猪采食行为、饲料转化效率及繁殖障碍研究：表型精准测定及遗传机制解析
发布时间：2021-08-08 10:46
第一部分:近年来,繁殖障碍已逐渐成为规模化猪场中影响母猪淘汰的最重要原因,在实际生产中大约有10%的母猪因不发情或者晚发情等繁殖障碍因素被淘汰,不仅消耗大量的饲料费用及饲养猪舍,同时也耗费饲养人员大量人力精力,显著地影响猪的生产效益,因此对母猪的繁殖障碍进行遗传解析并将其应用于育种选择具有重要的意义。本研究以白色杜洛克×二花脸F2资源群体为对象,使用Illumina 60K芯片进行基因型检测,开展繁殖障碍的初步遗传解析。在此基础上,将19头祖代F0个体进行深度重测序,并使用Imputation填充技术将416头F2个体60,000个标记基因型填充到了基因组全序列,然后分析繁殖障碍表型与基因组全序列的关联性,以挖掘与繁殖障碍极显著关联的分子标记。结果显示,从60K数据填充到基因组全序列的平均准确性为0.94,证明基因型填充策略的有效性和准确性;基因组全序列关联分析结果在7号染色体的33.36Mb处鉴别到与繁殖障碍显著关联的SNP标记（rs335782084:显著性p值达到了1.52E-11）,该位点可以解释16%的表型变异,通过LOD下降2的策略在该位点附近检测到一个置信区间为5.25M...
【文章来源】：江西农业大学江西省
【文章页数】：123 页
【学位级别】：博士
【部分图文】：
人类基因组测序成本逐年的变化趋势（引用自https://www.genome.gov/images/content/costpergenome_2017.jpg）
图 2-1 Imputation 准确性分析。X 轴代表的是染色体号，Y 轴代表的是准确性。re 2-1 Investigation of accuracy of Imputation. The X-axis represents chromosomes and the Yrepresents accuracy of imputation.表 2-2 每条染色体 SNP 标记数量的统计
全基因组关联分析的曼哈顿图。X 轴代表的是染色体，Y 轴代表的是 P 值，水平的是显著性阈值，红色的点代表的是与繁殖障碍显著关联的位点。re 2-2 Manhattan plot of association results. The X-axis means genome wide chromosoms means -log(P-value); the horizontal line in the graph is genome-wise significant level;points mean significant loci associated with failing to display estrus.
【参考文献】：
期刊论文
[1]猪饲料成本的影响因素及控制措施[J]. 张长春. 现代畜牧科技. 2016(09)
[2]影响肉猪料肉比的因素[J]. 苏信锋. 中国畜牧兽医文摘. 2016(06)
[3]猪育种技术的发展与展望[J]. 王越,罗嘉,娄鹏博,母治平,李学伟. 猪业科学. 2014(10)
[4]影响肉猪料肉比的因素[J]. 卫金良,赵晓明,沈荣林. 上海畜牧兽医通讯. 2014(05)
[5]生产性能测定站对生长猪应激水平和采食行为的影响[J]. 于世征,郝月,顾宪红. 畜牧兽医学报. 2013(09)
[6]母猪初情期全基因组关联分析和位置候选基因研究[J]. 李平华,李杰,杨竹青,张志燕,杨斌,陈从英. 中国农业科学. 2012(19)
[7]运用美国奥斯本自动饲喂系统对不同性别金华猪进行生长及胴体性能测定[J]. 楼平儿,廖东,严卫明,刘恒星,卢玲芳. 养猪. 2011(05)
[8]影响肉猪料肉比的因素[J]. 于洪芳. 畜牧兽医科技信息. 2011(07)
[9]用Excel建立Logistic模型方法探讨[J]. 宫锡鸿,孙乃军,赵飞,宋友玉,张翠玲,李登云. 中国植保导刊. 2011(06)
[10]基于Logistic与Gompertz非线性模型的野牛草克隆生长模拟与分析[J]. 钱永强,孙振元,韩蕾,巨关升. 中国农业科学. 2011(11)
硕士论文
[1]大白猪采食行为与生长规律研究[D]. 陶文欢.河北农业大学 2015
[2]不同品种猪饲料利用率与生长性状测定及表型相关分析和候选miRNA鉴定[D]. 廖明星.华中农业大学 2013
本文编号：3329819
【文章来源】：江西农业大学江西省
【文章页数】：123 页
【学位级别】：博士
【部分图文】：
人类基因组测序成本逐年的变化趋势（引用自https://www.genome.gov/images/content/costpergenome_2017.jpg）
图 2-1 Imputation 准确性分析。X 轴代表的是染色体号，Y 轴代表的是准确性。re 2-1 Investigation of accuracy of Imputation. The X-axis represents chromosomes and the Yrepresents accuracy of imputation.表 2-2 每条染色体 SNP 标记数量的统计
全基因组关联分析的曼哈顿图。X 轴代表的是染色体，Y 轴代表的是 P 值，水平的是显著性阈值，红色的点代表的是与繁殖障碍显著关联的位点。re 2-2 Manhattan plot of association results. The X-axis means genome wide chromosoms means -log(P-value); the horizontal line in the graph is genome-wise significant level;points mean significant loci associated with failing to display estrus.
【参考文献】：
期刊论文
[1]猪饲料成本的影响因素及控制措施[J]. 张长春. 现代畜牧科技. 2016(09)
[2]影响肉猪料肉比的因素[J]. 苏信锋. 中国畜牧兽医文摘. 2016(06)
[3]猪育种技术的发展与展望[J]. 王越,罗嘉,娄鹏博,母治平,李学伟. 猪业科学. 2014(10)
[4]影响肉猪料肉比的因素[J]. 卫金良,赵晓明,沈荣林. 上海畜牧兽医通讯. 2014(05)
[5]生产性能测定站对生长猪应激水平和采食行为的影响[J]. 于世征,郝月,顾宪红. 畜牧兽医学报. 2013(09)
[6]母猪初情期全基因组关联分析和位置候选基因研究[J]. 李平华,李杰,杨竹青,张志燕,杨斌,陈从英. 中国农业科学. 2012(19)
[7]运用美国奥斯本自动饲喂系统对不同性别金华猪进行生长及胴体性能测定[J]. 楼平儿,廖东,严卫明,刘恒星,卢玲芳. 养猪. 2011(05)
[8]影响肉猪料肉比的因素[J]. 于洪芳. 畜牧兽医科技信息. 2011(07)
[9]用Excel建立Logistic模型方法探讨[J]. 宫锡鸿,孙乃军,赵飞,宋友玉,张翠玲,李登云. 中国植保导刊. 2011(06)
[10]基于Logistic与Gompertz非线性模型的野牛草克隆生长模拟与分析[J]. 钱永强,孙振元,韩蕾,巨关升. 中国农业科学. 2011(11)
硕士论文
[1]大白猪采食行为与生长规律研究[D]. 陶文欢.河北农业大学 2015
[2]不同品种猪饲料利用率与生长性状测定及表型相关分析和候选miRNA鉴定[D]. 廖明星.华中农业大学 2013
本文编号：3329819
本文链接：https://www.wllwen.com/shoufeilunwen/nykjbs/3329819.html
