核盘菌两个新型RNA病毒基因组的分子生物学特性研究
发布时间：2022-01-09 18:26
核盘菌（Sclerotinia sclerotiorum（Lib.）de Bary）是一种危害严重的死体营养型病原真菌,它能够侵染并危害的植物达75科450多种,在世界范围内都有分布。从湖北、陕西、四川省各地的发病油菜植株采集的3,600多个菌核中分离获得3,000多株核盘菌菌株,其中自湖北荆门菌株JMTJ14及湖北荆州的菌株JZJL2为菌核缺陷型。本论文以此二菌株研究材料,以核盘菌菌株Ep-1PNA367及1980为参考菌株,对菌落形态、菌丝生长速度、菌丝干重、和致病力等生物学特性进行研究,发现它们在菌落形态、生长速率和致病力等方面不存在显著的差异,菌核形成相关基因与草酸降解相关基因间的表达等方面同样也不存在显著的差异。目前,在核盘菌中也发现许多真菌病毒,其中有部分弱毒相关病毒,使用弱毒相关病毒、拮抗和/或寄生微生物如盾壳霉生物防治由核盘菌引起病害是比较重要的方法。在本文的研究中,我们确定了菌株JMTJ14和JZJL2均携带有ds RNA片段,对存在的ds RNA片段进行了克隆研究。核盘菌菌株JMTJ14携带一种新的RNA病毒,命名为核盘菌Sclerotinia sclerotior...
【文章来源】：华中农业大学湖北省 211工程院校 教育部直属院校
【文章页数】：104 页
【学位级别】：博士
【文章目录】：
摘要
ABSTRACT
略缩词表
第一章 文献综述
1.1 核盘菌研究进展
1.1.1 核盘菌的生物学特性
1.1.2 核盘菌的寄主范围及其危害
1.1.3 核盘菌菌核的形成过程
1.1.4 核盘菌的生活史及病害循环
1.1.5 菌核病的防治
1.2 真菌病毒的研究进展
1.2.1 真菌病毒
1.2.2 真菌病毒的起源及进化
1.2.3 真菌病毒分类
1.2.4 真菌病毒的传播
1.2.5 真菌病毒与其寄主真菌的关系
1.2.6 真菌病毒在生物防治应用上的相关研究
1.3 本研究的目的意义
第二章 核盘菌菌核缺陷型菌株的筛选及其原因初探
2.1 引言
2.2 材料和方法
2.2.1 材料
2.2.2 核盘菌产菌核缺陷菌株的筛选
2.2.3 菌株JMTJ14 和JZJL2 酸性物质分泌能力检测
2.2.4 菌株JMTJ14 和JZJL2 的菌核形成相关基因的表达
2.2.5 菌株JMTJ14 和JZJL2 产生菌核能力
2.2.6 菌株 JMTJ14 和 JZJL2 核酸的提取
2.3 结果与分析
2.3.1 菌株的菌落形态及筛选
2.3.2 JMTJ14 和JZJL2 菌株的分类地位
2.3.3 菌株JMTJ14 和JZJL2 的酸性物质定性测定及草酸相关基因分析
2.3.4 核盘菌菌株JMTJ14 和JZJL2 的菌核形成相关基因分析
2.3.5 JMTJ14 和JZJL2 菌株菌核的诱导
2.3.6 菌株JMTJ14 和JZJL2 携带有dsRNA因子
2.4 结论与讨论
第三章 SsFV1 全长cDNA克隆及对菌株Ep-1PNA367 和1980的影响
3.1 引言
3.2 材料与方法
3.2.1 材料
3.2.2 菌株JMTJ14 中dsRNA因子的提取
3.2.3 dsRNA因子全长cDNA克隆
3.2.4 dsRNA因子全长cDNA序列的拼接及序列分析
3.2.5 dsRNA Northern杂交鉴定
3.2.6 JMTJ14 与Ep-1PNA367 和1980菌株的营养亲和性检测
3.2.7 菌株JMTJ14 中的dsRNA因子水平传播
3.2.8 菌株JMTJ14 中的dsRNA因子对核盘菌生物学特性的影响
3.2.9 基于基因表达水平的分析
3.3 结果与分析
3.3.1 dsRNA因子全长cDNA克隆策略及拼接
3.3.2 dsRNA因子cDNA全长序列同源性分析
3.3.3 JMTJ14 菌株中的SsFV1 Northern杂交验证
3.3.4 菌株JMTJ14 与Ep-1PNA367R和 1980R的营养亲和性检测
3.3.5 SsFV1 的水平传播
3.3.6 基于基因表达水平的差异显著基因筛选（DEGs）
3.4 结论与讨论
第四章 SsEV1 全长cDNA克隆分析及对菌株Ep-1PNA367 和1980的影响
4.1 引言
4.2 材料与方法
4.3 结果与分析
4.3.1 SsEV1 cDNA全长克隆
4.3.2 SsEV1 全长cDNA序列分析
