牦牛父系遗传多样性及起源研究
发布时间：2021-04-16 17:20
牦牛是分布在青藏高原及其濒临的高山、亚高山地区的特有牛种。牦牛的遗传多样性及起源问题,是近年来牦牛科学研究中的热点问题之一。当前,牦牛的遗传多样性及起源研究大多来自线粒体基因组和核基因组常染色体遗传变异的信息,而基于Y染色体序列变异（即父系遗传信息）的研究相对较少。本研究采用PCR产物直接测序和微卫星（STR）基因型分型技术筛选牦牛Y-SNP和Y-STR多态标记,基于这2种多态标记的联合分析,确定牦牛Y染色体单倍型。以家牦牛11个地方品种（即九龙、麦洼、娘亚、斯布、帕里、高原、环湖、甘南、巴州、中甸和天祝牦牛）、1个培育品种（即大通牦牛）和3个群体（即塔县、雪多和类乌齐牦牛）共682头公牦牛和8头野牦牛公牛为研究对象,对其Y染色体遗传变异、父系遗传多样性、谱系地理结构、分化、聚类关系、分子变异（AMOVA）及系统发育关系等进行综合分析,获得如下结果:1)通过对5个牦牛Y-SNPs标记（即SRY4、USP9Y、UTY19、AMELY3和OFD1Y10）进行测序分析,在确认先前报道的6个Y-SNPs基础上,本研究首次在牦牛OFD1Y10标记发现4个新的Y-SNPs。通过筛选40个普通牛Y-...
【文章来源】：西北农林科技大学陕西省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校
【文章页数】：107 页
【学位级别】：博士
【部分图文】：
牦牛线粒体基因组结构简图
用 SPSS 17.0 软件基于 Rst 值遗传距离矩阵，l Scaling，MDS）分析，探究牦牛品种（群体）的聚.6.1.5 软件（Bandelt et al. 1999）被用于构建牦牛 Yining，MJ）网络关系图，以确定不同单倍型间的系异被给予不同的加权（W），其中转换为 W=10，颠酸变异具有较高的权重分配（Ginja et al. 2009; Li et a传的研究报道（Li et al. 2007），牦牛 Y-STR 标记根不同的权重分配。A 检测 DNA 经 1.5%的琼脂糖凝胶电泳检测，结果如图 2无降解和蛋白污染现象，可开展后续 PCR 扩增实
31图 2-2 牦牛 5 个 Y-SNPs 标记中 10 个 SNPs 位点的测序峰图。图中 g～j 为本研究在 OFD1Y1标记上新发现的 4 个 SNPs 位点测序峰图Figure 2-2 The sequencing maps of the five yak Y-SNPs markers having 10 SNPs. The four newSNPs found in OFD1Y10 marker in this study were showed in figures g, h, i and j.(i) OFD1Y10（g. 608G>T）(j) OFD1Y10（g. 653G>C）
【参考文献】：
期刊论文
[1]绵羊Y染色体特异性引物及SNPs的筛选[J]. 曹学涛,裴生伟,张晋,李发弟,李刚,李万宏,乐祥鹏. 中国农业科学. 2018(15)
[2]基于mtDNA D-loop序列分析探究青海雪多牦牛的遗传多样性及母系遗传背景[J]. 李瑞哲,马志杰,陈生梅,孙永刚,官却扎西,陈永伟,徐惊涛. 青海畜牧兽医杂志. 2018(02)
[3]牦牛DGAT1基因多态性及其与乳质性状关联分析[J]. 高小莉,胡江,郭淑珍,石斌刚,谢建鹏,罗玉柱,王继卿,牟永娟. 中国农业科学. 2017(16)
[4]表皮生长因子对牦牛卵丘细胞低氧诱导因子-1α表达的影响及与凋亡的关联性分析[J]. 张译夫,潘阳阳,温泽星,余四九. 畜牧兽医学报. 2016(06)
[5]中甸牦牛mtDNA D-Loop区遗传多样性及系统进化分析[J]. 涂世英,汪琦,柴志欣,钟金城. 中国草食动物科学. 2016(03)
[6]牦牛Y染色体分子遗传学研究进展[J]. 马志杰. 中国农业大学学报. 2016(02)
[7]西藏牦牛遗传多样性的ISSR分析[J]. 姚慧,钟金城,姬秋梅,张成福,信金伟,陈智华,柴志欣. 生态学杂志. 2015(11)
[8]四川省不同类群牦牛遗传进化树构建[J]. 官久强,谢荣清,高晓云,侯定超,刘曦,吴伟生,安添午,蒋小兵,罗晓林. 畜牧与兽医. 2015(09)
[9]牦牛Ihh基因组织表达分析、SNP检测及其基因型组合与生产性状的关联分析[J]. 李天科,赵娟花,裴杰,梁春年,郭宪,秦文,阎萍. 畜牧兽医学报. 2015(01)
[10]西藏牦牛线粒体DNA的遗传多样性及系统进化分析[J]. 宋乔乔,钟金城,张成福,信金伟,姬秋梅,柴志欣. 兽类学报. 2014(04)
硕士论文
[1]牦牛基因组微卫星挖掘与筛选验证[D]. 赵芳芳.西南科技大学 2015
[2]水牛、牦牛及马Y染色体分子遗传多样性研究[D]. 张钦.西北农林科技大学 2015
[3]牦牛和普通牛基因组的密码子使用分析[D]. 宋乔乔.西南民族大学 2015
[4]昌台牦牛遗传多样性蛋白和基因水平的研究[D]. 高杰.西南民族大学 2014
[5]牦牛角性状候选基因关联分析及CART基因多态性研究[D]. 刘建.中国农业科学院 2013
[6]牦牛ANK1基因多态性与胴体和肉质性状关联分析[D]. 陈海青.甘肃农业大学 2013
