猪免疫与生长、繁殖性状间的遗传相关及其受环境影响的分子机制研究

发布时间：2024-03-19 00:37

　　免疫、生长和繁殖都是猪育种中的重要数量性状。阐明这些数量性状的遗传机制是猪育种工作者的重要研究任务之一。而随着全基因组范围内的分子标记检测技术的发展,存在着大量的利用数量性状基因座位(quantitative trait loci,QTL)定位、全基因组关联分析(genome-wide association study,GWAS)来对这些性状各自的分子遗传机制进行解析的研究。更重要的是,这些性状并非相互独立,而是存在关联、相互影响的。比如,多种免疫因子被证实可以参与生长与繁殖过程;而免疫这类对于生命维持重要的生理过程会优先消耗本该提供给生长与繁殖的能量,从而形成了它们之间此消彼长的关系。并且,我们发现我国每年从西方国家引进的大量种猪到了国内以后,由于猪场卫生状况较差、免疫程序复杂,出现了性能“退化”的现象,这可能是由于免疫对其他性状的影响所致。但遗憾的是,从遗传角度系统揭示免疫与生长、免疫与繁殖之间关联机制的研究工作目前未见报道;而免疫程序、环境卫生状况的改变对生长、繁殖等这些生产相关性状产生影响的具体机制尚不明确;此外,这种环境的变化持续下去是否可以形成免疫与生长、繁殖性状的共进化...

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图1-1不同类型的多效性[38]，包括（a）与（b）生物学多效性；（c）伪多效性；（d）介导多效性Figure1-1Differenttypesofpleiotropy[38],including(a)and(b)biologicalpleiotropy;(c)

1导论7进化，但是与非特异性免疫相关的基因也会受到正向选择的作用发生进化。比如一类调控非特异性免疫的多肽——防御素，多个不同的研究均证实编码防御素的基因序列dN要大于dS，即受到了正向选择压力的作用[34-36]。1.1.3免疫与生长、繁殖间的关系生物体是一个有机整体，因此各种性....

图1-2选择性扫除示意图[125]

上海交通大学博士学位论文20将当成未知变量与模型中的其他未知参数同时估计[121]，这种方法可能是估计EG的最优方法，但是在数据量较大且模型更加复杂时，用于参数估计的马尔科夫链蒙特卡洛（MarkovChainMonteCarlo）过程很难收敛。③先利用普通的线性混合模型估计不同环....

图2-1免疫与生长、繁殖性状之间多效基因与基因集挖掘流程

上海交通大学博士学位论文26胞计数、细胞因子与补体等多种免疫活性物质的水平等等；生长性状则属于猪的生产相关性状，包括生长速度、胴体重等各类生长相关的具体表型；繁殖性状则包括了调控繁殖的激素、生殖器官、衡量繁殖能力的指标（比如产仔数、乳头数等）等各个表型。所有这些性状的具体名称与缩....

图2-2交集QTL区段在免疫、生长与繁殖QTL中的分布情况

上海交通大学博士学位论文302.2.1QTL交集区段免疫与生长、免疫与繁殖性状之间的QTL交集在各个性状QTL中的具体数量分布如图2-2所示。由图可见，大部分生长与繁殖性状的QTL都与免疫QTL存在交集现象，其中，14.6%的生长QTL与免疫QTL存在交集，7.0%的繁殖QTL与....

本文编号：3932058