非小细胞肺癌VTI1A基因SNP多态性及其相关性研究

发布时间：2017-05-30 19:04

  本文关键词：非小细胞肺癌VTI1A基因SNP多态性及其相关性研究，由笔耕文化传播整理发布。

【摘要】：背景肺癌是全球最常见的恶性肿瘤之一。在中国,肺癌在男女人群中的死亡率一直居高不下,而且近几十年,肺癌的5年生存率只有15%,依然没有很好的改善。根据我国肿瘤防治办公室发布的材料结果显示：从上世纪70年代至今,我国肺癌死亡率上升了近5倍。肺癌已经成为严重危害我国居民生命和健康的主要疾病之一,流行病学研究结果表明：肺癌的发生与遗传因素和环境因素都同时相关。大量的研究调查表明：约80%以上的肺癌可归咎于烟草暴露,且吸烟者比不吸烟者患肺癌的发生率高近10倍。然而并不是所有吸烟的患者都患有肺癌。肺癌的发生可能还与其他的因素有关,其中和变异相关的基因多态性可能成为肺癌的发病的危险因素。随着肺癌流行病学的发展以及肺癌分子生物学研究水平的不断进步,在非小细胞肺癌遗传基因方面的研究也越来越多。近年来,国际基因组单体型图谱计划以及人类基因组计划的实施和推进,同时基因分型检测系统的不断发展和完善,都为全基因组关联研究(Genome-wide association studies, GWAS)奠定了基础。开展GWAS研究的基本原理如下：首先在目标人群中设立研究对象,分为病例组和对照组,将单核甘酸多态性(Single nucleotide polymorphism,SNP)作为遗传标记物,分别在两组间进行全基因组范围的SNP检测分析。如果在病例与对照组相比的结果中,发现病例组中某个SNP位点的等位基因或基因型出现的频率具有显著的统计学差异,则该位点可能与该疾病的发病风险密切相关。然后研究者通过基因定位以及连锁不平衡(linkage disequilibrium, LD)分析来判断可能的疾病易感基因。现在,GWAS在研究肺癌等复杂性疾病的遗传易感性方面应用很广,渐成为一个有效的检测手段。目前GWAS已经在世界范围内进行筛选出一批与肺癌遗传易感性相关的常见基因变异,例如在染色体5p15、6p21和10q25.2区域发现基因变异位点,这些位点的遗传多态性可增加或降低个体罹患肺癌的风险。以上研究结果提示通过检测与罹患肺癌风险相关的遗传学分子标志物,有助于进行肺癌发病机制研究及筛选肺癌高危人群。基因多态性是指在一个生物群体中,同时存在的两种或两种以上不连续的等位基因、变异型或者基因型。根据对基因多态性研究的顺序,通常可以将其分为三类,分别是单核苷酸多态性(SNP)、DNA重复序列的多态性(RSP)和限制性片段长度的多态性(RFLP)。这三类基因多态性均可以反映个体遗传病的易感性差异,为遗传相关疾病的研究和临床诊断提供帮助。目前,单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism, SNP),是人类可遗传的变异中最常见的一种变异,即其在基因组内因为单个核苷酸C、G、A或T的改变而形成的基因多态性,该变异占所有已知多态性的90%以上。SNP在人类基因组中广泛存在,平均每500-1000个碱基对中就有1个多态性的变异,估计其总数可达300万个甚至更多。由于SNP具有分布密度高、稳定性好、分型检测易于操作等优势,在遗传疾病的基因鉴定方面发挥重要作用。2012年Nature Genetic杂志上发表一份研究结果,在该结果中我们可以知道全基因组关联研究(Genome-wide association studies,GWAS)发现了一个新的SNP位点,即VTI1A (rs7086803),它能增加亚洲不吸烟女性患者罹患肺癌的风险性。目前国内外尚未有对该基因位点的进一步的研究。肺癌与SNP的易感性关系的研究目前已成为肺癌研究领域的热点,并且全球多个地区进行的GWAS研究已经寻找到一些影响肺癌发病风险的染色体区域和易感基因位点。从2008年开始,法国、冰岛和英国等多个研究团队通过GWAS发现该基因簇上的SNPs变化能显著影响肺癌的发病风险,该结果表明遗传因素在肺癌发病中的作用不容忽视。