大豆抗大豆疫霉根腐病基因定位及候选基因分析
发布时间：2021-08-13 04:37
大豆疫霉根腐病（Phytophthora root rot of soybean）是由土传卵菌大豆疫霉菌（Phytophthorasojae Kaufmann&Gerdemann P.sojae）侵染引起的大豆病害。该病害可在大豆各个生育期发生,造成大豆严重减产,利用抗耐病品种是目前最经济有效的措施。抗源筛选是获得优异抗病种质最主要的方式,而抗病基因的挖掘是研究大豆抗性分子机制的主要途径。本研究分析了 337份江淮大豆育种种质对3个毒力不同的大豆疫霉菌株的抗性反应,并结合SNPLDBs和SNP标记关联定位该群体的抗病位点;利用蒙8206和临蒙6-46衍生的次级群体进行抗病基因的遗传分析,结合SSR标记连锁定位;对可能参与抗病通路的基因进行克隆和初步的生物信息学分析。这些结果将有助于深入研究大豆对大豆疫霉根腐病抗性的遗传机制和分子机理,也有助于分子标记辅助选择育种。1.江淮大豆育种种质群体抗大豆疫霉根腐病的抗性鉴定利用下胚轴创伤接种法鉴定337份江淮大豆种质对3个毒力不同的大豆疫霉菌株HeN08-35（3a,3c,4,5,6,7）、AH（2,3a,3b,4,5）、PNJ1（1d,...
【文章来源】：南京农业大学江苏省 211工程院校 教育部直属院校
【文章页数】：120 页
【学位级别】：博士
【部分图文】：
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称为Ｍ．??ＳＮＰＬＤＢ?（Ｍｕｌｔｉｐｌｅ?ＳＮＰｓ），区块内ＳＮＰ个数２－７９不等，在２０条染色体上的分布变??幅为２２２－６１３个；另外８９２５个是只含有单个ＳＮＰ的ＳＮＰＬＤＢｓ，因为这部分标记在??２００ｋｂ区间内与其它标记不存在较强连锁不平衡，称为Ｓ．?ＳＮＰＬＤＢ?（Ｓｉｎｇｌｅ?ＳＮＰ），在??２０条染色体上的分布变幅为３０５－７０６个（表２－２）。??．?１?２?３?４?５?６?７?Ｓ?９?ＪＯ??－?，?Ｋ??（Ａ）?（Ｂ）??厂．。??（ｃ）??图２－２种质群体结构分析??Ｆｉｇ．?２－２?Ｐｏｐｕｌａｔｉｏｎ?ｓｔｒｕｃｔｕｒｅ?ａｎａｌｙｓｉｓ?ｉｎ?ｓｏｙｂｅａｎ．??注：Ａ．邻接进化树分析；Ｂ．最佳Ｋ值分析，红色线指ＡＫ的变化，蓝色线指ＬｎＰ?（Ｋ）的变化；Ｃ．?３个亚群结??构分析。红色指第一亚群，绿色指第二亚群，蓝色指第三亚群。??Ｎｏｔｅ：?Ａ．?Ｎｅｉｇｈｂｏｒ－ｊｏｉｎｉｎｇ?ｔｒｅｅ；?Ｂ．?Ｔｒｕｅ?Ｋ?ｗａｓ?ａｎａｌｙｚｅｄ?ｆｏｒ?ｐｏｐｕｌａｔｉｏｎ．?Ｒｅｄ?ｌｉｎｅ?ｉｎｆｅｒ?ｔｏ?ｃｈａｎｇｅ?ｏｆ?ＡＫ，?ｂｌｕｅ?ｌｉｎｅ?ｉｎｆｅｒ?ｔｏ??ｃｈａｎｇｅ?ｏｆ?ＬｎＰ?（Ｋ）?；?Ｃ．?Ｐｏｐｕｌａｔｉｏｎ?ｓｔｒｕｃｔｕｒｅ?ａｎａｌｙｓｉｓ．?Ｔｈｅ?ｓｕｂｇｒｏｕｐｌ?ｓｈｏｗｓ?ｉｎ?ｒｅｄ，?ｓｕｂｇｒｏｕｐ２?ｓｈｏｗｓ?ｉｎ?ｇｒｅｅｎ，?ｓｕｂｇｒｏｕｐ３??ｓｈｏｗｓ?ｉｎ?ｂｌｕｅ．??２６??