4.3.3 菌株JZJL2 与Ep-1PNA367R和 1980R隶属于不同的营养亲和群
4.3.4 Ep-1PNA367R/SsEV1 和 1980R/SsEV1 的dsRNA鉴定
4.3.5 Ep-1PNA367R/SsEV1 和 1980R/SsEV1 菌株中SsEV1 的RT-PCR鉴定
4.3.6 SsEV1 对Ep-1PNA367R和 1980R的影响
4.4 结论与讨论
全文总结与展望
参考文献
致谢
攻读博士学位期间发表的学术论文
本文编号：3579224
【文章来源】：华中农业大学湖北省 211工程院校 教育部直属院校
【文章页数】：104 页
【学位级别】：博士
【文章目录】：
摘要
ABSTRACT
略缩词表
第一章 文献综述
1.1 核盘菌研究进展
1.1.1 核盘菌的生物学特性
1.1.2 核盘菌的寄主范围及其危害
1.1.3 核盘菌菌核的形成过程
1.1.4 核盘菌的生活史及病害循环
1.1.5 菌核病的防治
1.2 真菌病毒的研究进展
1.2.1 真菌病毒
1.2.2 真菌病毒的起源及进化
1.2.3 真菌病毒分类
1.2.4 真菌病毒的传播
1.2.5 真菌病毒与其寄主真菌的关系
1.2.6 真菌病毒在生物防治应用上的相关研究
1.3 本研究的目的意义
第二章 核盘菌菌核缺陷型菌株的筛选及其原因初探
2.1 引言
2.2 材料和方法
2.2.1 材料
2.2.2 核盘菌产菌核缺陷菌株的筛选
2.2.3 菌株JMTJ14 和JZJL2 酸性物质分泌能力检测
2.2.4 菌株JMTJ14 和JZJL2 的菌核形成相关基因的表达
2.2.5 菌株JMTJ14 和JZJL2 产生菌核能力
2.2.6 菌株 JMTJ14 和 JZJL2 核酸的提取
2.3 结果与分析
2.3.1 菌株的菌落形态及筛选
2.3.2 JMTJ14 和JZJL2 菌株的分类地位
2.3.3 菌株JMTJ14 和JZJL2 的酸性物质定性测定及草酸相关基因分析
2.3.4 核盘菌菌株JMTJ14 和JZJL2 的菌核形成相关基因分析
2.3.5 JMTJ14 和JZJL2 菌株菌核的诱导
2.3.6 菌株JMTJ14 和JZJL2 携带有dsRNA因子
2.4 结论与讨论
第三章 SsFV1 全长cDNA克隆及对菌株Ep-1PNA367 和1980的影响
3.1 引言
3.2 材料与方法
3.2.1 材料
3.2.2 菌株JMTJ14 中dsRNA因子的提取
3.2.3 dsRNA因子全长cDNA克隆
3.2.4 dsRNA因子全长cDNA序列的拼接及序列分析
3.2.5 dsRNA Northern杂交鉴定
3.2.6 JMTJ14 与Ep-1PNA367 和1980菌株的营养亲和性检测
3.2.7 菌株JMTJ14 中的dsRNA因子水平传播
3.2.8 菌株JMTJ14 中的dsRNA因子对核盘菌生物学特性的影响
3.2.9 基于基因表达水平的分析
3.3 结果与分析
3.3.1 dsRNA因子全长cDNA克隆策略及拼接
3.3.2 dsRNA因子cDNA全长序列同源性分析
3.3.3 JMTJ14 菌株中的SsFV1 Northern杂交验证
3.3.4 菌株JMTJ14 与Ep-1PNA367R和 1980R的营养亲和性检测
3.3.5 SsFV1 的水平传播
3.3.6 基于基因表达水平的差异显著基因筛选（DEGs）
3.4 结论与讨论
第四章 SsEV1 全长cDNA克隆分析及对菌株Ep-1PNA367 和1980的影响
4.1 引言
4.2 材料与方法
4.3 结果与分析
4.3.1 SsEV1 cDNA全长克隆
4.3.2 SsEV1 全长cDNA序列分析
4.3.3 菌株JZJL2 与Ep-1PNA367R和 1980R隶属于不同的营养亲和群
4.3.4 Ep-1PNA367R/SsEV1 和 1980R/SsEV1 的dsRNA鉴定
4.3.5 Ep-1PNA367R/SsEV1 和 1980R/SsEV1 菌株中SsEV1 的RT-PCR鉴定
4.3.6 SsEV1 对Ep-1PNA367R和 1980R的影响
4.4 结论与讨论
全文总结与展望
参考文献
致谢
攻读博士学位期间发表的学术论文
本文编号：3579224
本文链接：https://www.wllwen.com/shoufeilunwen/nykjbs/3579224.html
