耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌基因型分析及传播路径调查研究
发布时间:2025-01-18 10:18
目的:耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌(carbapenem-resistant Klebsiella pneumoniae,CRKP)引起的院内感染因其高传播率、高病死率、高耐药率引起广泛关注。近年来院内CRKP感染的患者逐渐增多,细菌耐药形势较为严峻。为了防止医院内CRKP的扩散,了解院内感染CRKP的基因型及其进化关系和感染CRKP患者间的传播路径关系,为医院感染防控提供数据支持。方法:收集蚌埠市第三人民医院2018年11月至2019年3月CRKP非重复菌株21株,采用梅里埃VITEK微生物鉴定仪进行菌种鉴定、最低抑菌浓度MIC法和药敏纸片扩散KB法分析菌株对抗菌药物的敏感性,mCIM实验联合eCIM实验检测碳青霉烯酶表型。提取菌株DNA,利用Illumina Hiseq 2500平台进行全基因组测序、SPAdes软件进行序列拼接、Staramr软件分析菌株耐药基因、MLST软件分析多位点序列分型(Multilocus sequence typing,MST)、Ridom SeqSphere+软件进行核心基因组多位点序列分型(core genome multilocus sequence ...
【文章页数】:40 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
本文编号:4028482
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【部分图文】:
图319株CRKP的院内传播路径图
17圈代表一个菌株基于cgMLST分型2358个靶基因序列的等位基因谱。连接线上的数字表示不同等位基因的数量。圆圈的颜色代表不同的CT型,代表CT3176型,代表CT1814型,代表CT1689型,代表CT3195型,代表CT1313型。图2基于21个肺炎克雷伯菌菌株的cgMLS....
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