Amos等以美国1154名吸烟的非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer, NSCLC)患者和1137名吸烟状态匹配的健康人群为研究对象,检测315450个SNPs,结果显示与肺癌发病关系最密切的SNPs位点有10个,分别为rs2808630、rs1481847、rs2202507、rs7626795、rs11099666、rs1051730、 rs6069045、rs803419、rs12956651以及rs855974。然后,进一步的研究结果发现在不同种族人群中他们的SNP的分布亦会有所不同。例如,欧洲的GWAS显示位于染色体15q25.1区域的SNP位点rsl6969968、rs1051730和rs8034191与罹患肺癌的风险性显著相关。然而,在韩国、日本及中国人群中的研究却不能再次重复该实验结果,追踪其原因可能是因为在亚洲人群中这些多态位点的最小等位基因频率的分布较低所致。以上研究结果提示肺癌的易感基因位点分布可能存在种族和地域的差异。在我国,不吸烟女性患者发生肺癌的几率并不少见,已有研究表明部分不吸烟女性肺癌患者具有特殊的基因表型如EGFR突变、ALK重排、cMET扩增等。这些研究结果均提示不吸烟女性患者罹患肺癌的发生机制可能除了与吸烟者肺癌重叠的同时,还有其独特的分子通路。因此,亚洲女性不吸烟人群10q25.2区域的rs7086803具有罹患肺癌的高风险性,那该多态位点在我国整体人群的分布及其发生机制又是如何,则需要我们进一步的探讨与研究。脂联素(adiponectin, ADIPOQ)是由白色脂肪组织细胞特异性分泌的一种胶原样细胞因子,其分泌后进入血液循环,在胰岛素增敏、抗动脉粥样硬化和抗糖尿病等方面发挥着强大的生理调节作用。为探讨脂联素水平与肺癌的关系,Petridou等进行了一项包含85个病例的临床病例对照研究,该研究结果显示,肺癌患者的血清脂联素水平在肺癌病例组与对照组无显著差异。Petridou等进行的另一项旨在探讨胰岛素抵抗(Insulinresistance)与肺癌相互关系的研究中也得到了相似的结果。但Petridou等的研究结果显示晚期肺癌患者血清脂联素水平较局限期患者显著为低(odds ratio:0.25,95%CI:0.10-0.78),进一步对肺癌组织行免疫组化分析显示,脂联素受体(AdipoR)在癌组织有表达,但正常肺组织内无脂联素受体的表达。AdipoR1表达于所有类型的肺癌组织,而且不同分期之间的癌组织AdipoR1的表达数量无差异,但AdipoR2主要表达在小细胞肺癌及晚期非小细胞肺癌组织。流行病学调查研究结果显示乳腺癌、子宫内膜癌、结肠癌、前列腺癌等癌症,在它们的发病率和死亡率中,脂肪因子在肥胖和癌症的关系中起到了一个很重要的作用。体外很多项研究均提示在不同的癌症细胞株里,某些特定的脂肪因子可能与它们的生长繁殖有关,而且,已经有开展的临床研究研究脂肪因子在不同的癌症类型中所起的作用,报告了脂肪因子与癌症的易感性、病理类型和预后是相关的。在过去,研究提示脂肪因子可能是肺癌的高危险因素之一。临床数据分析显示肥胖能降低肺癌的死亡率(不考虑吸烟状态),并能延长患者的生存时间。脂肪细胞分泌补体蛋白所需要的滤泡上含有VTI1A,在脂肪细胞中如果VTI1A减少,脂连蛋白的分泌也随之减少,低产量的脂连蛋白与肺癌的进展有关。VTI1A是否能通过细胞膜上与脂联素受体作用,影响脂联素的分泌,从而来影响肺癌的易感性,它们之间的确切关系及作用机制还有待进一步研究明确,相信深入研究VTI1A与脂联素受体在肺癌发生发展及治疗中的作用及意义是十分必要的。本课题旨在通过病例-对照分析,探讨染色体1Oq25.2区域基因多态性与中国人群肺癌发病的相关性,及其与脂联素受体的相关性,从而为肺癌高危人群的筛查、早期诊断和个体化治疗提供理论依据和数据基础。实验将研究对象限定在中国汉族人群肺癌患者,并且按照肺癌国际多学科分类将病例重新进行病理分型。