NEIL1抑制人结肠癌细胞凋亡的作用及其受调机制
发布时间:2021-09-24 01:03
背景:结直肠癌是全球最常见的癌症之一,它的发生和进展可因累积抑癌基因和癌基因的突变而形成。DNA损伤修复系统缺陷导致基因突变率增高,促进肿瘤的发生和进展。作为一种重要的DNA修复酶,Nei核酸内切酶Ⅷ样蛋白1(Nei endounucleaseⅧ-like1,NEIL1)与多种癌症的发生有关,但是其对结直肠癌进展的确切作用尚不清楚。通过大数据分析我们发现高表达NEIL1的结直肠癌患者存活较差。在人结肠癌细胞中通过siRNA沉默和重组质粒过表达实验,我们发现NEIL1可以抑制结肠癌细胞凋亡和促进细胞活力。通过大数据及靶向软件分析我们发现NEIL1可能受到miR-7-5p的潜在靶向调控,并对其进行了验证。并探讨了miR-7-5p的调控对NEIL1抑制细胞凋亡和促进细胞活力作用的影响。我们的数据表明NEIL1通过抑制人结肠癌细胞的凋亡而促进细胞活力,此作用受miR-7-5p负向调控调节。本研究为NEIL1调控结肠癌发展的网络提供了新颖的见解,并为其作为结直肠癌的潜在治疗靶点提供依据。目的:本研究旨在探讨内切核酸酶VIII-like1(NEIL1)在结直肠癌(CRC)发病机理中的作用。方法:[...
【文章来源】:延安大学陕西省
【文章页数】:70 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
TCGA数据库查询NEIL1在癌症病人中的生存期预测
-15-NEIL1抑制人结肠癌细胞凋亡的作用及其受调机制从TCGA数据库中提取结直肠癌组织中NEIL1表达的数据,使用长秩分析发现NEIL1高表达的CRC患者存活较差。图3-1TCGA数据库查询NEIL1在癌症病人中的生存期预测Figure3-1TheTCGAdatabasequeriesNEIL1forsurvivalpredictionsincancerpatients3.2.2使用TCGA数据库数据分析NEIL1与miR-7-5p相关性从癌症基因组图谱(TCGA)数据库(https://xenabrowser.net)中提取结直肠癌组织中NEIL1表达的数据,使用长秩(Matel-Cox)分析发现NEIL1高表达的CRC患者存活较差。对于miRNA目标预测,我们通过两个常用公共数据库TargetScan(http://www.targetscan.org/vert_71)和miRDB(http://mirdb.org/miRDB),并使用在线交叉检查工具(http://bioinfogp.cnb.csic.es/tools/venny/index.html)找到miR-7-5p可以靶向NEIL1的3"-UTR。最后用皮尔逊相关系数(Pearsoncorrelationcoefficient)分析出在结肠癌组织中,miR-7-5p和NEIL1的表达量呈现负相关。图3-2TCGA数据库中NEIL1与miR-7-5p显著负相关Figure3-2NEIL1andmiR-7-5paresignificantlynegativelycorrelatedintheTCGAdatabase
-27-NEIL1抑制人结肠癌细胞凋亡的作用及其受调机制图4-1通过qRT-PCR验证NEIL1mRNA的变化,通过蛋白质印迹分析NEIL1蛋白的变化Figure4-1NEIL1mRNAchangesverifiedbyqRT-PCR,andNEIL1proteinchangesanalyzedbyWesternblotNEIL1对结直肠癌细胞增殖能力的影响接着,我们将NEIL1干扰片段及对照分别转染至HCT116和SW480细胞中,运用MTT实验检测两种细胞系增殖的改变。如图所示,MTT实验结果表明,较Ctrl.组,NEIL1组HCT116细胞的细胞活力在72h处明显下调。以上结果说明,敲低NEIL1能够抑制结肠癌细胞的增殖能力。图4-2MTT分析siNEIL1处理的HCT116/SW480细胞的细胞活力Figure4-2MTTanalysisofcellviabilityofsiNEIL1-treatedHCT116/SW480cells
本文编号:3406787
【文章来源】:延安大学陕西省
【文章页数】:70 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
TCGA数据库查询NEIL1在癌症病人中的生存期预测
-15-NEIL1抑制人结肠癌细胞凋亡的作用及其受调机制从TCGA数据库中提取结直肠癌组织中NEIL1表达的数据,使用长秩分析发现NEIL1高表达的CRC患者存活较差。图3-1TCGA数据库查询NEIL1在癌症病人中的生存期预测Figure3-1TheTCGAdatabasequeriesNEIL1forsurvivalpredictionsincancerpatients3.2.2使用TCGA数据库数据分析NEIL1与miR-7-5p相关性从癌症基因组图谱(TCGA)数据库(https://xenabrowser.net)中提取结直肠癌组织中NEIL1表达的数据,使用长秩(Matel-Cox)分析发现NEIL1高表达的CRC患者存活较差。对于miRNA目标预测,我们通过两个常用公共数据库TargetScan(http://www.targetscan.org/vert_71)和miRDB(http://mirdb.org/miRDB),并使用在线交叉检查工具(http://bioinfogp.cnb.csic.es/tools/venny/index.html)找到miR-7-5p可以靶向NEIL1的3"-UTR。最后用皮尔逊相关系数(Pearsoncorrelationcoefficient)分析出在结肠癌组织中,miR-7-5p和NEIL1的表达量呈现负相关。图3-2TCGA数据库中NEIL1与miR-7-5p显著负相关Figure3-2NEIL1andmiR-7-5paresignificantlynegativelycorrelatedintheTCGAdatabase
-27-NEIL1抑制人结肠癌细胞凋亡的作用及其受调机制图4-1通过qRT-PCR验证NEIL1mRNA的变化,通过蛋白质印迹分析NEIL1蛋白的变化Figure4-1NEIL1mRNAchangesverifiedbyqRT-PCR,andNEIL1proteinchangesanalyzedbyWesternblotNEIL1对结直肠癌细胞增殖能力的影响接着,我们将NEIL1干扰片段及对照分别转染至HCT116和SW480细胞中,运用MTT实验检测两种细胞系增殖的改变。如图所示,MTT实验结果表明,较Ctrl.组,NEIL1组HCT116细胞的细胞活力在72h处明显下调。以上结果说明,敲低NEIL1能够抑制结肠癌细胞的增殖能力。图4-2MTT分析siNEIL1处理的HCT116/SW480细胞的细胞活力Figure4-2MTTanalysisofcellviabilityofsiNEIL1-treatedHCT116/SW480cells
本文编号:3406787
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