半滑舌鳎抗哈维氏弧菌病相关QTL定位及免疫相关基因筛选和功能分析
发布时间：2021-12-30 05:14
鲆鲽鱼类在形态学分类上隶属鲽形目。其中,半滑舌鳎是我国特有的,温水性近海营底栖生活的海水鱼类,主要分布于我国渤海、黄海等沿海地区,在我国具有极高经济价值和较高的科学研究价值。为了更好的适应底栖生活方式,半滑舌鳎进化发展成为一种具有内脏小,运动少,生长快,占用较少的水体生活空间等生物学特性的鲆鲽鱼类,加之其肉味鲜美,口感爽滑,蛋白质含量高,营养丰富,市场价格高,经济效益好等特点,深受广大海水养殖者的喜爱,成为我国海水养殖的重要经济鱼类。哈维氏弧菌是半滑舌鳎养殖过程中细菌病的主要病原之一,严重影响了半滑舌鳎的经济价值并阻碍了半滑舌鳎养殖业的发展。本论文主要通过对半滑舌鳎抗哈维氏弧菌病相关基因座进行定位,对免疫相关基因进行初步筛选及对免疫相关基因进行初步功能研究,以期为解析半滑舌鳎抗病机制提供研究基础。1.半滑舌鳎抗哈维氏弧菌病QTL定位及抗病免疫相关基因筛选为了方便筛选到与抗病免疫相关的候选基因,在实验室之前的研究基础上,对17号染色体（LG18连锁群）已经定位到的抗哈维氏弧菌病相关区间qE进行加密,在半滑舌鳎加密后的整合（LG18）、雌性（LG18F）、雄性（LG18M）连锁群上定位到1...
【文章来源】：南京农业大学江苏省 211工程院校 教育部直属院校
【文章页数】：186 页
【学位级别】：博士
【部分图文】：
图１－１技术路线??Ｆｉｇ．?１－１?Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ?ｒｏａｄｍａｐ??
?第二章半滑舌鳎抗哈维氏弧菌病ＱＴＬ定位及抗病免疫相关基因筛选???１００个微卫星标记（ＳＳＲ）位点并设计了引物进行基因分型，其中有３３个标记统??计得到基因分型结果，分别得到整合图谱（ＬＧ１８）、雌性图谱（ＬＧ１８Ｆ）和雄性??图谱（ＬＧ１８Ｍ），如图２－１和表２－２所示。??ＬＧ１８?ＬＧ１８Ｆ?ＬＧ１８、Ｉ??＿?〇．〇—Ｐｌ—ｃｈｒｌ?７－１６－１７??Ｏ．Ｏ－Ｈ—ｃｈｒ１７－１２－１１９?〇．〇—Ｆ｜—ｃｈｒｌ?７－１２－１１９??２４．３?ａ?／－ｃｈｒｌ?７－９－５１??３４．９?Ａ?Ａ－ｃｈｒｌ?７－２４－７?■??３６．３?７ｒ?ｃｈｒｌ?７－２１－６７?Ｆ＿Ｆ，??ｑＫ－．５１６－４＾?１＾７－１８－７５?Ｋ＿，?Ｉ?■?，??ｑ?４４．９－＼１?ｆ／Ｃｈｒｌ７－１３－１０２?Ｍ?３２．８?／?ｃｈｒｌ７－１８－７５?■??４５．２?Ａｐ?ｒ?ｃｈｒｌ７－２０－２?．．?．．．?４６１?－Ａｌ?／ｒ?ｃｈｒｌ?７－２０－２?３３．８?ｃｈｒｌ７－１３－１０２??５０．２?ｃｈｒｌ?７－１７－１６?卟卜－５?５４?５?飞＼?厂?／ｆ?ｃｈｒｌ?７－１３＊３１?３５１?＾?ｃｈｒｌ?７－１７－４６??５２．０?Ａ１?ｃｈｒｌ７－１３－３１?６１?９?＂ｆｔ?ｆｔ?ｃｈｒｌ７－１６－２８?３７．２—二一?ｃｈｒｌ７－１３＾１０３??５３．６?ｃｈｒｌ７－１３－１０３?．?．?．６７?４＾?／ｆ?ｃｈｒｌ７－９－４０?３８．５?ｃｈｒｌ７－２０－２??５９．６＼?－?／ｃｈｒ１７－１６－２８?ｑｈ?６９．７?Ｗｒ?／！?ｃｈｒ１７－１７－１３１?４０．８?