利用Roche Light Cycler 480 System Ⅱ检测平台在中国肺癌患者和健康对照者中进行基因单核苷酸多态性分型检测,一方面统计分析该基因多态性分布及与肺癌易感性的关系,验证适合中国人群的肺癌VTI1A (rs7086803) SNP位点易感性；另一方面对该位点多态性与肺癌患者的性别、吸烟状态、病理类型及TNM临床分期等的相关性进行分层分析,并分析该多态性基因与吸烟状态的预后,探讨基因型多态性分布与临床病理特征之间的关系；同时利用免疫组化方法检测AdipoRl蛋白在肺癌组织及癌旁组织中表达水平,进一步验证该基因与AdipoRl在肺癌发生中的关系及其作用。综上数据,为中国肺癌高危人群的确定及个体化预防和治疗奠定初步的数据基础和理论依据,也为下一步建立适合中国人群的肺癌易感基因风险评估模型做准备。第一部分检测VTI1A(rs7086803)SNP在中国非小细胞肺癌及正常人群中的表达目的检测VTI1A在中国非小细胞肺癌及正常人群中的表达频率(包括男性,女性,吸烟与不吸烟),验证VTI1A基因的多态性频率及其是否是女性非吸烟非小细胞肺癌患者的特异性易感基因。方法收集1998年3月至2012年3月在广东省肺癌研究所就诊并病理组织确诊为非小细胞肺癌的患者共746例,正常人群141例,共887例,所有患者的病理和基因检测均取得患者的知情同意。以正常人群为对照组,非小细胞肺癌患者为观察组。收取血液标本,提取DNA。然后采用Taqman探针法进行基因多态性的检测,检测位点为VTI1A(rs7086803), DNA扩增后,PCR仪收集荧光信号,根据荧光信号绘制出基因型的型别分布散点图,进而分析VTI1A (rs7086803)的基因型分布。统计分析采用SPSS 13.0软件,不同SNP的表达与与性别、年龄、肿瘤病理类型、淋巴结转移、远处转移、TNM分期,吸烟状态,治疗方式的关联采用卡方检验,理论频数有小于5者采用Fisher确切概率法分析,通过Hardy-Weinberg平衡校验计算出本文所研究样本的基因多态性是否有代表性,以α=0.05(双侧)为检验水准,P0.05为有统计学意义。结果1) Hardy-Weinberg平衡检验采用拟合优度卡方检验,发现正常人群的VTI1A(rs7086803)SNP多态性位点的基因型分布差异没有统计学意义(P0.05),符合Hardy-Weinberg平衡定律,提示本文研究所选择的样本具有很好的代表性。2)从1998年3月至2012年3月,我们一共入组746例确诊为非小细胞肺癌并有详细临床信息的患者,141例正常人群。正常人群为对照组,肺癌患者为观察组。在非小细胞肺癌组中,男性患者228例(30.6%),女性患者518例(69.4%)；患者的年龄为27-86岁,中位年龄60岁；吸烟状态：吸烟的患者为159例(21.3%),不吸烟的587例(78.7%)。在正常人群组中,男性患者25例(17.7%),女性患者116例(82.3%)；患者的年龄为15-78岁,中位年龄42岁；吸烟状态：吸烟的患者为14例(9.9%),不吸烟的127例(90.1%)。3)我们纳入非小细胞肺癌人群746例,分析VTI1A(rs7086803)基因型频率与临床病理特征的关系。将VTI1A(rs7086803)的SNP分为三组,分别为AA,AGGG组,每个临床病理特征又各分为两组,我们发现该基因位点与性别、年龄、肿瘤病理类型、淋巴结转移、远处转移、TNM分期,吸烟状态,治疗方式均没有统计学意义,这有可能与我们的样本量小有关。4)我们纳入两组人群,一组观察组,为非小细胞肺癌人群746例,一组对照组,为正常人群141例,分析VTl1A(rs7086803)基因型频率在这两组人群中的表达率的情况。将基因状态分为3大组,一组为GG,AG,AA;一组为AG+GG,AA,一组为AG + AA,GG.在第一大组中,在观察组人群的GG占45.4%,AG占42.5%,AA占12.1%；在对照组中,GG占57.4%,AG占32.6%,AA占10%；其三组构成比的,为6.893,P=0.032；以GG基因型作为参照,AG vs.GG: OR=1.647,95% CI:1.112-2.439；P=0.007；AA vs.GG: OR=1.536,95%CI=0.832-2.836；P=0.168。