基于肿瘤转移相关IncRNAs标志物的肺腺癌预后模型构建及分子机制研究

发布时间：2021-01-23 03:03

　　第一部分肺腺癌转移相关lncRNAs标志物的筛选及预后评估模型的构建目的:局部复发和转移是肺癌患者死亡的主要原因,肿瘤转移相关长链非编码RNA（long non-coding RNAs,lncRNAs）分子与肺癌患者的复发预后密切相关。本研究旨在通过分析癌症基因组图谱（The Cancer Genome Atlas,TCGA）数据库,筛选与肺腺癌转移和无复发生存时间（relapse-free survival,RFS）密切相关的lncRNAs分子标志物,继而构建患者复发预后评估模型,同时结合体外实验,初步验证模型分子在肿瘤细胞侵袭迁移中的作用。方法:1.肺腺癌转移相关lncRNAs分子标志物的初步筛选。分析TCGA数据库（https://cancergenome.nih.gov/）中347例肺腺癌患者的lncRNAs表达数据和相关临床数据,使用R语言edgeR包对肿瘤转移组（n=158）和非转移组（n=189）的lncRNAs进行差异表达分析,按照筛选标准（adjusted p value,FDR<0.05;|logFC|>1）,初步筛选出与肺腺癌转移相关的lncRNAs分... 

【文章来源】：山东大学山东省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校

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【学位级别】：博士

【部分图文】：

图１．实验流程图??Ｆｉｇｕｒｅ?１．?Ｓｔｕｄｙ?ｆｌｏｗｃｈａｒｔ．??

?山东大学博士学位论文???１５??．?？?？?：??？?＊??＃?？?？??Ｑ．?？?？??２?？??〇＞?？?？?？??？?？?？?？??？？？？？？？？：?？？??？?？?？?：ｒ＇?？？？?？??５?？?．．．?■■？？：：．十：：＇：沒■??－ＺＳ?０．０?２．６?５．０??ｌｏｇ２?Ｆｏｌｄ?Ｃｈａｎｇｅ??图２．火山图显示ＴＣＧＡ数据集中有转移和无转移的肺腺癌患者中差异表达的??ＩｎｃＲＮＡｓ有７３５个。绿色点表示差异ＩｎｃＲＮＡｓ，红色点表示无差异ＩｎｃＲＮＡｓ。??Ｆｉｇｕｒｅ?２．?Ｖｏｌｃａｎｏ?ｐｌｏｔ?ｓｈｏｗｉｎｇ?７３５?ｄｉｆｆｅｒｅｎｔｉａｌｌｙ?ｅｘｐｒｅｓｓｅｄ?ＩｎｃＲＮＡｓ?ｂｅｔｗｅｅｎ??ＬＵＡＤ?ｐａｔｉｅｎｔｓ?ｗｉｔｈ?ａｎｄ?ｗｉｔｈｏｕｔ?ｍｅｔａｓｔａｓｉｓ?ｆｒｏｍ?ｔｈｅ?ＴＣＧＡ?ｃｏｈｏｒｔ．?Ｇｒｅｅｎ?ｃｏｌｏｒ??ｒｅｐｒｅｓｅｎｔｓ?ｄｉｆｆｅｒｅｎｔｉａｌ?ＩｎｃＲＮＡｓ，?ａｎｄ?ｒｅｄ?ｃｏｌｏｒ?ｒｅｐｒｅｓｅｎｔｓ?ｕｎｄｉｆｆｅｒｅｎｔｉａｔｅｄ?ＩｎｃＲＮＡｓ．??５２??

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本文编号：2994421