饲喂方式对新生羔羊肠道微生物菌群结构和来源的影响

发布时间：2024-02-29 03:07

　　本研究的目的是探讨随母哺乳和人工饲喂两种不同饲喂方式对新生羔羊肠道微生物菌群结构的影响,并研究在这两种饲喂方式下早期肠道菌群的母体和环境来源以及相应比例。试验选取6只妊娠母羊和它们的双胞胎羔羊为研究对象,双胞胎羔羊出生后随机分为随母哺乳组和人工饲喂组,每组6只羔羊,采集母羊身体部位、羊舍环境和第3日龄时羔羊的肠道食糜样品,检测这些样品的微生物组成。结果如下:不同饲喂方式对新生羔羊肠道微生物菌群结构的影响采用16SrDNA基因测序和qPCR方法,研究随母哺乳组和人工饲喂组两组羔羊肠道微生物组成。结果发现新生羔羊肠道微生物在门水平上以拟杆菌门、厚壁菌门和变形菌门为主,在属水平上以拟杆菌属为主。不同饲喂方式显著影响羔羊早期肠道微生物的组成,人工饲喂组羔羊肠道微生物的物种丰富度显著高于随母哺乳组羔羊,人工饲喂显著增加了羔羊肠道中大肠杆菌/志贺氏菌,丁酸弧菌和梭菌XlVa的丰度,显著降低了羔羊肠道中梭菌XI的丰度。新生羔羊肠道微生物菌群的来源和比例分析采用16S rDNA基因测序方法研究母羊身体部位—母体口腔、生殖道、粪便、母乳、腹部皮肤、乳房皮肤、乳头皮肤,和羊舍环境—羊舍墙壁、羊舍地板、羊舍...

【文章页数】：61 页

【学位级别】：博士

【部分图文】：

图２－１信息分析流程图??Ｆｉｇｕｒｅ?２－１?Ｆｌｏｗ?ｃｈａｒｔ?ｏｆ?ｄａｔａ?ａｎａｌｙｓｉｓ??（２）测序数据处理及统计??

基于聚类结果，可以进行物种注释、ａｌｐｈａ多样性分析和ｂｅｔａ多样性分析；??基于注释结果，可以得到各水平的分类信息，从而进行样本组成及样本间群落结??构差异相关分析。整个分析流程如图２－１所示：??８??

图２－２样品稀释曲线

物种累积曲线用于描述随着样本量的加大物种增加的状况，是调查样本的物??种组成和预测样本中物种丰富度的有效工具，被广泛用于样本量是否充分性的判??断以及物种丰富度的估计。本试验中，我们共采集了?８３个样品，从图２－３可以??看出，当样本量为８３时，物种累积曲线趋于平坦，再增加样本量....

图２－３物种累积曲线??Ｆｉｇｕｒｅ?２－３?Ｓｐｅｃｉｅｓ?Ａｃｃｕｍｕｌａｔｉｏｎ?Ｃｕｒｖｅｓ??

２．２．２肠道微生物ａｌｐｈａ多样性分析结果??在以下结果中，除非特别说明，所有数据都用中位数的形式呈现。??如下图２－４所示，随母哺乳组和人工词喂组中ＯＴＵｓ数量（Ｐ?＝０．０２５）和Ｃｈａｏｌ??指数（Ｐ＝０．０１１）存在显著差异，人工饲喂组羔羊肠道微生物的ＯＴＵｓ数量和Ｃｈ....

图２－４随母哺乳组和人工饲喂组羔羊肠道微生物菌群ａｌｐｈａ多样性指数（ＯＴＵｓ，??Ｃｈａｏｌ，Ｓｈａｎｎｏｎ和Ｓｉｍｐｓｏｎ）

其中１０个门的细菌相对丰度２０．１％，这１０个门水平的细菌是这两组羔羊??肠道中的核心菌群。拟杆菌门（Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｔｅｓ），厚壁菌门（Ｆｉｒｍｉｃｕｔｅｓ）和变形??菌门（Ｐｒｏｔｅｏｂａｃｔｅｒｉａ）是这两组黑羊肠道的优势菌（表２－４，图２－５?ａ），拟杆菌??门，厚壁....

本文编号：3914398