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【参考文献】：
期刊论文
[1]黄淮海地区大豆主栽品种对8个大豆疫霉菌株的抗性评价[J]. 李晓那,孙石,钟超,韩天富. 作物学报. 2017(12)
[2]大豆组成型三重反应基因GmCTR1的克隆与功能分析[J]. 张楠楠,薛冬,崔晓霞,赵晋铭,郭娜,王海棠,邢邯. 中国农业科学. 2017(16)
[3]大豆疫霉根腐病的综合防治措施[J]. 蔡莹莹,宫千淳,屈晓泽. 生物化工. 2017(03)
[4]亮盾种衣剂包衣对防治大豆疫霉根腐病的效果分析[J]. 冯涛,谢丽华,陈明丽,高虹. 现代化农业. 2017(05)
[5]四川大豆疫霉毒力鉴定及资源抗性分析[J]. 陈四维,张婷婷,肖丽,武晓玲,杨文钰. 中国油料作物学报. 2016(04)
[6]大豆品种郑97196对疫霉根腐病的抗性遗传分析及基因定位[J]. 张海鹏,郭娜,牛景萍,黄婧,彭洋,王海棠,赵晋铭,邢邯. 大豆科学. 2016(03)
[7]植物关联分析方法的研究进展[J]. 冯建英,温阳俊,张瑾,章元明. 作物学报. 2016(07)
[8]三江平原主栽大豆品种对大豆疫霉根腐病的抗性分析[J]. 杨晓贺,顾鑫,于铭,赵海红,姚亮亮,刘伟,申宏波,丁俊杰. 大豆科学. 2016(02)
[9]华南大豆种质对疫霉根腐病的抗性分析[J]. 程艳波,马启彬,牟英辉,谭志远,吴鸿,年海. 中国农业科学. 2015(12)
[10]野生大豆资源对大豆疫病抗病性和耐病性鉴定[J]. 钟超,李银萍,孙素丽,刘章雄,邱丽娟,朱振东. 植物遗传资源学报. 2015(04)
博士论文
[1]大豆对大豆疫霉根腐病抗性基因和QTL的定位[D]. 黄婧.南京农业大学 2015
[2]大豆疫霉根腐病抗源筛选及抗性基因定位[D]. 孙聚涛.南京农业大学 2014
[3]大豆疫霉根腐病抗性评价、基因定位及抗性相关基因的筛选[D]. 武晓玲.南京农业大学 2009
[4]大豆疫霉根腐病抗性的遗传分析及基因定位的初步研究[D]. 孙石.南京农业大学 2008
本文编号：3339758
【文章来源】：南京农业大学江苏省 211工程院校 教育部直属院校
【文章页数】：120 页
【学位级别】：博士
【部分图文】：
图１－２中国已发现大豆疫霉的地区??Ｆｉｇ．?１－２?Ｔｈｅ?ｄｉｓｔｒｉｂｕｔｉｏｎ?ｒｅｇｉｏｎｓ?ｏｆ?Ｐ．?ｓｏｊａｅ?ｉｎ?Ｃｈｉｎａ??ｉｆ：ＩｉＫｉＭ???
称为Ｍ．??ＳＮＰＬＤＢ?（Ｍｕｌｔｉｐｌｅ?ＳＮＰｓ），区块内ＳＮＰ个数２－７９不等，在２０条染色体上的分布变??幅为２２２－６１３个；另外８９２５个是只含有单个ＳＮＰ的ＳＮＰＬＤＢｓ，因为这部分标记在??２００ｋｂ区间内与其它标记不存在较强连锁不平衡，称为Ｓ．?ＳＮＰＬＤＢ?（Ｓｉｎｇｌｅ?ＳＮＰ），在??２０条染色体上的分布变幅为３０５－７０６个（表２－２）。??．?１?２?３?４?５?６?７?Ｓ?９?ＪＯ??－?，?Ｋ??（Ａ）?（Ｂ）??厂．。??（ｃ）??图２－２种质群体结构分析??Ｆｉｇ．?２－２?Ｐｏｐｕｌａｔｉｏｎ?ｓｔｒｕｃｔｕｒｅ?ａｎａｌｙｓｉｓ?ｉｎ?ｓｏｙｂｅａｎ．??注：Ａ．邻接进化树分析；Ｂ．最佳Ｋ值分析，红色线指ＡＫ的变化，蓝色线指ＬｎＰ?（Ｋ）的变化；Ｃ．?３个亚群结??构分析。红色指第一亚群，绿色指第二亚群，蓝色指第三亚群。??Ｎｏｔｅ：?Ａ．?Ｎｅｉｇｈｂｏｒ－ｊｏｉｎｉｎｇ?ｔｒｅｅ；?Ｂ．?Ｔｒｕｅ?Ｋ?ｗａｓ?ａｎａｌｙｚｅｄ?ｆｏｒ?ｐｏｐｕｌａｔｉｏｎ．?Ｒｅｄ?ｌｉｎｅ?ｉｎｆｅｒ?ｔｏ?ｃｈａｎｇｅ?ｏｆ?ＡＫ，?ｂｌｕｅ?ｌｉｎｅ?ｉｎｆｅｒ?ｔｏ??ｃｈａｎｇｅ?ｏｆ?ＬｎＰ?（Ｋ）?；?Ｃ．?Ｐｏｐｕｌａｔｉｏｎ?ｓｔｒｕｃｔｕｒｅ?ａｎａｌｙｓｉｓ．?Ｔｈｅ?ｓｕｂｇｒｏｕｐｌ?ｓｈｏｗｓ?ｉｎ?ｒｅｄ，?ｓｕｂｇｒｏｕｐ２?ｓｈｏｗｓ?ｉｎ?ｇｒｅｅｎ，?ｓｕｂｇｒｏｕｐ３??ｓｈｏｗｓ?ｉｎ?ｂｌｕｅ．??２６??
