高覆盖度甲基化重测序解析巴马香猪组织和时序特异位点以及基因组全序列关联分析研究F2家系肌纤维性状的遗传机理
发布时间：2021-06-14 02:00
巴马香猪体型小、耐近交,是药理试验、疾病模型构建和异种器官移植的重要模型动物。DNA甲基化在基因的表达调控中发挥着重要作用,是当前的研究热点之一。至今,不同时序年龄巴马香猪不同组织的全基因组高分辨率甲基化研究还未见报道。本试验利用全基因组重亚硫酸盐测序技术研究1岁、4岁和9岁共三个年龄段巴马香猪公猪的睾丸和肌肉组织,首次以高覆盖度甲基化重测序系统地解析巴马香猪的组织特异和时序特异位点,绘制了巴马香猪睾丸和肌肉组织单碱基高分辨率全基因组甲基化图谱,探讨了DNA甲基化在巴马香猪繁殖功能衰退和肌肉衰老机制,为动物育种和人类医学研究提供重要的理论参考。结果表明,不同年龄段巴马香猪公猪不同组织的全基因组总体甲基化水平约为4.4%,甲基化主要发生在CG环境下,约占70%（mCG/CG）,平均占总甲基化水平的89.57%以上（mCG/mG）,mCG环境下各染色体的甲基化水平基本一致,CHG和CHH环境的甲基化水平与总体甲基化水平（mC）在不同染色体上的分布趋势一致;各染色体的甲基化水平与染色体长度基本呈反比。不同年龄段、不同组织巴马香猪基因功能区域全基因组甲基化模式相似,基因的内含子区和3’UTR区...
【文章来源】：江西农业大学江西省
【文章页数】：104 页
【学位级别】：博士
【部分图文】：
-1DNA甲基化示意图
图 1-1-2 甲基化转移酶家族[7]Fig 1.1.2 Members of the DNMT family.2.2.1 维持甲基化酶DNMT1 是在哺乳动物中含量最丰富、最早被发现并克隆（1988 年由 Bestor
图 1-2-1 不同年龄巴马香猪公猪照片Fig 1.2.1 Differents age of Bamaxiang boars因组 DNA 的提取及样品检测用标准酚-氯仿法提取睾丸组织和肌肉组织的基因组 DNA，将提取的 D
【参考文献】：
期刊论文
[1]从江香猪基因组甲基化修饰与体重之间的相关性研究[J]. 林如涛,冉雪琴,王嘉福. 中国畜牧兽医. 2015(04)
[2]柯乐猪血液基因组甲基化修饰与细胞因子水平的相关性[J]. 胡磐,冉雪琴,王嘉福. 贵州农业科学. 2015(04)
[3]肌纤维类型与生理代谢、生长性能及肉质的关系[J]. 张丽,孙宝忠. 肉类研究. 2013(08)
[4]牛肉解冻过程中蛋白质氧化效应分析[J]. 李银,孙红梅,张春晖,白跃宇,王振宇. 中国农业科学. 2013(07)
[5]DNA去甲基化机制的研究进展[J]. 曹领改,张旸,蓝兴国,李玉花. 现代生物医学进展. 2012(01)
[6]FAM105A通过caspase依赖性途径和Bcl-2家族诱导细胞凋亡[J]. 袁梦,赵永浩,王云姝,刘亦倩,张弦,许华曦,张云武. 厦门大学学报(自然科学版). 2011(06)
[7]长白猪×蓝塘猪及其杂种基因组甲基化片段克隆与分析[J]. 肖正中,刘小红,王翀,李加琪,莫德林,陈瑶生. 生物技术通报. 2011(04)
[8]全基因组关联研究现状[J]. 韩建文,张学军. 遗传. 2011(01)
[9]荣昌猪仔猪性别间DNA甲基化水平的差异研究[J]. 白小青,王金勇,陈英,潘红梅,刘文,李军峰. 中国畜牧杂志. 2010(13)
[10]不同动物部分组织基因组甲基化程度的差异分析[J]. 唐韶青,张沅,徐青,孙东晓,俞英. 农业生物技术学报. 2006(04)
博士论文
[1]京海黄鸡腿肌全基因组甲基化和转录组分析研究[D]. 薛倩.扬州大学 2017
[2]猪肌纤维和眼肌面积性状全基因组关联研究[D]. 郭云雁.山西农业大学 2015
[3]五指山近交系小型猪骨髓和脐带间充质干细胞的全基因组甲基化和转录组联合分析[D]. 吴添文.中国农业科学院 2014
[4]猪不同年龄段骨骼肌的差异甲基化组分析[D]. 楼平儿.四川农业大学 2013
