TRIB3在高糖介导的膀胱癌细胞增殖、迁移中的作用机制研究
发布时间:2021-07-18 16:56
目的:随着社会经济的逐渐发展2型糖尿病发病逐年升高,与此同时全球膀胱癌的发病率和病死率也在增加。2型糖尿病是膀胱癌的独立危险因素,会明显增加膀胱癌的发生率及死亡率。虽然二者许多共同的危险因素,但其内在联系机制至今仍不非常明确,因此找到糖尿病与膀胱癌相关性背后的原因迫在眉睫。基因芯片一种常用技术手段,其可用于检测不同状态下差异基因表达情况。本研究旨在通过检测高糖及低糖条件下膀胱癌细胞差异基因表达情况,筛选目的基因加以验证,并通过进一步的细胞学实验了解其可能的作用机制,了解2型糖尿病易并发肿瘤的分子机制,为2型糖尿病预防膀胱癌的发生和靶向治疗提供实验依据。方法:一、基因芯片研究:膀胱癌T24细胞分别于5.5mmol/L(低糖)和25mmol/L(高糖)葡萄糖浓度下培养,使用Affymetrix人类Clariom D,Hu芯片系统地检测CircRNAs、LncRNA、miRNA和mRNA的表达,筛选差异倍数≥1.5的差异RNA。利用生物信息学靶定与高糖密切相关基因变化,筛选出目标基因。二、人群验证:我们回顾并收集天津医科大学第二医院泌尿外科就诊所有新发的膀胱癌癌患者的医疗资料,将46例膀胱癌...
【文章来源】:天津医科大学天津市 211工程院校
【文章页数】:138 页
【学位级别】:博士
【部分图文】:
HG组与LG组差异基因的柱形图
图 1.1 HG 组与 LG 组差异基因的柱形图 图 1.2HG 组与 LG 组差异基因的散点图1.3.3T24 细胞 HG 组与 LG 组相比差异 CircRNAs、Lnc RNA、miRNA、m RN表达情况分析基因芯片时,需要设定合适的差异倍数,减少芯片结果中的假阴性率帮助缩小筛选范围选择出合适的差异基因进行后续研究。既往研究显示差异数筛选标准是 1.5 时,可以减少结果的假阴性率,我们经过分析将差异倍数筛标准设定为 2 或 3 以便更好的减少筛选结果的假阴性率。我们的研究结果显示HG 组与对照组相比,设定差异倍数≥1.5 时,CircRNAs、Lnc RNA、miRNA、RNA 分别有 3203、9355、1571、4792 条在两组样品间表达差异明显(图 1.3)我们的研究以上调 mRNA 为切入点,故列出 FC≥3 的差异 mRNA 为 18 个差基因(表 1.2)。
天津医科大学博士学位论文12图 1.1 HG 组与 LG 组差异基因的柱形图 图 1.2HG 组与 LG 组差异基因的散点图1.3.3T24 细胞 HG 组与 LG 组相比差异 CircRNAs、Lnc RNA、miRNA、m RNA表达情况分析基因芯片时,需要设定合适的差异倍数,减少芯片结果中的假阴性率,帮助缩小筛选范围选择出合适的差异基因进行后续研究。既往研究显示差异倍数筛选标准是 1.5 时,可以减少结果的假阴性率,我们经过分析将差异倍数筛选标准设定为 2 或 3 以便更好的减少筛选结果的假阴性率。我们的研究结果显示,HG 组与对照组相比,设定差异倍数≥1.5 时,CircRNAs、Lnc RNA、miRNA、mRNA 分别有 3203、9355、1571、4792 条在两组样品间表达差异明显(图 1.3)。我们的研究以上调 mRNA 为切入点,故列出 FC≥3 的差异 mRNA 为 18 个差异基因(表 1.2)。
【参考文献】:
期刊论文
[1]Diabetes mellitus increases the prevalence of anemia in patients with chronic kidney disease:A nested case-control study[J]. Charalampos Loutradis,Alexandra Skodra,Panagiotis Georgianos,Panagiota Tolika,Dimitris Alexandrou,Afroditi Avdelidou,Pantelis A Sarafidis. World Journal of Nephrology. 2016(04)
[2]Adipokines as a novel link between obesity and atherosclerosis[J]. Hye Jin Yoo,Kyung Mook Choi. World Journal of Diabetes. 2014(03)
