半滑舌鳎IGF1和IGF2基因SNP与mRNA表达和生长性状的相关性研究

发布时间：2016-12-18 07:43

  本文关键词：半滑舌鳎IGF1和IGF2基因SNP与mRNA表达和生长性状的相关性研究，由笔耕文化传播整理发布。

《中国海洋大学》 2015年

半滑舌鳎IGF1和IGF2基因SNP与mRNA表达和生长性状的相关性研究

黄政举  

【摘要】：本文以人工养殖的半滑舌鳎(Cynoglossus semilaevis)为实验对象,对半滑舌鳎IGF1和IGF2基因的多态性进行检测,并分析其与激素、生长性状、血液生理生化指标、基因表达的相关性。结果如下：1.雄性半滑舌鳎IGF1基因的SNP与mRNA表达和生长性状的相关性分析胰岛素样生长因子1(IGF1)在鱼类生长内分泌调节过程中发挥着重要的调控作用。本文探究了雄性半滑舌鳎IGF1基因外显子的单核苷酸多态性,并分析了其基因型与生长性状、血液生化指标及mRNA表达的相关性。结果显示,IGF1基因外显子5的884bp处一个位点发生突变,即C884A,此突变发生于终止密码子之后,并且发生在WD40结构域,可能对基因的转录、表达和生长性状产生影响。此位点与体重(P0.05)和去内脏重(P0.05)呈显著相关性,AA基因型的体重和去内脏重显著高于AB基因型(P0.05),AA基因型的尿素含量显著大于AB基因型(P0.05),AA基因型mRNA表达量也显著高于AB基因型(P0.01)。研究表明,IGF1基因编码区的多态性对半滑舌鳎生长性状、血液生化指标和基因表达有显著影响,可以作为选择育种的一种分子标记,从遗传学的角度辅助半滑舌鳎优良品种的分子选育,提高半滑舌鳎优良品种的产量。2.雌性半滑舌鳎IGFl基因SNP与mRNA表达和生长性状的相关性分析本研究中,运用SSCP和DNA测序方法检测了雌性半滑舌鳎IGF1基因外显子的单核苷酸多态性(SNPs),并分析其基因型与生长性状及基因表达的相关性。结果显示,雌性IGF1基因突变位点与雄性一致,也是外显子5的884bp处,即C884A,此突变发生于终止密码子之后,并且发生在WD40结构域,可能对基因的转录、表达和生长性状产生影响。此位点与体重(P0.01)和去内脏重(P0.01)呈显著相关性。与雄性相反,雌性半滑舌鳎个体的AB基因型个体的体重和去内脏重显著高于AA基因型(P0.01),AB基因型的mRNA表达量也显著高于AA基因型(P0.01)。另外,AB基因型个体在体高、性腺指数等方面高于AA基因型,但是这种变化无显著相关性(P0.05)。这些结果显示,IGF1基因编码区的多态性可以作为一类很好分子标记用于遗传标记辅助选育。3.雌雄性半滑舌鳎IGF2基因SNP与mRNA表达和生长性状的相关性分析在鱼类中,类胰岛素生长因子2(IGF2)与其生长内分泌调控有关。研究发现雄性半滑舌鳎1GF2基因有两个突变(多态性1和多态性2),通过这两个突变建立了四个二倍型(D1、D2、D3和D4)。但是,多态性1在翻译过程中修复了。多态性2对于体重(P0.01)、去内脏重(P0.01)和肝重(P0.05)有着显著影响。T检验结果表明,多态性2的AA基因型个体的体重(P0.01)、去内脏重(P0.01)和肝重(P0.05)显著高于AB基因型。二倍型个体D2和D4的体重(P0.05)、去内脏重(P0.01)显著高于D1。AA基因型个体的总蛋白(TP)显著高于AB基因型个体(P0.05)。除此以外,AA基因型个体的mRNA表达水平也显著高于AB基因型个体(P0.01)。二倍型个体D2和D4的相关表达水平也是显著高于D1(P0.05)。雌性半滑舌鳎的多态性位点1与雄性相同,无多态性位点2。综上所述,半滑舌鳎IGF2基因编码区的多态性的研究表明,雄性IGF2基因的SNP与生长性状、血液生化和基因表达显著相关,本研究对于鱼类生长分子生物学的研究具有一定的参考价值。

