难治性癫痫患者线粒体全基因组检测的临床意义

发布时间：2017-05-18 07:10

  本文关键词：难治性癫痫患者线粒体全基因组检测的临床意义，由笔耕文化传播整理发布。

【摘要】：目的探讨难治性癫痫患者线粒体基因变异情况及两者之间的关系,探索线粒体基因未知的变异位点或表型。方法采用聚合酶链式反应(Polymerase chain reaction,PCR)、Sanger测序法对2013年1月至2014年12月西京医院神经内科癫痫门诊的难治性癫痫患者行线粒体全基因组测序,测序结果与NCBI数据库中正常人线粒体基因组(NC_012920.1)比对,参照人类线粒体基因组数据库寻找突变位点。结果共有54例患者进行了线粒体基因组测序,其中男性34例,女性20例。在54例患者的线粒体基因组测序结果中,共发现33个目前已知的疾病相关的单核苷酸多态性位点(Single nucleotide polymorphism,SNP),其中2个位于MT-RNR1基因,2个位于MT-RNR2基因,6个位于tRNA编码区,21个位于多肽编码区,2个位于DLoop区。m.13708 GA和m.14668CT这两个位点突变频率与NCBI数据库中的中国北京地区汉族人群(HapMap-CHB)的相应位点等位基因频率对比,差异有统计学意义(P0.01),本组难治性癫痫患者中m.13708 GA、m.14668CT两个位点突变频率高于正常人群。发现3个目前已知的致病突变位点,其中m.636AG突变1例,m.636A是遗传性耳聋或氨基糖甙类诱导性耳聋(Maternally inherited DEAFness or aminoglycoside-induced DEAFness,DEAF)的致病位点;m.7445AC突变1例,m.7445AC也是DEAF的致病位点;m.3243AG突变3例,m.3243AG是线粒体脑肌病并发乳酸酸中毒及中风样发作(Mitochondrial Encephalomyopathy,Lactic Acidosis,and Stroke-like episodes,MELAS)、慢性进行性眼外肌麻痹(Chronic Progressive External Ophthalmoplegia,CPEO)等多种疾病的致病位点。发现4个未见报道的新突变,m.15018 TA突变、m.15066 TA突变,位于MT-cytb基因上;m.14207GC突变、m.14288 CA突变,位于MT-ND6基因上。结论难治性癫痫患者线粒体全基因组测序筛查为明确某些难治性癫痫患者的病因诊断提供了线索。
【关键词】：癫痫 线粒体基因组 线粒体脑肌病
【学位授予单位】：第四军医大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2015
【分类号】：R742.1;R440
【目录】：

• 缩略语表5-8
• 中文摘要8-10
• Abstract10-12
• 前言12-13
• 文献回顾13-25
• 1.癫痫13-15
• 1.1 流行病学资料13
• 1.2 定义13-14
• 1.3 病因、诊断及治疗14-15
• 2.线粒体DNA15-20
• 2.1 线粒体结构与分布15-16
• 2.2 线粒体内代谢途径16-19
• 2.3 mtDNA结构19
• 2.4 mtDNA特性19-20
• 3.线粒体基因突变与癫痫20-25
• 3.1 线粒体DNA突变导致线粒体功能异常所致癫痫21-23
• 3.2 线粒体与癫痫之间的相互作用机制23-24
• 3.3 抗癫痫药物对线粒体的影响24-25
• 1 仪器与材料25
• 2 线粒体基因检测25-31
• 2.1 研究对象25
• 2.2 样本采集25-26
• 2.3 提取基因组26-28
• 2.4 扩增线粒体基因28-30
• 2.5 PCR产物电泳30-31
• 2.6 PCR产物测序31
• 3 结果31-44
• 3.1 已知的疾病相关单核苷酸多态性位点32-34
• 3.2 已知的致病突变位点34-39
• 3.3 新的突变位点39-44
• 4 讨论44-50
• 4.1 已知的疾病相关单核苷酸多态性位点44-45
• 4.2 已知的致病突变位点45-47
• 4.3 新的突变位点47-50
• 小结50-51
• 参考文献51-59
• 个人简历和研究成果59-60
• 致谢60

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本文编号：375388