NGS-SNPs体系对肿瘤组织个体识别的法医学应用研究
发布时间:2021-07-14 14:19
肿瘤组织溯源鉴定是国内外肿瘤临床工作中经常遇到的难题。肿瘤患者与被切除肿瘤组织的同一性识别对肿瘤患者的准确诊断及精准治疗的实施尤其重要。恶性肿瘤高发,肿瘤组织错误标记、混淆和污染的情况在医院病理科时有发生,这不仅导致医疗纠纷的发生,影响医院的正常运行,甚至困扰肿瘤病人的治疗,影响肿瘤临床医学的发展。随着肿瘤发病率和死亡率的增高,涉及肿瘤组织的法医学鉴定案件也越来越多。目前,已有大量研究报道在肿瘤组织中法医学常用的短串联重复序列(short tandem repeats,STRs)易发生突变,使同一个体正常组织和肿瘤组织的STRs基因型不一致,得出错误的排除性结论。在本实验室对多个系统肿瘤组织STRs的检测结果也证实这一现象。因此,需要检测突变率低的遗传标记进行肿瘤组织个体识别。与STRs相比,单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNPs)突变率低(~10-8)和扩增片段短(~100bp)的特点使其更适用于肿瘤组织法医学鉴定。然而,由于SNPs的二等位基因现象,需要检测大量SNPs位点才能获得与STR相似的效能,达到个体识...
【文章来源】:河北医科大学河北省
【文章页数】:184 页
【学位级别】:博士
【部分图文】:
IonTorrentSuite的测序情况总结Fig.1RunsummaryonIonTorrentSuite
44图3P256基因座上游引物区Sanger测序序列Fig.3ForwardprimersequenceinSNPP256bySangersequencingThebasewithunderlinewasthemutation.图4rs2319818基因座的上游引物区Sanger测序序列Fig.4ForwardprimersequenceinSNPrs2319818bySangersequencingThebaseswithunderlinewerethemutationsandthesquarewasthebasedeletion.
44图3P256基因座上游引物区Sanger测序序列Fig.3ForwardprimersequenceinSNPP256bySangersequencingThebasewithunderlinewasthemutation.图4rs2319818基因座的上游引物区Sanger测序序列Fig.4ForwardprimersequenceinSNPrs2319818bySangersequencingThebaseswithunderlinewerethemutationsandthesquarewasthebasedeletion.
【参考文献】:
期刊论文
[1]Cancer incidence and mortality in China, 2014[J]. Wanqing Chen,Kexin Sun,Rongshou Zheng,Hongmei Zeng,Siwei Zhang,Changfa Xia,Zhixun Yang,He Li,Xiaonong Zou,Jie He. Chinese Journal of Cancer Research. 2018(01)
[2]微单倍型遗传标记及其法医遗传学应用[J]. 饶旼,李彩霞,赵钊,胡胜,赵鹏,聂胜洁,王乐. 刑事技术. 2017(04)
[3]妇科肿瘤和乳腺癌组织常染色体和X染色体STR的突变分析[J]. 孙丽娟,李淑瑾,付光平,白梅,董春楠,杨波,陈平忍,王占东,付丽红,丛斌. 中国法医学杂志. 2017(04)
[4]基于二代测序平台的90个常染色体SNP分型研究[J]. 李海燕,张楚楚,唐振亚,李燃,陈红英,童大跃,孙宏钰. 中国法医学杂志. 2016(06)
[5]二代测序技术在法医学中的应用进展[J]. 张素华,边英男,赵琪,李成涛. 法医学杂志. 2016(04)
[6]应用Ion Torrent PGMTM平台检测中国汉族124个身份鉴定SNPs[J]. 宋鹤,周懿舒,刘锋,沈红缨,于蛟,赵金玲,赵斌,郭飞,姜先华. 中国法医学杂志. 2016(04)
[7]二代测序技术及其在法医遗传学中的应用[J]. 王乐,叶健,白雪,杨帆,赵兴春. 刑事技术. 2015(05)
[8]肿瘤个体化治疗相关基因突变检测试剂实验室性能评估要求解析[J]. 何静云,李耀华. 中国医药生物技术. 2015(05)
[9]测序新技术Ion Torrent PGM及其法医学应用[J]. 刘宇轩,张文琼,黄代新. 中国法医学杂志. 2015(01)
[10]人肺癌组织19个常染色体STR及性别基因座变异分析[J]. 钟巧娥,王景舟,王红梅,张建华,陈丽琴. 中国法医学杂志. 2015(01)
硕士论文
[1]下一代测序技术在混合DNA分析中的应用研究[D]. 刘奇.河北医科大学 2017
[2]肿瘤组织SNP突变分析及其MPS技术应用初探[D]. 邓佩佩.河北医科大学 2017
[3]肿瘤间质比在非小细胞肺癌中的预后作用研究[D]. 徐军.山东大学 2016
[4]乳腺癌及妇科肿瘤组织常染色体SNP突变分析[D]. 白梅.河北医科大学 2016
本文编号:3284310
【文章来源】:河北医科大学河北省
【文章页数】:184 页
【学位级别】:博士
【部分图文】:
IonTorrentSuite的测序情况总结Fig.1RunsummaryonIonTorrentSuite
44图3P256基因座上游引物区Sanger测序序列Fig.3ForwardprimersequenceinSNPP256bySangersequencingThebasewithunderlinewasthemutation.图4rs2319818基因座的上游引物区Sanger测序序列Fig.4ForwardprimersequenceinSNPrs2319818bySangersequencingThebaseswithunderlinewerethemutationsandthesquarewasthebasedeletion.