【关键词】：
【学位授予单位】：中国海洋大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2015
【分类号】：S917.4
【目录】：

摘要5-7

Abstract7-13

引言13-15

第一章 文献综述15-24

1 半滑舌鳎的简介15-16

1.1 半滑舌鳎的生物学特性15

1.2 半滑舌鳎的研究现状15-16

2 分子标记及其检测方法16-19

2.1 分子标记的研究16-17

2.2 SNP的研究及检测方法17-19

3 基因SNP与生长和表达的研究19-21

3.1 IGF1和IGF2基因的结构和功能19-20

3.2 鱼类IGF1基因SNP与生长和表达相关性20

3.3 鱼类IGF1基因SNP与生长和表达的相关性20-21

4 鱼类血液生理生化的研究21-22

4.1 鱼类的血液生理生化指标21

4.2 鱼类的血液生理生化的影响因素21-22

4.3 基因多态性与血液生理生化相关性的研究进展22

5 本研究的立项依据与研究意义22-24

第二章 雄性半滑舌鳎IGF1基因的SNP与mRNA表达和生长性状的相关性分析24-37

1 材料和方法25-29

1.1 材料25

1.2 方法25-29

1.3 统计学分析29

2 结果29-34

2.1 DNA提取及纯度检测29

2.2 PCR检测结果29-30

2.3 PCR-SSCP检测30

2.4 各基因型序列30-31

2.5 突变位点的基因结构31

2.6 基因型和性状的相关性分析31-33

2.7 血液生理生化与性状的相关性分析33

2.8 基因的表达和相关性分析33-34

3 讨论34-36

4 小结36-37

第三章 雌性半滑舌鳎IGF1基因SNP与mRNA表达和生长性状的相关性分析37-45

1 材料和方法37-38

1.1 材料37

1.2 方法37-38

1.3 统计学分析38

2 结果38-43

2.1 DNA提取及纯度检测38

2.2 PCR扩增38-39

2.3 PCR-SSCP检测39-40

2.4 各基因型序列40

2.5 突变位点的基因结构40-41

2.6 基因型和性状的相关性分析41-42

2.7 表达结果42-43

3 讨论43-44

4 小结44-45

第四章 雌雄性半滑舌鳎IGF2基因SNP与mRNA表达和生长性状的相关性分析45-60

1 材料和方法46-47

1.1 材料46

1.2 方法46-47

1.3 统计学分析47

2 结果47-56

2.1 DNA提取及纯度检测47-48

2.2 琼脂糖检测结果48

2.3 IGF2基因编码区域的多态性48-50

2.4 基因型频率和二倍体基因型频率50-51

2.5 多态性与生长性状的相关性51-54

2.6 基因型与血液生化指标的关系54

2.7 不同基因型的mRNA 的表达情况54-56

2.8 不同基因型的DNA和cDNA序列比较56

3 讨论56-59

4 小结59-60

参考文献60-71

附录71-72

致谢72-73

个人简历73

发表学术论文73

下载全文 更多同类文献

CAJ全文下载

(如何获取全文？ 欢迎：购买知网充值卡、在线充值、在线咨询)

CAJViewer阅读器支持CAJ、PDF文件格式

【参考文献】

中国期刊全文数据库 前10条

1 范炜;殷红;李春风;初晓辉;黎小青;徐志强;陈小波;葛长荣;贾俊静;;胰岛素样生长因子1调节生长发育的研究进展[J];黑龙江畜牧兽医;2013年01期

2 李虎;陈四清;刘海金;姜宏波;王美玉;;半滑舌鳎养殖群体的性比与雌雄形态差异比较[J];水产学报;2012年09期

3 刘小献;白俊杰;徐磊;于凌云;樊佳佳;韩林强;;草鱼GSTR基因外显子1、外显子2的SNPs筛选及其与生长性状的关联分析[J];华中农业大学学报;2011年06期

