miRNA、mRNA调控新疆褐牛和哈萨克牛肉质成脂性状分子机制研究
发布时间：2022-01-23 20:46
新疆褐牛与哈萨克牛同为新疆优良的地方品种,以哈萨克牛为母本,经过肉用方向培育的新品种新疆褐牛,其胴体品质和肉质特性得到明显改善。目前研究认为,影响新疆褐牛与哈萨克牛肉质性状系统差异以及分子机制,尚不清晰。本研究以新疆褐牛和哈萨克牛为研究对象,系统分析了两品种屠宰性能、胴体性状、肉质性状,研究两个品种间肉质性状的特征,同时运用转录组测序技术（RNA-Seq）对两个品种牛背最长肌组织mRNA与miRNA的表达情况进行研究,以期阐明鉴定出影响新疆褐牛与哈萨克牛肉质性状差异的功能基因与调控通路,本研究主要结果如下:（1）新疆褐牛与哈萨克牛肉质性状分析胴体指标测定结果表明,新疆褐牛大理石花纹（p<0.05）、背膘厚度（p<0.01）显著高于哈萨克牛,且眼肌面积平均比哈萨克牛提高1.8%,优质肉产量得到改善。肉质性状测定结果表明:新疆褐牛失水率、剪切力极显著低于哈萨克牛（p<0.01）,牛肉色泽和pH值方面两个品种间无显著差异（p>0.05）;营养品质指标测定结果表明:新疆褐牛背最长肌中水分（p<0.01）、脂肪含量（p<0.05）显著高于哈萨克牛,蛋白质含量极...
【文章来源】：甘肃农业大学甘肃省
【文章页数】：135 页
【学位级别】：博士
【部分图文】：
新疆褐牛与哈萨克牛牛背最长肌组织样本总RNA电泳胶图
图 3-1 新疆褐牛与哈萨克牛牛背最长肌组织样本总 RNA 电泳胶图Figure 3-1 Total RNA electrophoresis gel of the longissimus dorsi tissue samples of Xinjiang brown cattleand Kazakh cattle注：X1、X2、X3 为哈萨克牛背最长肌组织样本总 RNA 电泳图，Y1、Y2、Y3 为新疆褐牛背最长肌组织样本总 RNA 电泳图。
30甘肃农业大学 2019 届博士学位论文比对上参考基因组的 clean reads 比例 94.90% 94.32% 94.47% 94.44% 93.95% 94.15%唯一比对上参考基因组某一位置的clean reads 比例82.40% 81.78% 82.08% 83.19% 83.19% 83.23%3.3.3 基因表达分析测序饱和度分析可以在一定程度上判断测序数据量是否满足要求。随着测序量(Reads 数量)的增加，检测到的基因数也随之上升，当测序量达到一定区间后其检测到的基因数增长速度趋于平缓，表明所检测到的基因数趋于饱和，此时测序量结果达到要求。本试验中新疆褐牛与哈萨克牛各样本测序所检测到的基因数增长速度趋于平缓，基因数趋于饱和，其表达量达到要求，结果见图 3-3。
【参考文献】：
期刊论文
[1]传统风干牦牛肉加工过程中新鲜度的变化[J]. 宋艳艳,马纪兵,王惠惠,崔文斌,刘小波,张丽,余群力,魏晋梅,郭兆斌. 食品与发酵科技. 2019(01)
[2]BCG感染牛肺泡巨噬细胞的转录组测序和分析[J]. 徐金瑞,吕翠萍,杨易,周彦兵,骆佳,王玉炯. 吉林大学学报(医学版). 2019(01)
[3]牦牛肉牛瘤胃平滑肌肌原纤维蛋白特性及品质变化差异分析[J]. 刘慧,余群力,朱跃明,张文华,薄文喜,韩玲. 现代食品科技. 2019(02)
[4]排酸成熟时间对不同品种牛肉质影响的研究[J]. 闫向民,谢鹏贵,崔繁荣,叶治兵,李红波,李娜,袁理星,周振勇,张金山. 畜牧与兽医. 2018(12)
[5]两种冷却方式对宰后成熟过程中牛肉保水性的影响[J]. 惠小洋,余群力,曹晖,韩广星,吴磊,韩玲. 食品与发酵工业. 2018(11)