?第二章江淮大豆育种种质群体抗大豆疫霉根腐病的抗性鉴定及抗病位点关联定位???１／６０８６２即－ｌｏｇ１０Ｐ?＞?４．７８的ＳＮＰ标记记为显著关联标记，分析后在１号染色体上鉴定??到符合条件的ＳＮＰ有２６个，表型变异解释率为６．１４％－１１．１８％?（表２－４，图２－７），与??ＲＴＭ－ＧＷＡＳ定位到的表型变异解释率最高的抗病位点〇＾＿１＿４４２８８１３２＿４４４８６１０４重??叠，说明这个区间与疫霉根腐病抗性相关。??６?ＧＬＭ??３?５?ＭＬＭ??ｌｉ；＾??￣Ｉ?Ｉ?Ｉ?Ｉ?Ｉ?Ｉ?Ｉ￣??０?１?２?３?４?５?６??Ｅｘｐｅｃｔｅｄ?－ｌｏｇ１０（ｐ）??图２－６两种模型下关联分析的Ｑｕａｎｔｉｌｅ－Ｑｕａｎｔｉｌｅ图??Ｆｉｇ．?２－６?Ｑｕａｎｔｉｌｅ－Ｑｕａｎｔｉｌｅ?ｐｌｏｔｓ?ｗｅｒｅ?ｅｓｔｉｍａｔｅｄ?ｂｙ?－ｌｏｇｉｏＰ?ｕｓｉｎｇ?ｔｗｏ?ｍｏｄｅｌｓ??表２－４通过关联分析鉴定出的与大豆疫霉根腐病显著相关的ＳＮＰ标记??Ｔａｂｌｅ?２－４?Ｉｄｅｎｔｉｆｉｅｄ?ＳＮＰｓ?ａｂｏｕｔ?Ｒ?ｓｏｊａｅ?ｒｅｓｉｓｔａｎｃｅ?ｔｒａｉｔｓ?ｂｙ?ＧＷＡＳ??§ｉａ?ＦＩ?对数值?表型解释率??ＳＮＰ?Ｐ?－ｌ〇ｇｉ〇Ｐ?Ｒ２?（％）??Ｇｍ０１＿４４４１４４５３?２．４８Ｅ－０９?８＾６１?１１．１８??Ｇｍ０１＿４４４５７９０９?２．５０Ｅ－０８?７．６０?９．７０??Ｇｍ０１＿４４４５８１２１?２．５０Ｅ－０８?７．６０?９．７０??ＧｍＯｌ—４４４３６４５５?３．７６Ｅ－０８?７．４２?９．４
【参考文献】：
期刊论文
[1]黄淮海地区大豆主栽品种对8个大豆疫霉菌株的抗性评价[J]. 李晓那,孙石,钟超,韩天富. 作物学报. 2017(12)
[2]大豆组成型三重反应基因GmCTR1的克隆与功能分析[J]. 张楠楠,薛冬,崔晓霞,赵晋铭,郭娜,王海棠,邢邯. 中国农业科学. 2017(16)
[3]大豆疫霉根腐病的综合防治措施[J]. 蔡莹莹,宫千淳,屈晓泽. 生物化工. 2017(03)
[4]亮盾种衣剂包衣对防治大豆疫霉根腐病的效果分析[J]. 冯涛,谢丽华,陈明丽,高虹. 现代化农业. 2017(05)
[5]四川大豆疫霉毒力鉴定及资源抗性分析[J]. 陈四维,张婷婷,肖丽,武晓玲,杨文钰. 中国油料作物学报. 2016(04)
[6]大豆品种郑97196对疫霉根腐病的抗性遗传分析及基因定位[J]. 张海鹏,郭娜,牛景萍,黄婧,彭洋,王海棠,赵晋铭,邢邯. 大豆科学. 2016(03)
[7]植物关联分析方法的研究进展[J]. 冯建英,温阳俊,张瑾,章元明. 作物学报. 2016(07)
[8]三江平原主栽大豆品种对大豆疫霉根腐病的抗性分析[J]. 杨晓贺,顾鑫,于铭,赵海红,姚亮亮,刘伟,申宏波,丁俊杰. 大豆科学. 2016(02)
[9]华南大豆种质对疫霉根腐病的抗性分析[J]. 程艳波,马启彬,牟英辉,谭志远,吴鸿,年海. 中国农业科学. 2015(12)
[10]野生大豆资源对大豆疫病抗病性和耐病性鉴定[J]. 钟超,李银萍,孙素丽,刘章雄,邱丽娟,朱振东. 植物遗传资源学报. 2015(04)
博士论文
[1]大豆对大豆疫霉根腐病抗性基因和QTL的定位[D]. 黄婧.南京农业大学 2015
[2]大豆疫霉根腐病抗源筛选及抗性基因定位[D]. 孙聚涛.南京农业大学 2014
[3]大豆疫霉根腐病抗性评价、基因定位及抗性相关基因的筛选[D]. 武晓玲.南京农业大学 2009
[4]大豆疫霉根腐病抗性的遗传分析及基因定位的初步研究[D]. 孙石.南京农业大学 2008
本文编号：3339758
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