症性肠病肠道微生物紊乱研究进展[J]. 吴泽宇,桑力轩,姜敏,常冰. 中国实用内科杂志. 2020(01)
[4]结直肠癌外科临床研究进展及展望[J]. 张忠涛,杨盈赤. 中国实用外科杂志. 2020(01)
[5]2019.V1版《NCCN结直肠癌诊治指南》更新要点解析[J]. 白雪杉,林国乐. 中国全科医学. 2019(33)
[6]内镜下黏膜切除术与内镜黏膜下剥离术治疗结直肠癌临床疗效的Meta分析[J]. 张亮,柳舟,陈军,刘亚男,季梦瑶,亢舰,李娇. 中国内镜杂志. 2019(11)
[7]Role of diet and gut microbiota on colorectal cancer immunomodulation[J]. Carolina Vieira De Almeida,Marcela Rodrigues de Camargo,Edda Russo,Amedeo Amedei. World Journal of Gastroenterology. 2019(02)
[8]2013年中国结直肠癌发病与死亡分析[J]. 杜灵彬,李辉章,王悠清,朱陈,郑荣寿,张思维,陈万青,赫捷. 中华肿瘤杂志. 2017 (09)
[9]经肛门微创手术和内镜黏膜下剥离术治疗直肠早癌的疗效观察[J]. 陈大明,张建生,吴会国,冯福梅,杜海鹏. 中国老年保健医学. 2017(02)
博士论文
[1]肠道微生物刺激组织蛋白酶K分泌介导TLR4依赖的M2巨噬细胞极化并促进结直肠癌转移[D]. 李睿.南方医科大学 2019
本文编号:3362701
【文章来源】:山西医科大学山西省
【文章页数】:37 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
B分别为各组在门、AB
6本研究的Alphal稀释曲线走势趋于平缓,表明此次测序结果的已经可以代表样本的复杂程度,继续增加测序深度将无意义。我们对Group1(A组、B组、C组、D组)、Group2(健康组、肿瘤组)、Group3(A组、B组)、Group4(A组、C组)、Group5(B组、D组)、Group6(C组、D组)的相关菌群的物种多样性进行了比较分析。在得到整体的Alpha多样性指数后,比较各分组之间多样性指数用KruskalWallis方法差异无统计学差异(P>0.05)。详见图2及表1.A图1A、B分别为各组在门、属水平上的菌群组成及相对丰度A图2(A)稀释性曲线。(B)shnnon指数的箱型图。(C)shnnon指数的组间多重比较。BACGroupsB
7图3LEfSe分析LDA柱状图(LDA>2,物种在组间具有统计学差异)图4LEfSe分析的cladogram图说明:cladogram图由内到外,对应界门纲目科属不同的分类层级,层级间连线表所属关系。每个圆圈节点代表一个物种,节点为黄色代表在分组间差异不显著,不为黄色则代表该物种是对应颜色分组的特征微生物(在该分组丰度显著较高)。有颜色的扇形区域标注了特征微生物的下属分类区间。表1各组间物种多样性差异分析结果Group1Group2SamplesizePermutationsPseudo-FP-valueAB99991.380.175C109990.980.430D99991.210.263ABC
【参考文献】:
期刊论文
[1]肠道菌群与疾病相关性的研究进展[J]. 张静,王肖枭,周怡,王雪,顾开明,叶迎春. 基础医学与临床. 2020(02)
[2]肠道菌群检测与临床应用的研究进展[J]. 吴培东. 医疗装备. 2020(01)
[3]炎症性肠病肠道微生物紊乱研究进展[J]. 吴泽宇,桑力轩,姜敏,常冰. 中国实用内科杂志. 2020(01)
[4]结直肠癌外科临床研究进展及展望[J]. 张忠涛,杨盈赤. 中国实用外科杂志. 2020(01)
[5]2019.V1版《NCCN结直肠癌诊治指南》更新要点解析[J]. 白雪杉,林国乐. 中国全科医学. 2019(33)
[6]内镜下黏膜切除术与内镜黏膜下剥离术治疗结直肠癌临床疗效的Meta分析[J]. 张亮,柳舟,陈军,刘亚男,季梦瑶,亢舰,李娇. 中国内镜杂志. 2019(11)
[7]Role of diet and gut microbiota on colorectal cancer immunomodulation[J]. Carolina Vieira De Almeida,Marcela Rodrigues de Camargo,Edda Russo,Amedeo Amedei. World Journal of Gastroenterology. 2019(02)
[8]2013年中国结直肠癌发病与死亡分析[J]. 杜灵彬,李辉章,王悠清,朱陈,郑荣寿,张思维,陈万青,赫捷. 中华肿瘤杂志. 2017 (09)
[9]经肛门微创手术和内镜黏膜下剥离术治疗直肠早癌的疗效观察[J]. 陈大明,张建生,吴会国,冯福梅,杜海鹏. 中国老年保健医学. 2017(02)
博士论文
[1]肠道微生物刺激组织蛋白酶K分泌介导TLR4依赖的M2巨噬细胞极化并促进结直肠癌转移[D]. 李睿.南方医科大学 2019
本文编号:3362701
本文链接:https://www.wllwen.com/shoufeilunwen/mpalunwen/3362701.html
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