[7]牦牛A-FABP、H-FABP基因多态性及与胴体和肉质性状关联性分析[D]. 曹健.甘肃农业大学 2012
[8]天祝白牦牛FSH、FSHR基因多态性分析与双胎性状的关联研究[D]. 邢耀潭.甘肃农业大学 2011
[9]牦牛OB基因和SCD1基因SNPs与肌肉脂肪酸含量的关联性分析[D]. 刘自增.中国农业科学院 2011
[10]中国黄牛Y染色体微卫星和SNPs遗传多样性与起源研究[D]. 常振华.西北农林科技大学 2011
本文编号：3141849
【文章来源】：西北农林科技大学陕西省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校
【文章页数】：107 页
【学位级别】：博士
【部分图文】：
牦牛线粒体基因组结构简图
用 SPSS 17.0 软件基于 Rst 值遗传距离矩阵，l Scaling，MDS）分析，探究牦牛品种（群体）的聚.6.1.5 软件（Bandelt et al. 1999）被用于构建牦牛 Yining，MJ）网络关系图，以确定不同单倍型间的系异被给予不同的加权（W），其中转换为 W=10，颠酸变异具有较高的权重分配（Ginja et al. 2009; Li et a传的研究报道（Li et al. 2007），牦牛 Y-STR 标记根不同的权重分配。A 检测 DNA 经 1.5%的琼脂糖凝胶电泳检测，结果如图 2无降解和蛋白污染现象，可开展后续 PCR 扩增实
31图 2-2 牦牛 5 个 Y-SNPs 标记中 10 个 SNPs 位点的测序峰图。图中 g～j 为本研究在 OFD1Y1标记上新发现的 4 个 SNPs 位点测序峰图Figure 2-2 The sequencing maps of the five yak Y-SNPs markers having 10 SNPs. The four newSNPs found in OFD1Y10 marker in this study were showed in figures g, h, i and j.(i) OFD1Y10（g. 608G>T）(j) OFD1Y10（g. 653G>C）
【参考文献】：
期刊论文
[1]绵羊Y染色体特异性引物及SNPs的筛选[J]. 曹学涛,裴生伟,张晋,李发弟,李刚,李万宏,乐祥鹏. 中国农业科学. 2018(15)
[2]基于mtDNA D-loop序列分析探究青海雪多牦牛的遗传多样性及母系遗传背景[J]. 李瑞哲,马志杰,陈生梅,孙永刚,官却扎西,陈永伟,徐惊涛. 青海畜牧兽医杂志. 2018(02)
[3]牦牛DGAT1基因多态性及其与乳质性状关联分析[J]. 高小莉,胡江,郭淑珍,石斌刚,谢建鹏,罗玉柱,王继卿,牟永娟. 中国农业科学. 2017(16)
[4]表皮生长因子对牦牛卵丘细胞低氧诱导因子-1α表达的影响及与凋亡的关联性分析[J]. 张译夫,潘阳阳,温泽星,余四九. 畜牧兽医学报. 2016(06)
[5]中甸牦牛mtDNA D-Loop区遗传多样性及系统进化分析[J]. 涂世英,汪琦,柴志欣,钟金城. 中国草食动物科学. 2016(03)
[6]牦牛Y染色体分子遗传学研究进展[J]. 马志杰. 中国农业大学学报. 2016(02)
[7]西藏牦牛遗传多样性的ISSR分析[J]. 姚慧,钟金城,姬秋梅,张成福,信金伟,陈智华,柴志欣. 生态学杂志. 2015(11)
[8]四川省不同类群牦牛遗传进化树构建[J]. 官久强,谢荣清,高晓云,侯定超,刘曦,吴伟生,安添午,蒋小兵,罗晓林. 畜牧与兽医. 2015(09)
[9]牦牛Ihh基因组织表达分析、SNP检测及其基因型组合与生产性状的关联分析[J]. 李天科,赵娟花,裴杰,梁春年,郭宪,秦文,阎萍. 畜牧兽医学报. 2015(01)
[10]西藏牦牛线粒体DNA的遗传多样性及系统进化分析[J]. 宋乔乔,钟金城,张成福,信金伟,姬秋梅,柴志欣. 兽类学报. 2014(04)
硕士论文
[1]牦牛基因组微卫星挖掘与筛选验证[D]. 赵芳芳.西南科技大学 2015
[2]水牛、牦牛及马Y染色体分子遗传多样性研究[D]. 张钦.西北农林科技大学 2015
[3]牦牛和普通牛基因组的密码子使用分析[D]. 宋乔乔.西南民族大学 2015
[4]昌台牦牛遗传多样性蛋白和基因水平的研究[D]. 高杰.西南民族大学 2014
[5]牦牛角性状候选基因关联分析及CART基因多态性研究[D]. 刘建.中国农业科学院 2013
[6]牦牛ANK1基因多态性与胴体和肉质性状关联分析[D]. 陈海青.甘肃农业大学 2013
[7]牦牛A-FABP、H-FABP基因多态性及与胴体和肉质性状关联性分析[D]. 曹健.甘肃农业大学 2012
[8]天祝白牦牛FSH、FSHR基因多态性分析与双胎性状的关联研究[D]. 邢耀潭.甘肃农业大学 2011
[9]牦牛OB基因和SCD1基因SNPs与肌肉脂肪酸含量的关联性分析[D]. 刘自增.中国农业科学院 2011
[10]中国黄牛Y染色体微卫星和SNPs遗传多样性与起源研究[D]. 常振华.西北农林科技大学 2011
本文编号：3141849
本文链接：https://www.wllwen.com/shoufeilunwen/nykjbs/3141849.html
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