在第二大组中,在观察组人群的AG+GG占87.9%,AA占12.1%；在对照组中,AG+GG占90.0%,AA占10.0%；其两组构成比的χ2为0.522,P=0.470；以AG+GG基因型作为参照,AA vs.AG+GG:OR=1.245.95% CI=0.687-2.255；P=0.470；在第三大组中,在观察组人群的AG+AA占54.6%,GG占45.4%；在对照组中,AG+AA占42.6%,GG占57.4%；其两组构成比的χ2为6.866,P=0.009；以AG+AA基因型作为参照,AG+AA vs. GG:OR=1.621, 95%CI=1.127-2.335:P=0.009。这些数据均显示了GG基因型发生变异与肺癌的易感性相关性很大。5)以性别为分层因素,观察VTI1A(rs7086803)的基因频率在女性肺癌患者和正常人中的不同表达。我们纳入两组人群,一组观察组,为女性肺癌患者518例；一组对照组,为女性正常人116例。将基因状态分为3大组,一组为GG,AG,AA:一组为AG+ GG,AA,一组为AG+AA,GG.在第一大组中,在观察组人群的GG占43.8%,AG占43.2%,AA占13.0%；在对照组中,GG占60.3%,AG占32.8%,AA占6.9%；其三组构成比的χ2为10.965,P=0.004。以GG基因型作为参照,AG vs. GG:OR=1.818,95% CI=1.175-2.811;P.0.007；AA vs.GG:OR=2.583,95% CI=1.183-5.637；P=0.014；在第二大组中,在观察组人群的AG+GG占87.1％,AA占12.9%；在对照组中,AG+GG占93.1%,AA占6.9%；其两组构成比的χ2为4.271,P=0.039。以AG+GG基因型作为参照,AAvs. AG+GG:OR=2.191,95% CI:1.024-4.689；P:0.039；在第三大组中,在观察组人群的AG+AA占56.2%,GG占43.8%；在对照组中,AG+AA占39.7%,GG占60.3%；其两组构成比的χ2为10.391,P=0.001；以AG+AA基因型作为参照,AG+AA vs.GG:OR=1.951,95% CI=1.294-2.941；P=0.001.因此,VTI1A(rs7086803)的A等位基因可能是导致女性人群患有肺癌的易感基因。6)以性别为分层因素,观察VTI1A(rs7086803)的基因频率在男性肺癌患者和正常人的不同表达。我们纳入两组人群,一组观察组,为男性肺癌患者228例；一组对照组,为男性正常人25例。将基因状态分为3大组,一组为GG,AG,AA:一组为AG+ GG,AA,一组为AG+ AA,GG.在第一大组中,在观察组人群的GG占49.1%,AG占40.8%,AA占10.1%；在对照组中,GG占44.0%,AG占32.0%,AA占24.0%；其三组构成比的,为4.362,P=0.113；以GG基因型作为参照,AG vs. GG:OR=1.142,95% CI=0.441-2.956;P=0.785; AA vs.GG:OR=0.376,95% Cl=0.126-1.121;P=0.071;在第二大组中,在观察组人群的AG+GG占89.9%,AA占10.1%；在对照组中,AG+GG占76.0%,AA占24.0%；其两组构成比的χ2为4.297,P=0.038。以AG+GG基因型作为参照,AA vs.AG+GG:OR=0.355,95％CI:0.129-0.979;P=0.038；在第三大组中,在观察组人群的AG+AA占50.9%,GG占49.1%；在对照组中,AG+AA占56.0%,GG占44.0%；其两组构成比的χ2为0.237,P=0.627；以AG+AA基因型作为参照,AG+AA vs.GG:OR=0.814,95％CI=0.654-1.869；P=0.627。