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NUSAP1促进肝细胞癌增殖并影响其预后的研究

发布时间:2021-09-03 13:59
  研究背景:肝细胞癌是严重影响生活质量和生命健康的消化系统常见的疾病之一,据最新数据表明,肝细胞癌占全球恶性肿瘤发病率第六位,在恶性肿瘤死因中占第四位。虽然目前对肝细胞癌的治疗方法较多,且以手术治疗为主,但绝大多数病人仍难免死于肿瘤的复发和转移。然而目前对于其恶性程度高,治疗效果差,患者预后不理想的确切分子机制尚不完全清楚,因此,探索新的基因功能改变与肝细胞癌发展的关系,对揭示肝细胞癌发生发展的分子机制、提高患者预后及生存重要的意义。核仁纺锤体相关蛋白(NUSAP1)是一种重要的微管结合蛋白,它在有丝分裂过程中参与微管交联,调控着丝粒微管的功能,支配着染色体的摆动。此外,NUSAP1还调控纺锤体组装、染色体分离和细胞分裂。近年来研究表明NUSAP1在黑素瘤、乳腺癌、急性骨髓性白血病等许多肿瘤中都存在高表达,但是NUSAP1与肝癌的关系以及参与细胞生物学过程中的确切机制并未十分明确。本研究旨在探讨NUSAP1在HCC中的表达情况及其与预后不良之间的关系,同时探究NUSAP1在HCC发生发展过程中生物学作用及其分子机制,寻找HCC早期诊断相关的分子标志物和药物作用靶点。方法:1、收集6个独立... 

【文章来源】:南昌大学江西省 211工程院校

【文章页数】:60 页

【学位级别】:硕士

【部分图文】:

NUSAP1促进肝细胞癌增殖并影响其预后的研究


A用Meta分析对GEO数据库中数据集筛选差异表达基因的流程图

细胞,基因,可视,数据集


第3章结果24图3.1B37个差异表达基因在肝细胞癌和正常组织中表达情况的可视化热图综上,基于6个独立数据集(5个GEO数据集和1个TCGA数据集)共714例肝细胞癌组织样本和359例正常样本的整合分析,我们共筛选出11个在所有数据集的肝细胞癌组织中都显著且稳定高表达的基因:BBOX1,CENPA,DLGAP5,FOXM1,KIF20A,KIF4A,MKI67,NCAPG,NUSAP1,SFN,和TPX2。由于其中大部分基因在癌症中的发生发展作用已经在许多研究中得到证实,只有关于NUSAP1的研究甚少,虽然我们猜测NUSAP1可能参与肝细胞癌的发生发展,但其在肝细胞癌中的功能及作用仍然未知,因此我们对NUSAP1展开进一步的研究。3.2NUSAP1在HCC中高表达且与患者生存和临床病理分型有关NUSAP1是一种约55KD大小的核仁蛋白,它是有丝分裂过程中纺锤体形成的重要组成部分。为了证实NUSAP1在肝细胞癌中的表达情况,我们整合了GEO数据库中的6个数据集进行NUSAP1单个基因的Meta分析,通过计算标准化均

曲线,肝癌,统计学,意义


第3章结果25数差(SMD)及其95%CI绘制森林图,如图3.2A。结果表明,NUSAP1在肝细胞癌中的表达量是显著高于正常肝组织对照组的,差异有统计学意义(95%CI=1.63-2.26,P=1.87×10-73)。并且6个数据集之间异质性较小(P=0.11,I2=44%),结果可靠性强。图3.2ANUSAP1在癌组织和正常组织表达差异Meta分析为了进一步研究NUSAP1在肝细胞癌发生发展中的作用,我们整合了转录组与临床生存数据。我们将TCGA的肝癌相关表达数据分为两组,即癌组织和非癌组织,进行表达差异分析。结果显示NUSAP1在癌组织和非癌组织中的表达差异显著(t值=8.93,P=7.17×1016如图3.2B),与上述Meta分析结果一致。同时,我们对肝癌的临床样本进行生存分析,以基因表达值的中位值为二分类阈值,将样本分为高表达组和低表达组;进行LogRank检验发现NUSAP1高表达与NUSAP1低表达组的生存曲线有明显差异,且差异有统计学意义(P=0.00929,图3.2C),也就是说NUSAP1高表达的患者生存时间更短图3.2BNUASP1在癌组织和癌旁组织中的表达程度图3.2CNUSAP1表达与患者生存的关系


本文编号:3381242

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