4 房景辉;田相利;姜海滨;刘相全;张锡佳;韦秀梅;董双林;;不同循环投喂模式对半滑舌鳎的生长、体成分组成、代谢和能量收支的影响[J];水产学报;2011年07期

5 陈洁;熊邦喜;顾钱洪;黄瑾;;内源及外源因子对鱼类血液生理生化指标的影响[J];湖北农业科学;2011年09期

6 谭新;童金苟;;SNPs及其在水产动物遗传学与育种学研究中的应用[J];水生生物学报;2011年02期

7 ;Single Nucleotide Polymorphism of FSHβ Gene Associated with Reproductive Traits in Japanese Flounder (Paralichthys olivaceus)[J];Journal of Ocean University of China;2010年04期

8 ;Effects of Dietary Lysine on Growth Performance, Serum Concentrations of Insulin-Like Growth Factor-I (IGF-I) and IGF-I mRNA Expression in Growing Rabbits[J];Agricultural Sciences in China;2010年06期

9 张晓彦;刘海金;;17β-雌二醇对半滑舌鳎性分化和生长的影响[J];东北农业大学学报;2009年06期

10 董晓煜;张秀梅;张沛东;;溶解氧与养殖密度对褐牙鲆幼鱼血细胞数量及血红蛋白含量影响的研究[J];海洋水产研究;2008年06期

中国硕士学位论文全文数据库 前5条

1 赵君丽;雄性半滑舌鳎GH//IGF-I轴相关基因SNP和DNA甲基化与生长的相关性研究[D];中国海洋大学;2014年

2 房子恒;不同盐度对半滑舌鳎幼鱼生长的影响及其生理生态学机制的研究[D];中国海洋大学;2013年

3 马瑞芹;牙鲆三种细胞色素P450酶基因SNP与繁殖内分泌相关性分析[D];中国海洋大学;2012年

4 韩娜娜;半滑舌鳎和塞内加尔鳎血液生理生化指标的研究[D];中国海洋大学;2011年

5 张鑫磊;半滑舌鳎胚胎发育及幼鱼营养需求的研究[D];中国海洋大学;2006年

【共引文献】

中国期刊全文数据库 前10条

1 傅建军;张猛;沈玉帮;陈勇;徐晓雁;李家乐;;草鱼PRL基因多态性与幼鱼生长性状和肌肉成分的关联分析[J];中国水产科学;2016年03期

2 宋奔奔;单建军;吴凡;;一种新型管式曝气装置的设计与试验[J];渔业现代化;2016年02期

3 马从国;赵德安;王建国;;基于故障树分析的增氧机控制系统可靠性动态风险评价[J];中国农机化学报;2016年04期

4 张猛;陈勇;沈玉帮;傅建军;徐晓雁;孙俊龙;胡默俨;李家乐;;草鱼MSTN-1基因多态性及与早期生长性状和肌肉成分关联分析[J];水产学报;2016年04期

5 郭海燕;于丽娟;王川;黄自豪;陈幕飞;陈冬明;张耀光;;五倍子对中华倒刺鲃幼鱼血液生理生化指标的影响[J];西南大学学报(自然科学版);2016年03期

6 王春晓;卢迈新;高风英;刘志刚;曹建萌;朱华平;可小丽;王淼;叶星;叶卫;;尼罗罗非鱼ghrelin基因的多态性及其与生长性状相关SNP位点的筛选[J];水生生物学报;2016年01期

7 聂广锋;李加儿;区又君;王鹏飞;温久福;汤清亮;;间歇性投喂模式对梭鱼幼鱼消化系统发育及形态行为的影响[J];水产学报;2015年12期

8 付晶晶;黄燕华;曹俊明;王国霞;莫文艳;陈晓瑛;黄文庆;;五种植物蛋白源替代鱼粉对花鲈血清生化指标、转氨酶活性及抗氧化应激参数的影响[J];湖北农业科学;2015年20期