因此,VTI1A(rs7086803)的A等位基因可能是保护男性人群不患有肺癌的基因,其与女性相反。结论1.VTI1A(rs7086803)基因型频率与性别、年龄、肿瘤病理类型、淋巴结转移、远处转移、TNM分期和吸烟状态等临床病理特征均没有统计学意义。2、中国女性肺癌人群的VTI1A(rs7086803)的A等位基因表达率较女性正常人群高。第二部分VTI1A(rs7086803)SNP表达不同与非小细胞肺癌的吸烟状态及其预后关系目的分析非小细胞肺癌患者不同的吸烟状态下其VTI1A(rs7086803)SNP表达不同的预后情况。方法收集1998年3月至2012年3月在广东省肺癌研究所就诊并病理确诊为非小细胞肺癌,并获得完整随访资料的734例的患者。患者的临床信息和治疗信息均从广东省人民医院电子病历系统查询获得,门诊随访和电话随访。随访计划为每12周一次。对未能在病历系统查询到相关信息的患者,则进行电话随访患者的总生存期(OS)。总生存期定义为从诊断时间至死亡的时间。删失数据定义为截止最后随访时间存活或者失访的患者。吸烟状态包括吸烟和非吸烟,不吸烟定义为患者一生中吸烟少于100支。吸烟者的定义为患者一生中吸烟超过100支,包括过去吸烟现已戒烟和正在吸烟。应用SPSS13.0软件对实验结果进行统计分析,用Kaplan-Meier法进行单变量生存分析,各因素水平间的比较采用Log-rank方法进行分析。采用Cox比例风险模型进行多因素分析。所有的P值都为双侧检验,以α[=0.05为检验水准,P0.05有统计学意义。结果1、AA、AG、GG三组的比较1)GG组1、2、3年生存率分别为78.0%、60.0%、45.4%,中位生存期为31.3个月；AG组1、2、3年生存率分别为73.9%、59.2%、46.5%,中位生存期为32.2个月；AA组1、2、3年生存率分别为79.7%、48.3%、38.1%,中位生存期为22.2个月。Log-rank法结果显示,三组生存率的比较差异无显著意义(χ2=1.152,P=0.562)2)根据是否吸烟,将患者进行分层。在吸烟的患者中,GG组患者的1、2、3年生存率分别为58.4%、44.7%、34.6%,中位生存期为16.7个月；AG组患者的1、2、3年生存率分别为64.1%、50.2%、41.6%,中位生存期为26.4个月；AA组患者的1、2年生存率分别为16.7%、8.3%,中位生存期为9.5个月。Log-rank法结果显示,患者三组生存率的比较差异有显著意义(χ2=8.102,P=0.017),AA组患者的生存曲线有显著下降的趋势。3)在非吸烟的患者中,GG组1、2、3年生存率分别为83.3%、64.4%、47.7%,中位生存期为34.3个月；AG组1、2、3年生存率分别为76.7%、61.2%、48.0%,中位生存期为33.6个月；AA组1、2、3年生存率分别为86.1%、56.4%、44.5%,中位生存期为32.6个月。Log-rank法结果显示,三组生存率的比较差异无显著意义(χ2=0.337,P=0.835)2, AA+AG, GG两组比较1) AA+AG组1、2、3年生存率分别为75.2%、57.1%、44.8%,中位生存期为31.7个月；GG组1、2、3年生存率分别为78.0%、59.9%、45.4%,中位生存期为31.3个月。Log-rank法结果显示,两组生存率的比较差异无显著意义(χ2=0.226,P=0.635)。2)根据是否吸烟,将患者进行分层。在吸烟的患者中,至随访结束时,AA+AG组患者1、2、3年生存率分别为60.1%、43.2%、35.9%,中位生存期为18.3个月；GG组1、2、3年生存率分别为58.4%、44.7%、34.6%,中位生存期为16.7个月。Log-rank法结果显示,患者两组生存率的比较差异无显著意义(χ2=0.007,P=0.932)。3)在非吸烟的患者中,AA+AG组1、2、3年生存率分别为79.2%、60.4%、47.4%,中位生存期为32.9个月；GG组1、2、3年生存率分别为83.3%、64.4%、47.7%,中位生存期为34.3个月。