沙棘果实发育过程中长链非编码RNA鉴定及功能分析

发布时间：2024-01-31 19:51

　　真核生物基因组极其复杂,不仅能够产生编码能力的m RNA同时还存在大量的非编码RNA,真核生物基因组内大约98%的区域是非编码RNA区域。过去十年时间对于非编码RNA的研究主要集中于短的非编码RNA,例如micro RNAs、small interfering RNAs和Piwi-associated RNAs。随着高通量测序技术的发展,一类新型的非编码RNA长链非编码RNA(Long noncoding RNA,lnc RNA)被逐渐发现。植物中研究发现lnc RNA能够调控植物的抗病、开花、产量和果实发育等重要的生物学过程。沙棘果实发育成熟过程受到多种调节因子的协同作用,通过对参与沙棘果实成熟发育过程的关键调节基因以及功能元件的进一步研究,能够帮助研究人员更好的理解沙棘果实发育成熟过程中的分子调控机制,从而更好的进行沙棘的培育和育种工作。因此,本研究以内蒙古磴口县种植的杂交种‘红棘’沙棘的三个不同发育时期果实为试验材料进行全转录组测序,通过建立生物信息学分析流程在全基因组水平上鉴定出高可信度沙棘长链非编码RNA。对获得的沙棘长链非编码RNA进行了序列特征、染色体分布特征和表达特征分...

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图1-1miRNA经典和非经典合成途径[28]

第一章绪论6合成途径包括四种，包括经典的miRNA合成途径、DroshaandDGCR8非依赖性途径、TUTase依赖性途径和Dicer非依赖性途径[28]。如图1-1所示，经典的合成途径是在细胞核内miRNA基因首先由RNA聚合酶II催化转录生成pri-miRNA，随之Dros....

图1-2lncRNA分类[60]

第一章绪论161.1.3.1长链非编码RNA（lncRNA）简介长链非编码RNA（Longnon-codingRNA，lncRNA）是一类长度超过200nt、缺乏蛋白编码能力的内源性非编码RNA分子[56]。通常情况下，在结构上大部分lncRNA都具有帽子结构和polyA尾。此外....

图1-3lncRNA作用机制[65]

第一章绪论19图1-3lncRNA作用机制[65]Fig.1-3lncRNAfunctionalmechanism[65]注：（A）lncRNA介导的顺式基因调控（B）lncRNA位点的转录产生的表达调控影响（C）lncRNA位点处的DNA调控元件Note：(A)lncRNA-m....

图1-4lncRNA作为内源模拟靶标发挥功能示意图[75]

第一章绪论21图1-4lncRNA作为内源模拟靶标发挥功能示意图[75]Fig.1-4FunctiondiagramoflncRNAasanendogenoussimulatedtarget[75]注：（A）miRNA的一般机制：靶mRNA结合（B）miRNA：TM结合的一般机制....

本文编号：3891449