9 强俊;杨弘;马昕羽;王辉;徐跑;何杰;朱志祥;;基于响应曲面法研究亚硝酸盐与养殖密度对吉富罗非鱼幼鱼生长与肝脏抗氧化力的影响[J];海洋与湖沼;2015年05期

10 黄政举;何峰;温海深;李吉方;司玉凤;赵君丽;任源远;邢德;徐捷凯;;半滑舌鳎IGF1基因编码区的多态性与生长性状及表达的相关性分析[J];中国海洋大学学报(自然科学版);2015年08期

中国硕士学位论文全文数据库 前10条

1 邢淑娟;饲料糖水平对大黄鱼生长和代谢的影响[D];中国海洋大学;2015年

2 黄政举;半滑舌鳎IGF1和IGF2基因SNP与mRNA表达和生长性状的相关性研究[D];中国海洋大学;2015年

3 刘迎隆;不同添加量的糖对军曹鱼生长代谢的影响[D];中国海洋大学;2014年

4 程民杰;棕榈油替代鱼油对半滑舌鳎生长、生理生化和肌肉营养品质影响的研究[D];天津农学院;2014年

5 程春;黄鳝血液生理生化指标的研究[D];江西农业大学;2014年

6 赵君丽;雄性半滑舌鳎GH//IGF-I轴相关基因SNP和DNA甲基化与生长的相关性研究[D];中国海洋大学;2014年

7 肖登元;饲料中不同水平维生素A、C、E对半滑舌鳎亲鱼繁殖性能及后代质量的影响[D];上海海洋大学;2014年

8 马静;赖氨酸和蛋氨酸强化卤虫对半滑舌鳎稚鱼生长、消化酶及相关激素水平的影响[D];上海海洋大学;2012年

9 李华;半滑舌鳎维生素C及牙鲆、大菱鲆胆碱营养生理研究[D];中国海洋大学;2011年

10 代伟伟;半滑舌鳎赖氨酸需求及其蛋白源替代研究[D];中国海洋大学;2011年

【二级参考文献】

中国期刊全文数据库 前10条

1 ;Single Nucleotide Polymorphism of FSHβ Gene Associated with Reproductive Traits in Japanese Flounder (Paralichthys olivaceus)[J];Journal of Ocean University of China;2010年04期

2 杨明飞;冉雪琴;王嘉福;;BMP2、Noggin和IGF-1对成骨细胞的调节作用[J];广东医学;2010年14期

3 刘海金;刘永新;王玉芬;侯吉伦;王桂兴;孙朝徽;张晓彦;;牙鲆减数分裂与有丝分裂雌核发育的遗传差异[J];水产学报;2010年06期

4 季相山;陈松林;马洪雨;姜运良;杨景峰;董晓丽;;半滑舌鳎养殖群体中自然性逆转伪雄鱼的发现[J];水产学报;2010年02期

5 韩加凤;华雪铭;黄旭雄;王军;于宁;周洪琪;;壳聚糖投喂方式对草鱼抗饥饿胁迫能力的影响[J];水产学报;2010年03期

6 刘福平;白俊杰;叶星;李胜杰;李小慧;于凌云;;罗非鱼MC4R基因克隆及与其生长相关的SNPs位点[J];中国水产科学;2009年06期

7 张晓彦;刘海金;;17β-雌二醇对半滑舌鳎性分化和生长的影响[J];东北农业大学学报;2009年06期

8 ;Methods Comparison for Microsatellite Marker Development:Different Isolation Methods,Different Yield Efficiency[J];Journal of Ocean University of China;2009年02期