44图3P256基因座上游引物区Sanger测序序列Fig.3ForwardprimersequenceinSNPP256bySangersequencingThebasewithunderlinewasthemutation.图4rs2319818基因座的上游引物区Sanger测序序列Fig.4ForwardprimersequenceinSNPrs2319818bySangersequencingThebaseswithunderlinewerethemutationsandthesquarewasthebasedeletion.
【参考文献】:
期刊论文
[1]Cancer incidence and mortality in China, 2014[J]. Wanqing Chen,Kexin Sun,Rongshou Zheng,Hongmei Zeng,Siwei Zhang,Changfa Xia,Zhixun Yang,He Li,Xiaonong Zou,Jie He. Chinese Journal of Cancer Research. 2018(01)
[2]微单倍型遗传标记及其法医遗传学应用[J]. 饶旼,李彩霞,赵钊,胡胜,赵鹏,聂胜洁,王乐. 刑事技术. 2017(04)
[3]妇科肿瘤和乳腺癌组织常染色体和X染色体STR的突变分析[J]. 孙丽娟,李淑瑾,付光平,白梅,董春楠,杨波,陈平忍,王占东,付丽红,丛斌. 中国法医学杂志. 2017(04)
[4]基于二代测序平台的90个常染色体SNP分型研究[J]. 李海燕,张楚楚,唐振亚,李燃,陈红英,童大跃,孙宏钰. 中国法医学杂志. 2016(06)
[5]二代测序技术在法医学中的应用进展[J]. 张素华,边英男,赵琪,李成涛. 法医学杂志. 2016(04)
[6]应用Ion Torrent PGMTM平台检测中国汉族124个身份鉴定SNPs[J]. 宋鹤,周懿舒,刘锋,沈红缨,于蛟,赵金玲,赵斌,郭飞,姜先华. 中国法医学杂志. 2016(04)
[7]二代测序技术及其在法医遗传学中的应用[J]. 王乐,叶健,白雪,杨帆,赵兴春. 刑事技术. 2015(05)
[8]肿瘤个体化治疗相关基因突变检测试剂实验室性能评估要求解析[J]. 何静云,李耀华. 中国医药生物技术. 2015(05)
[9]测序新技术Ion Torrent PGM及其法医学应用[J]. 刘宇轩,张文琼,黄代新. 中国法医学杂志. 2015(01)
[10]人肺癌组织19个常染色体STR及性别基因座变异分析[J]. 钟巧娥,王景舟,王红梅,张建华,陈丽琴. 中国法医学杂志. 2015(01)
硕士论文
[1]下一代测序技术在混合DNA分析中的应用研究[D]. 刘奇.河北医科大学 2017
[2]肿瘤组织SNP突变分析及其MPS技术应用初探[D]. 邓佩佩.河北医科大学 2017
[3]肿瘤间质比在非小细胞肺癌中的预后作用研究[D]. 徐军.山东大学 2016
[4]乳腺癌及妇科肿瘤组织常染色体SNP突变分析[D]. 白梅.河北医科大学 2016
本文编号:3284310
本文链接:https://www.wllwen.com/shoufeilunwen/sklbs/3284310.html