[6]牦牛骨骼肌、平滑肌和心肌氨基酸和脂肪酸组成分析及营养评价[J]. 李升升,余群力. 营养学报. 2018(02)
[7]CD46基因在新疆褐牛不同组织中的表达研究[J]. 木哈买提江·铁格斯,张慧敏,宋焕堂,加尔肯,苏战强,冉多良,刘建华. 中国畜牧兽医. 2017(06)
[8]‘西门塔尔杂交牛’与‘平凉红牛’不同部位肉品质分析[J]. 韩冬洁,余群力,韩玲,朱跃明,谢卿. 甘肃农业大学学报. 2016(05)
[9]新疆褐牛POU1F1基因PCR-RFLP分析[J]. 陈然,王传波,李春明,曹春娜,张烨辉. 新疆畜牧业. 2016(06)
[10]ADIG诱导牛成肌细胞转分化及相关基因的表达分析[J]. 梅楚刚,张琼,付常振,刘扬,姜碧杰,成功,昝林森. 畜牧兽医学报. 2016(04)
博士论文
[1]猪背最长肌肌内脂肪含量相关基因的筛选及表达分析[D]. 王昱丁.山东农业大学 2017
[2]1. MiR-133a，miR-1，miR-206诱导C2C12细胞成肌前体细胞及miR-133a靶基因Fox12鉴定的研究 2. IL-28B多态性位点及血清维生素D水平在HCV感染病人中的相关性分析研究[D]. 罗月球.浙江大学 2015
[3]秦川牛肌肉生长发育相关基因和蛋白质的筛选及其初步鉴定[D]. 贺花.西北农林科技大学 2014
[4]牛FABP4基因代谢功能研究及品种间脂肪细胞发育特性分析[D]. 魏胜娟.西北农林科技大学 2014
[5]肉牛脂肪组织和背最长肌脂代谢相关基因差异表达分析[D]. 戢爽.吉林大学 2013
[6]中国主要牛种肌肉组织基因表达谱特征比较分析[D]. 张莺莺.西北农林科技大学 2010
硕士论文
[1]我国牛病毒性腹泻病毒流行情况的Meta分析及感染BVDV的MDBK细胞转录组学分析[D]. 马莉莉.黑龙江八一农垦大学 2018
[2]隆林黄牛、荷斯坦牛和西林水牛的肉质、肌纤维和酶活性差异的研究[D]. 方程.广西大学 2018
[3]西门塔尔牛及杂种和牛两群体的肉质性状全基因组关联研究与选择信号分析[D]. 史新平.河北农业大学 2018
[4]云岭牛和文山牛背最长肌肉质特性及DNA甲基化分析[D]. 王文强.扬州大学 2017
[5]IRS-1通过miR-143调节前脂肪细胞分化的作用与机制研究[D]. 刘雅青.中南大学 2014
[6]新疆褐牛POU1F1基因第六外显子多态性及mRNA表达相关研究[D]. 刘磊.新疆农业大学 2008
本文编号：3605121
【文章来源】：甘肃农业大学甘肃省
【文章页数】：135 页
【学位级别】：博士
【部分图文】：
新疆褐牛与哈萨克牛牛背最长肌组织样本总RNA电泳胶图
图 3-1 新疆褐牛与哈萨克牛牛背最长肌组织样本总 RNA 电泳胶图Figure 3-1 Total RNA electrophoresis gel of the longissimus dorsi tissue samples of Xinjiang brown cattleand Kazakh cattle注：X1、X2、X3 为哈萨克牛背最长肌组织样本总 RNA 电泳图，Y1、Y2、Y3 为新疆褐牛背最长肌组织样本总 RNA 电泳图。
30甘肃农业大学 2019 届博士学位论文比对上参考基因组的 clean reads 比例 94.90% 94.32% 94.47% 94.44% 93.95% 94.15%唯一比对上参考基因组某一位置的clean reads 比例82.40% 81.78% 82.08% 83.19% 83.19% 83.23%3.3.3 基因表达分析测序饱和度分析可以在一定程度上判断测序数据量是否满足要求。随着测序量(Reads 数量)的增加，检测到的基因数也随之上升，当测序量达到一定区间后其检测到的基因数增长速度趋于平缓，表明所检测到的基因数趋于饱和，此时测序量结果达到要求。本试验中新疆褐牛与哈萨克牛各样本测序所检测到的基因数增长速度趋于平缓，基因数趋于饱和，其表达量达到要求，结果见图 3-3。