图３－２半滑舌鳎必加５的基因组结构和可变剪切示意图??注：（Ａ）半滑舌鳎的基因组结构
【参考文献】：
期刊论文
[1]Performance Comparison of Two Efficient Genomic Selection Methods（gsbay & MixP ） Applied in Aquacultural Organisms[J]. SU Hailin,LI Hengde,WANG Shi,WANG Yangfan,BAO Zhenmin. Journal of Ocean University of China. 2017(01)
[2]半滑舌鳎抗哈维氏弧菌病相关微卫星标记筛选及QTL定位[J]. 戴欢,刘洋,王文文,位战飞,高进,高峰涛,李祥孔,刘洋,陈松林. 中国水产科学. 2017(01)
[3]中国大陆尼罗罗非鱼引进群体间遗传关系分析[J]. 唐首杰,杨洁,王成辉,李思发,赵金良. 水生生物学报. 2017(01)
[4]半滑舌鳎CD40基因克隆及其免疫功能分析[J]. 位战飞,郭华,李海龙,郑卫卫,王文文,戴欢,朱颖,刘洋,董忠典,陈松林. 中国水产科学. 2016(05)
[5]野生亚东鲑群体遗传多样性及其种质来源研究[J]. 户国,王芳,周建设,潘瑛子,李宝海,谷伟,孙鹏,白庆利,王炳谦. 东北农业大学学报. 2016(01)
[6]半滑舌鳎体表溃疡病病原的分离鉴定[J]. 徐晓丽,邵蓬,李贺密,姚学良,郑艳坤,包海岩. 中国海洋大学学报(自然科学版). 2015(11)
[7]半滑舌鳎腐皮病病原分离鉴定及对中草药的敏感性实验（英文）[J]. 高桂生,张艳英,史秋梅,高光平,韩红升,黄晓媛,缴宝丰,常瑶瑶. Agricultural Science & Technology. 2015(10)
[8]牙鲆抗迟缓爱德华菌病家系建立与抗病性能评价[J]. 张英平,陈松林,孙何军,王磊,范彩霞,于洋,张文婷,杨英明,张永珍,田永胜,邓寒,陈红林,刘肖峰,吴娅红. 水产学报. 2014(11)
[9]半滑舌鳎性别特异微卫星标记的SCAR转化及其应用[J]. 刘洋,陈松林,高峰涛,孟亮,胡乔木,宋文涛,邵长伟,吕为群. 农业生物技术学报. 2014(06)
[10]我国高附加值海水养殖业经济分析——以半滑舌鳎为例[J]. 郭鸿鹄,杨正勇. 广东农业科学. 2013(10)
博士论文
[1]半滑舌鳎和牙鲆变态相关基因座定位及抗病性状的基因组选择[D]. 刘洋.南京农业大学 2017
[2]半滑舌鳎经济性状的遗传评估及基因组选择初步研究[D]. 刘峰.上海海洋大学 2015
硕士论文
[1]半滑舌鳎（Cynoglossus semilaevis）R-spondin2基因的分子克隆、表达模式及其在肌肉发育过程中功能的初步探究[D]. 杨芳.中国海洋大学 2015
[2]半滑舌鳎（Cynoglossus semilaevis）R-spondin1和R-spondin3基因的克隆与表达分析[D]. 刘田田.中国海洋大学 2015
本文编号：3557547
【文章来源】：南京农业大学江苏省 211工程院校 教育部直属院校
【文章页数】：186 页
【学位级别】：博士
【部分图文】：
图１－１技术路线??Ｆｉｇ．?１－１?Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ?ｒｏａｄｍａｐ??