[3]Hyperglycemia is a significant prognostic factor of hepatocellular carcinoma after curative therapy[J]. Takanori Hosokawa,Masayuki Kurosaki,Kaoru Tsuchiya,Shuya Matsuda,Masaru Muraoka,Yuichiro Suzuki,Nobuharu Tamaki,Yutaka Yasui,Toru Nakata,Takashi Nishimura,Shoko Suzuki,Ken Ueda,Hiroyuki Nakanishi,Jun Itakura,Yuka Takahashi,Namiki Izumi. World Journal of Gastroenterology. 2013(02)
本文编号:3289983
【文章来源】:天津医科大学天津市 211工程院校
【文章页数】:138 页
【学位级别】:博士
【部分图文】:
HG组与LG组差异基因的柱形图
图 1.1 HG 组与 LG 组差异基因的柱形图 图 1.2HG 组与 LG 组差异基因的散点图1.3.3T24 细胞 HG 组与 LG 组相比差异 CircRNAs、Lnc RNA、miRNA、m RN表达情况分析基因芯片时,需要设定合适的差异倍数,减少芯片结果中的假阴性率帮助缩小筛选范围选择出合适的差异基因进行后续研究。既往研究显示差异数筛选标准是 1.5 时,可以减少结果的假阴性率,我们经过分析将差异倍数筛标准设定为 2 或 3 以便更好的减少筛选结果的假阴性率。我们的研究结果显示HG 组与对照组相比,设定差异倍数≥1.5 时,CircRNAs、Lnc RNA、miRNA、RNA 分别有 3203、9355、1571、4792 条在两组样品间表达差异明显(图 1.3)我们的研究以上调 mRNA 为切入点,故列出 FC≥3 的差异 mRNA 为 18 个差基因(表 1.2)。
天津医科大学博士学位论文12图 1.1 HG 组与 LG 组差异基因的柱形图 图 1.2HG 组与 LG 组差异基因的散点图1.3.3T24 细胞 HG 组与 LG 组相比差异 CircRNAs、Lnc RNA、miRNA、m RNA表达情况分析基因芯片时,需要设定合适的差异倍数,减少芯片结果中的假阴性率,帮助缩小筛选范围选择出合适的差异基因进行后续研究。既往研究显示差异倍数筛选标准是 1.5 时,可以减少结果的假阴性率,我们经过分析将差异倍数筛选标准设定为 2 或 3 以便更好的减少筛选结果的假阴性率。我们的研究结果显示,HG 组与对照组相比,设定差异倍数≥1.5 时,CircRNAs、Lnc RNA、miRNA、mRNA 分别有 3203、9355、1571、4792 条在两组样品间表达差异明显(图 1.3)。我们的研究以上调 mRNA 为切入点,故列出 FC≥3 的差异 mRNA 为 18 个差异基因(表 1.2)。
【参考文献】:
期刊论文
[1]Diabetes mellitus increases the prevalence of anemia in patients with chronic kidney disease:A nested case-control study[J]. Charalampos Loutradis,Alexandra Skodra,Panagiotis Georgianos,Panagiota Tolika,Dimitris Alexandrou,Afroditi Avdelidou,Pantelis A Sarafidis. World Journal of Nephrology. 2016(04)
[2]Adipokines as a novel link between obesity and atherosclerosis[J]. Hye Jin Yoo,Kyung Mook Choi. World Journal of Diabetes. 2014(03)
[3]Hyperglycemia is a significant prognostic factor of hepatocellular carcinoma after curative therapy[J]. Takanori Hosokawa,Masayuki Kurosaki,Kaoru Tsuchiya,Shuya Matsuda,Masaru Muraoka,Yuichiro Suzuki,Nobuharu Tamaki,Yutaka Yasui,Toru Nakata,Takashi Nishimura,Shoko Suzuki,Ken Ueda,Hiroyuki Nakanishi,Jun Itakura,Yuka Takahashi,Namiki Izumi. World Journal of Gastroenterology. 2013(02)
本文编号:3289983
本文链接:https://www.wllwen.com/shoufeilunwen/yxlbs/3289983.html
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