北京鸭GBS平台构建及部分经济性状全基因组关联分析
发布时间:2023-04-04 02:47
北京鸭是我国著名的肉鸭品种,研究其采食性状的表型规律和遗传基础有助改良其饲料转化效率,提高生产性能,全面提升本土北京鸭品种的市场竞争力。本研究中,我们选择并使用自动采食记录系统记录了 358只雄性北京鸭的采食行为数据,并且比较了不同剩余采食量水平的肉鸭采食行为上的差异。结果表明,总采食时间、日采食量和每次平均采食量与饲料转化效率(RFI,FCR)性状之间存在很强的正相关关系;每次平均采食量和体重之间同样被发现存在显著的相关关系(R = 0.32,0.36;P<0.01);日平均采食速度和每餐时间与饲料效率之间有微弱的相关关系(R = 0.14~0.15,P<0.01);采食间隔与饲料利用率之间并没有发现显著相关。我们分析了每天采食行为的变化,发现高RFI水平的北京鸭在整个饲养期内都保持较高的饲料消耗,并在日采食次数与其他RFI水平肉鸭上有明显不同,并且随着年龄的增长,这些差异也逐渐扩大,但在每日有效采食次数不同RFI组别(高、中、低组)之间没有显著差异。本研究结果表明,自动采食记录系统能够准确记录北京鸭采食行为,同时部分采食行为对饲料转化效率有显著影响,有望用于新的育种指标...
【文章页数】:98 页
【学位级别】:博士
【文章目录】:
摘要
Abstract
缩略词
第一章 文献综述
1.1 饲料转化效率研究进展
1.1.1 饲料转化效率概述
1.1.2 饲料转化效率遗传基础研究
1.1.3 采食行为概述
1.1.4 全自动种鸭生产性能测定系统
1.2 简化基因组分型技术
1.2.1 测序技术的发展
1.2.2 分子标记的发展与应用
1.2.3 标记辅助选择技术发展
1.2.4 简化基因组测序
1.3 本文的研究目的与意义
第二章 北京鸭采食行为研究
2.1 前言
2.2 材料与方法
2.2.1 实验群体
2.2.2 数据记录与处理
2.2.3 饲料转化效率性状计算
2.2.4 统计分析
2.3 结果
2.3.1 表型统计
2.3.2 表型相关
2.3.3 不同RFI水平北京鸭采食行为差异
2.3.4 采食行为随时间变化的规律
2.3.5 北京鸭采食行为与空间位置的关系
2.3.6 北京鸭每日的采食行为分布
2.4 讨论
2.4.1 标准采食间隔
2.4.2 北京鸭采食习性
2.4.3 北京鸭饲料转化效率与采食行为的关系
第三章 北京鸭GBS基因分型
3.1 前言
3.2 材料与方法
3.2.1 主要试验仪器
3.2.2 主要试验试剂和溶液
3.2.3 血液基因组提取
3.2.4 基因组消化以及测序
3.2.5 生物信息学分析
3.2.6 RFLP-PCR验证
3.3 结果
3.3.2 测序及分型结果
3.3.3 验证分型结果
3.4 讨论
第四章 北京鸭部分经济性状基因组关联分析
4.1 前言
4.2 材料与方法
4.2.1 主要试验仪器
4.2.2 主要试验试剂和溶液
4.2.3 表型收集
4.2.4 简化基因组测序
4.2.5 数据分析
4.2.6 单点关联分析
4.2.7 基因关联分析
4.2.8 统计分析
4.2.9 功能注释
4.3 结果与分析
4.3.1 表型信息描述
4.3.2 数据处理
4.3.3 遗传参数
4.3.4 单位点关联分析
4.3.5 基因模型关联分析
4.3.6 功能注释
4.4 讨论
4.4.1 北京鸭饲料转化效率遗传参数估计
4.4.2 北京鸭饲料转化效率性状全基因组关联分析
第五章 结论
参考文献
致谢
附录
个人简历
本文编号:3781639
【文章页数】:98 页
【学位级别】:博士
【文章目录】:
摘要
Abstract
缩略词
第一章 文献综述
1.1 饲料转化效率研究进展
1.1.1 饲料转化效率概述
1.1.2 饲料转化效率遗传基础研究
1.1.3 采食行为概述
1.1.4 全自动种鸭生产性能测定系统
1.2 简化基因组分型技术
1.2.1 测序技术的发展
1.2.2 分子标记的发展与应用
1.2.3 标记辅助选择技术发展
1.2.4 简化基因组测序
1.3 本文的研究目的与意义
第二章 北京鸭采食行为研究
2.1 前言
2.2 材料与方法
2.2.1 实验群体
2.2.2 数据记录与处理
2.2.3 饲料转化效率性状计算
2.2.4 统计分析
2.3 结果
2.3.1 表型统计
2.3.2 表型相关
2.3.3 不同RFI水平北京鸭采食行为差异
2.3.4 采食行为随时间变化的规律
2.3.5 北京鸭采食行为与空间位置的关系
2.3.6 北京鸭每日的采食行为分布
2.4 讨论
2.4.1 标准采食间隔
2.4.2 北京鸭采食习性
2.4.3 北京鸭饲料转化效率与采食行为的关系
第三章 北京鸭GBS基因分型
3.1 前言
3.2 材料与方法
3.2.1 主要试验仪器
3.2.2 主要试验试剂和溶液
3.2.3 血液基因组提取
3.2.4 基因组消化以及测序
3.2.5 生物信息学分析
3.2.6 RFLP-PCR验证
3.3 结果
3.3.2 测序及分型结果
3.3.3 验证分型结果
3.4 讨论
第四章 北京鸭部分经济性状基因组关联分析
4.1 前言
4.2 材料与方法
4.2.1 主要试验仪器
4.2.2 主要试验试剂和溶液
4.2.3 表型收集
4.2.4 简化基因组测序
4.2.5 数据分析
4.2.6 单点关联分析
4.2.7 基因关联分析
4.2.8 统计分析
4.2.9 功能注释
4.3 结果与分析
4.3.1 表型信息描述
4.3.2 数据处理
4.3.3 遗传参数
4.3.4 单位点关联分析
4.3.5 基因模型关联分析
4.3.6 功能注释
4.4 讨论
4.4.1 北京鸭饲料转化效率遗传参数估计
4.4.2 北京鸭饲料转化效率性状全基因组关联分析
第五章 结论
参考文献
致谢
附录
个人简历
本文编号:3781639
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