Log-rank法结果显示,两组生存率的比较差异无显著意义(χ2=0.329,P=0.566)。3. AA、AG+GG两组比较1)AA组1、2、3年生存率分别为79.7%、48.3%、38.1%,中位生存期为22.2个月；AG+GG组1、2、3年生存率分别为76.0%、59.8%、46.1%,中位生存期为31.7个月。Log-rank法结果显示,两组生存率的比较差异无显著意义(χ2=1.137,P=0.286)。2)根据是否吸烟,将患者进行分层。在吸烟的患者中,AA组患者1、2年生存率分别为41.7%、8.3%,中位生存期为9.5个月；AG+GG组1、2、3年生存率分别为61.2%、47.4%、37.6%,中位生存期为21.4个月。Log-rank法结果显示,患者两组生存率的比较差异有显著意义(χ2=7.705,P=0.006),AA组的生存曲线有显著下降的趋势。3)在非吸烟的患者中,AA组1、2、3年生存率分别为86.1%、56.4%、44.5%,中位生存期为32.6个月；AG+GG组1、2、3年生存率分别为80.1%、63.1%、48.0%,中位生存期为34.3个月。Log-rank法结果显示,两组生存率的比较差异无显著意义(χ2=0.079,P=0.748)。4、多因素分析将上述单因素分析中具有统计学意义的AA表型引入Cox风险比例回归模型分析,探讨肺癌患者的预后因素,同时引入还包括性别、年龄、病理类型、淋巴结转移、临床分期、吸烟状态等因素,结果显示：高龄患者较低龄患者的生存期短长(HR=1.013,95%CI:1.001-1.023),处于中晚期的患者的生存期较处于早中期的患者短(HR=5.433,95%CI:4.233-6.972),有淋巴结转移的患者的生存期较无淋巴结转移的患者短(HR= 1.225,95%CI:1.094-1.371),吸烟患者的预后较非吸烟患者的预后差(HR=1.701,95%CI:1.330-2.176).结合以上结果,年龄、临床分期、淋巴结转移和吸烟状态与肺癌患者的预后显著相关,是影响肺癌患者的独立预后因素。将AA表型、性别、年龄、病理类型、淋巴结转移、临床分期等因素引入Cox风险比例回归模型分析,分别探讨吸烟和非吸烟肺癌患者的预后因素,结果显示：吸烟肺癌患者中,高龄患者较低龄患者的生存期短(HR=1.025,95%CI:1.002-1.050)；有淋巴结转移的患者的生存期较无淋巴结转移的患者短(HR=1.547,95%CI:1.173-2.041);处于中晚期的患者的生存期较处于早中期的患者短(HR=5.410,95%CI:3.056-9.578),AA表型的患者的生存期比非AA表型的患者短(HR=1.954,95%CI:1.037-3.684);非吸烟的肺癌患者中,高龄患者较低龄患者的生存期短(HR=1.011,95%CI:1.001-1.021);有淋巴结转移的患者的生存期较无淋巴结转移的患者短(HR=1.175,95%CI:1.035-1.334);处于中晚期的患者的生存期较处于早中期的患者短(HR=5.189,95%CI:3.922-6.864)。结合以上结果,可以看出,年龄、淋巴结转移、临床分期和是否AA表型与吸烟的肺癌患者的预后显著相关,是影响吸烟的肺癌患者的独立预后因素；同时,年龄、淋巴结转移和临床分期与非吸烟的肺癌患者的预后显著相关,是影响非吸烟的肺癌患者的独立预后因素。结论1、AA、AG、GG三组在肺癌人群中生存率的比较差异无显著意义,但在吸烟人群中,患者三组生存率的比较差异有显著意义,AA组的生存曲线有显著下降的趋势。2、AA+AG和GG两组在肺癌人群、吸烟与否的分层因素中其生存率的比较差异均无显著意义。3、AA和AG+GG两组在肺癌人群中生存率的比较差异无显著意义,但在吸烟人群中,患者三组生存率的比较差异有显著意义,AA组的生存曲线有显著下降的趋势。4、性别、年龄、淋巴结转移和临床分期与肺癌患者的预后显著相关,是影响肺癌患者的独立预后因素。