?第二章半滑舌鳎抗哈维氏弧菌病ＱＴＬ定位及抗病免疫相关基因筛选???１００个微卫星标记（ＳＳＲ）位点并设计了引物进行基因分型，其中有３３个标记统??计得到基因分型结果，分别得到整合图谱（ＬＧ１８）、雌性图谱（ＬＧ１８Ｆ）和雄性??图谱（ＬＧ１８Ｍ），如图２－１和表２－２所示。??ＬＧ１８?ＬＧ１８Ｆ?ＬＧ１８、Ｉ??＿?〇．〇—Ｐｌ—ｃｈｒｌ?７－１６－１７??Ｏ．Ｏ－Ｈ—ｃｈｒ１７－１２－１１９?〇．〇—Ｆ｜—ｃｈｒｌ?７－１２－１１９??２４．３?ａ?／－ｃｈｒｌ?７－９－５１??３４．９?Ａ?Ａ－ｃｈｒｌ?７－２４－７?■??３６．３?７ｒ?ｃｈｒｌ?７－２１－６７?Ｆ＿Ｆ，??ｑＫ－．５１６－４＾?１＾７－１８－７５?Ｋ＿，?Ｉ?■?，??ｑ?４４．９－＼１?ｆ／Ｃｈｒｌ７－１３－１０２?Ｍ?３２．８?／?ｃｈｒｌ７－１８－７５?■??４５．２?Ａｐ?ｒ?ｃｈｒｌ７－２０－２?．．?．．．?４６１?－Ａｌ?／ｒ?ｃｈｒｌ?７－２０－２?３３．８?ｃｈｒｌ７－１３－１０２??５０．２?ｃｈｒｌ?７－１７－１６?卟卜－５?５４?５?飞＼?厂?／ｆ?ｃｈｒｌ?７－１３＊３１?３５１?＾?ｃｈｒｌ?７－１７－４６??５２．０?Ａ１?ｃｈｒｌ７－１３－３１?６１?９?＂ｆｔ?ｆｔ?ｃｈｒｌ７－１６－２８?３７．２—二一?ｃｈｒｌ７－１３＾１０３??５３．６?ｃｈｒｌ７－１３－１０３?．?．?．６７?４＾?／ｆ?ｃｈｒｌ７－９－４０?３８．５?ｃｈｒｌ７－２０－２??５９．６＼?－?／ｃｈｒ１７－１６－２８?ｑｈ?６９．７?Ｗｒ?／！?ｃｈｒ１７－１７－１３１?４０．８?
图３－２半滑舌鳎必加５的基因组结构和可变剪切示意图??注：（Ａ）半滑舌鳎的基因组结构
【参考文献】：
期刊论文
[1]Performance Comparison of Two Efficient Genomic Selection Methods（gsbay & MixP ） Applied in Aquacultural Organisms[J]. SU Hailin,LI Hengde,WANG Shi,WANG Yangfan,BAO Zhenmin. Journal of Ocean University of China. 2017(01)
[2]半滑舌鳎抗哈维氏弧菌病相关微卫星标记筛选及QTL定位[J]. 戴欢,刘洋,王文文,位战飞,高进,高峰涛,李祥孔,刘洋,陈松林. 中国水产科学. 2017(01)
[3]中国大陆尼罗罗非鱼引进群体间遗传关系分析[J]. 唐首杰,杨洁,王成辉,李思发,赵金良. 水生生物学报. 2017(01)
[4]半滑舌鳎CD40基因克隆及其免疫功能分析[J]. 位战飞,郭华,李海龙,郑卫卫,王文文,戴欢,朱颖,刘洋,董忠典,陈松林. 中国水产科学. 2016(05)
[5]野生亚东鲑群体遗传多样性及其种质来源研究[J]. 户国,王芳,周建设,潘瑛子,李宝海,谷伟,孙鹏,白庆利,王炳谦. 东北农业大学学报. 2016(01)
[6]半滑舌鳎体表溃疡病病原的分离鉴定[J]. 徐晓丽,邵蓬,李贺密,姚学良,郑艳坤,包海岩. 中国海洋大学学报(自然科学版). 2015(11)
[7]半滑舌鳎腐皮病病原分离鉴定及对中草药的敏感性实验（英文）[J]. 高桂生,张艳英,史秋梅,高光平,韩红升,黄晓媛,缴宝丰,常瑶瑶. Agricultural Science & Technology. 2015(10)
[8]牙鲆抗迟缓爱德华菌病家系建立与抗病性能评价[J]. 张英平,陈松林,孙何军,王磊,范彩霞,于洋,张文婷,杨英明,张永珍,田永胜,邓寒,陈红林,刘肖峰,吴娅红. 水产学报. 2014(11)
[9]半滑舌鳎性别特异微卫星标记的SCAR转化及其应用[J]. 刘洋,陈松林,高峰涛,孟亮,胡乔木,宋文涛,邵长伟,吕为群. 农业生物技术学报. 2014(06)
[10]我国高附加值海水养殖业经济分析——以半滑舌鳎为例[J]. 郭鸿鹄,杨正勇. 广东农业科学. 2013(10)
博士论文
[1]半滑舌鳎和牙鲆变态相关基因座定位及抗病性状的基因组选择[D]. 刘洋.南京农业大学 2017
[2]半滑舌鳎经济性状的遗传评估及基因组选择初步研究[D]. 刘峰.上海海洋大学 2015
硕士论文
[1]半滑舌鳎（Cynoglossus semilaevis）R-spondin2基因的分子克隆、表达模式及其在肌肉发育过程中功能的初步探究[D]. 杨芳.中国海洋大学 2015
[2]半滑舌鳎（Cynoglossus semilaevis）R-spondin1和R-spondin3基因的克隆与表达分析[D]. 刘田田.中国海洋大学 2015
本文编号：3557547
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