【参考文献】：
期刊论文
[1]传统风干牦牛肉加工过程中新鲜度的变化[J]. 宋艳艳,马纪兵,王惠惠,崔文斌,刘小波,张丽,余群力,魏晋梅,郭兆斌. 食品与发酵科技. 2019(01)
[2]BCG感染牛肺泡巨噬细胞的转录组测序和分析[J]. 徐金瑞,吕翠萍,杨易,周彦兵,骆佳,王玉炯. 吉林大学学报(医学版). 2019(01)
[3]牦牛肉牛瘤胃平滑肌肌原纤维蛋白特性及品质变化差异分析[J]. 刘慧,余群力,朱跃明,张文华,薄文喜,韩玲. 现代食品科技. 2019(02)
[4]排酸成熟时间对不同品种牛肉质影响的研究[J]. 闫向民,谢鹏贵,崔繁荣,叶治兵,李红波,李娜,袁理星,周振勇,张金山. 畜牧与兽医. 2018(12)
[5]两种冷却方式对宰后成熟过程中牛肉保水性的影响[J]. 惠小洋,余群力,曹晖,韩广星,吴磊,韩玲. 食品与发酵工业. 2018(11)
[6]牦牛骨骼肌、平滑肌和心肌氨基酸和脂肪酸组成分析及营养评价[J]. 李升升,余群力. 营养学报. 2018(02)
[7]CD46基因在新疆褐牛不同组织中的表达研究[J]. 木哈买提江·铁格斯,张慧敏,宋焕堂,加尔肯,苏战强,冉多良,刘建华. 中国畜牧兽医. 2017(06)
[8]‘西门塔尔杂交牛’与‘平凉红牛’不同部位肉品质分析[J]. 韩冬洁,余群力,韩玲,朱跃明,谢卿. 甘肃农业大学学报. 2016(05)
[9]新疆褐牛POU1F1基因PCR-RFLP分析[J]. 陈然,王传波,李春明,曹春娜,张烨辉. 新疆畜牧业. 2016(06)
[10]ADIG诱导牛成肌细胞转分化及相关基因的表达分析[J]. 梅楚刚,张琼,付常振,刘扬,姜碧杰,成功,昝林森. 畜牧兽医学报. 2016(04)
博士论文
[1]猪背最长肌肌内脂肪含量相关基因的筛选及表达分析[D]. 王昱丁.山东农业大学 2017
[2]1. MiR-133a，miR-1，miR-206诱导C2C12细胞成肌前体细胞及miR-133a靶基因Fox12鉴定的研究 2. IL-28B多态性位点及血清维生素D水平在HCV感染病人中的相关性分析研究[D]. 罗月球.浙江大学 2015
[3]秦川牛肌肉生长发育相关基因和蛋白质的筛选及其初步鉴定[D]. 贺花.西北农林科技大学 2014
[4]牛FABP4基因代谢功能研究及品种间脂肪细胞发育特性分析[D]. 魏胜娟.西北农林科技大学 2014
[5]肉牛脂肪组织和背最长肌脂代谢相关基因差异表达分析[D]. 戢爽.吉林大学 2013
[6]中国主要牛种肌肉组织基因表达谱特征比较分析[D]. 张莺莺.西北农林科技大学 2010
硕士论文
[1]我国牛病毒性腹泻病毒流行情况的Meta分析及感染BVDV的MDBK细胞转录组学分析[D]. 马莉莉.黑龙江八一农垦大学 2018
[2]隆林黄牛、荷斯坦牛和西林水牛的肉质、肌纤维和酶活性差异的研究[D]. 方程.广西大学 2018
[3]西门塔尔牛及杂种和牛两群体的肉质性状全基因组关联研究与选择信号分析[D]. 史新平.河北农业大学 2018
[4]云岭牛和文山牛背最长肌肉质特性及DNA甲基化分析[D]. 王文强.扬州大学 2017
[5]IRS-1通过miR-143调节前脂肪细胞分化的作用与机制研究[D]. 刘雅青.中南大学 2014
[6]新疆褐牛POU1F1基因第六外显子多态性及mRNA表达相关研究[D]. 刘磊.新疆农业大学 2008
本文编号：3605121
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