5、年龄、淋巴结转移、临床分期和是否AA表型与吸烟的肺癌患者的预后显著相关,是影响吸烟的肺癌患者的独立预后因素；同时,年龄、淋巴结转移和临床分期与非吸烟的肺癌患者的预后显著相关,是影响非吸烟的肺癌患者的独立预后因素。第三部分VTI1A (rs7086803) SNP在非小细胞肺癌易感性与该细胞脂联素受体的相关性研究目的由以上研究结果得出非小细胞肺癌患者VTI1A (rs7086803) SNP的AA基因型罹患肺癌的风险性高,本部分研究其是否通过脂联素受体,引起脂联素的变化,从而导致患肺癌的风险高,为此研究该两者的相关性。方法基于第一、二部分的研究结果,VTI1A (rs7086803) SNP的AA基因型罹患肺癌的风险性较AG及GG基因型高,因此,我们按照入组患者的VTI1A (rs7086803) SNP基因状态的不同,将所有患者分为三组：1)AA组；2)GG组；3)AG组,在887例上述患者中随机抽取72例非小细胞肺癌患者癌组织及癌旁组织的石蜡标本,采用免疫组织化学方法进行染色,然后根据染色情况进行分析。应用SPSS13.0统计软件对数据进行分析；AdipoRl在肺癌组织及癌旁正常肺组织之间的免疫组化表达差异采用Kruskal-Wallis H检验；SNP基因型与蛋白表达之间的相关性采用Spearman's等级相关分析检测；以α=0.05(双侧)为检验水准,P0.05为有统计学意义。2.结果在非小细胞肺癌人群746例中,随机抽取71例患者入组进行分析。在肺癌组织中,携带AA位点的组织其AdipoRl的表达量显著比其它位点的低(mean rank:AA 18.55, AG 25.0, GG 45.76, P 0.001)=在癌旁组织,AdipoR1的表达量与VTI1A(rs7086803)的不同基因位点表达并没有统计学意义(mean rank:AA 37.45, AG 32.80, GG 37.98, P= 0.544)。在肺癌组织中,SNP基因型与蛋白表达之间的等级相关系数为-0.546,P0.001,差别有统计学意义,两变量之间存在负相关关系,即携带AA位点的组织其AdipoRl的表达量显著比其它位点的低；在癌旁组织中,SNP基因型与蛋白表达之间的相关性分析P=0.857,差别无统计学意义,说明两者之间不存在相关关系。结论1、携带AA基因型的组织其AdipoRl蛋白在癌组织中的表达量较其它基因型的低。2、携带AA基因型的组织与AdipoRl的表达可能相关。
【关键词】：非小细胞肺癌 单核苷酸多态性 VTI1A 吸烟状态 预后
【学位授予单位】：南方医科大学
【学位级别】：博士
【学位授予年份】：2015
【分类号】：R734.2
【目录】：

• 摘要3-16
• ABSTRACT16-36
• 前言36-54
• 实验试剂与仪器设备54-56
• 1 实验所用仪器设备54-55
• 2 本实验所用试剂55-56
• 第一部分 检测VTI1A(rs7086803)SNP在中国非小细胞肺癌及正常人群中的表达56-79
• 1 材料56-59
• 2 实验方法59-70
• 3 结果70-79
• 第二部分 VTI1A(rs7086803)SNP表达不同与非小细胞肺癌的吸烟状态及其预后的关系79-94
• 1 材料和方法79-80
• 2 结果80-92
• 3 结论92-94
• 第三部分 VTI1A SNP在非小细胞肺癌易感性与该细胞脂联素受体的相关性研究94-101
• 1 材料和方法94-99
• 2 结果99-100
• 3 结论100-101
• 讨论101-106
• 1 研究结果分析101-104
• 2 研究特色及创新点104-105
• 3 研究不足与展望105-106
• 全文总结106-108
• 参考文献108-117
• 英文缩略词117-119
• 攻读学位期间成果119-121
• 致谢121-123

  本文关键词：非小细胞肺癌VTI1A基因SNP多态性及其相关性研究，，由笔耕文化传播整理发布。

本文编号：407727