[5]猪不同组织和不同品种肌肉组织基因组DNA甲基化分析[D]. 杨春.吉林大学 2011
[6]金华猪和长白猪肌纤维组成差异及ERK基因对肌纤维转化的影响研究[D]. 郭佳.浙江大学 2011
硕士论文
[1]大白猪及其与莱芜猪杂交一代肌肉组织DNA甲基化程度差异分析[D]. 邱峥艳.吉林大学 2013
[2]猪背部浅层和背部深层脂肪组织全基因组甲基化研究[D]. 张小丽.四川农业大学 2013
[3]仔猪睾丸组织DNA甲基化及印记基因表达的研究[D]. 杨思强.四川农业大学 2013
本文编号：3228821
【文章来源】：江西农业大学江西省
【文章页数】：104 页
【学位级别】：博士
【部分图文】：
-1DNA甲基化示意图
图 1-1-2 甲基化转移酶家族[7]Fig 1.1.2 Members of the DNMT family.2.2.1 维持甲基化酶DNMT1 是在哺乳动物中含量最丰富、最早被发现并克隆（1988 年由 Bestor
图 1-2-1 不同年龄巴马香猪公猪照片Fig 1.2.1 Differents age of Bamaxiang boars因组 DNA 的提取及样品检测用标准酚-氯仿法提取睾丸组织和肌肉组织的基因组 DNA，将提取的 D
【参考文献】：
期刊论文
[1]从江香猪基因组甲基化修饰与体重之间的相关性研究[J]. 林如涛,冉雪琴,王嘉福. 中国畜牧兽医. 2015(04)
[2]柯乐猪血液基因组甲基化修饰与细胞因子水平的相关性[J]. 胡磐,冉雪琴,王嘉福. 贵州农业科学. 2015(04)
[3]肌纤维类型与生理代谢、生长性能及肉质的关系[J]. 张丽,孙宝忠. 肉类研究. 2013(08)
[4]牛肉解冻过程中蛋白质氧化效应分析[J]. 李银,孙红梅,张春晖,白跃宇,王振宇. 中国农业科学. 2013(07)
[5]DNA去甲基化机制的研究进展[J]. 曹领改,张旸,蓝兴国,李玉花. 现代生物医学进展. 2012(01)
[6]FAM105A通过caspase依赖性途径和Bcl-2家族诱导细胞凋亡[J]. 袁梦,赵永浩,王云姝,刘亦倩,张弦,许华曦,张云武. 厦门大学学报(自然科学版). 2011(06)
[7]长白猪×蓝塘猪及其杂种基因组甲基化片段克隆与分析[J]. 肖正中,刘小红,王翀,李加琪,莫德林,陈瑶生. 生物技术通报. 2011(04)
[8]全基因组关联研究现状[J]. 韩建文,张学军. 遗传. 2011(01)
[9]荣昌猪仔猪性别间DNA甲基化水平的差异研究[J]. 白小青,王金勇,陈英,潘红梅,刘文,李军峰. 中国畜牧杂志. 2010(13)
[10]不同动物部分组织基因组甲基化程度的差异分析[J]. 唐韶青,张沅,徐青,孙东晓,俞英. 农业生物技术学报. 2006(04)
博士论文
[1]京海黄鸡腿肌全基因组甲基化和转录组分析研究[D]. 薛倩.扬州大学 2017
[2]猪肌纤维和眼肌面积性状全基因组关联研究[D]. 郭云雁.山西农业大学 2015
[3]五指山近交系小型猪骨髓和脐带间充质干细胞的全基因组甲基化和转录组联合分析[D]. 吴添文.中国农业科学院 2014
[4]猪不同年龄段骨骼肌的差异甲基化组分析[D]. 楼平儿.四川农业大学 2013
[5]猪不同组织和不同品种肌肉组织基因组DNA甲基化分析[D]. 杨春.吉林大学 2011
[6]金华猪和长白猪肌纤维组成差异及ERK基因对肌纤维转化的影响研究[D]. 郭佳.浙江大学 2011
硕士论文
[1]大白猪及其与莱芜猪杂交一代肌肉组织DNA甲基化程度差异分析[D]. 邱峥艳.吉林大学 2013
[2]猪背部浅层和背部深层脂肪组织全基因组甲基化研究[D]. 张小丽.四川农业大学 2013
[3]仔猪睾丸组织DNA甲基化及印记基因表达的研究[D]. 杨思强.四川农业大学 2013
本文编号：3228821
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