9 孟繁伊;黄权;郝凤奇;;不同年龄花羔红点鲑肌肉成分和血液指标的比较研究[J];中国水产科学;2009年01期

10 董晓煜;张秀梅;张沛东;;溶解氧与养殖密度对褐牙鲆幼鱼血细胞数量及血红蛋白含量影响的研究[J];海洋水产研究;2008年06期

中国硕士学位论文全文数据库 前3条

1 马瑞芹;牙鲆三种细胞色素P450酶基因SNP与繁殖内分泌相关性分析[D];中国海洋大学;2012年

2 冯兴无;中华倒刺鲃肌肉溃烂病的研究[D];西南大学;2008年

3 刘巧;不同倍性鱼类血细胞研究[D];湖南师范大学;2005年

【相似文献】

中国期刊全文数据库 前10条

1 李全海;十里海半滑舌鳎繁育成功[J];渔业致富指南;2005年21期

2 吕俊峰;半滑舌鳎繁育成功[J];中国农村小康科技;2003年03期

3 吕俊峰;海水养殖新品种——半滑舌鳎[J];农村百事通;2004年23期

4 ;养殖新品种—半滑舌鳎[J];天津水产;2005年04期

5 张守本;张志;任玉水;;半滑舌鳎的研究现状及发展前景[J];科学养鱼;2006年09期

6 徐勇;张修峰;曲克明;马绍赛;李健;宋德敬;;不同溶氧条件下亚硝酸盐和氨氮对半滑舌鳎的急性毒性效应[J];海洋水产研究;2006年05期

7 牛化欣;常杰;马甡;王莉;;半滑舌鳎生物学及养殖生态学研究进展[J];水产科学;2007年07期

8 李静;陈松林;邓思平;田永胜;沙珍霞;王清印;庄志猛;徐建勇;温海深;;半滑舌鳎雌性特异扩增片段长度多态性标记的筛选与应用[J];水产学报;2007年05期

9 孙业盈;张全启;齐洁;陈妍婕;李春梅;钟其旺;王志刚;;半滑舌鳎的一种细胞凋亡抑制因子的克隆、鉴定与分析[J];中国海洋大学学报(自然科学版);2008年06期

10 邓思平;陈松林;刘本伟;;半滑舌鳎FTZ-F1 cDNA克隆及表达分析(英文)[J];动物学研究;2008年06期

中国重要会议论文全文数据库 前10条

1 陈松林;李静;邓思平;徐建勇;田永胜;沙珍霞;王清印;庄志猛;;半滑舌鳎性别相关分子标记和功能基因的克隆及其在性别控制中的应用[A];2007年中国水产学会学术年会暨水产微生态调控技术论坛论文摘要汇编[C];2007年

2 马骞;柳淑芳;庄志猛;唐启升;;半滑舌鳎生长激素及其受体基因的原核表达[A];中国海洋湖沼学会鱼类学分会、中国动物学会鱼类学分会2012年学术研讨会论文摘要汇编[C];2012年

3 陈松林;邓思平;田永胜;徐建勇;杨景峰;王清印;季相山;邓寒;翟介明;刘寿堂;;半滑舌鳎分子标记辅助性别控制技术的建立与应用[A];2007年中国水产学会学术年会暨水产微生态调控技术论坛论文摘要汇编[C];2007年

4 张正;李彬;王印庚;廖梅杰;王岚;荣小军;;养殖半滑舌鳎体表溃疡的组织病理学观察[A];中国水产学会鱼病专业委员会2013年学术研讨会论文摘要汇编[C];2013年

5 王旭波;张全启;齐洁;王志刚;王兴莲;;半滑舌鳎(Cynoglossus semilaevis)W性染色体基因组的初步研究及其在育种上的应用[A];2008年中国水产学会学术年会论文摘要集[C];2008年

6 田永胜;陈松林;邵长伟;刘本伟;;鲈鱼冷冻精子在不同条件下诱导半滑舌鳎胚胎发育比较[A];2007年中国水产学会学术年会暨水产微生态调控技术论坛论文摘要汇编[C];2007年

7 李晋;史成银;耿伟光;王胜强;粟子丹;黄倢;张庆利;;半滑舌鳎病毒性神经坏死病病原的研究[A];2013年中国水产学会学术年会论文摘要集[C];2013年

8 沙珍霞;章翔;丁少雄;陈松林;;半滑舌鳎鳗弧菌感染前后的免疫相关组织转录组分析[A];中国海洋湖沼学会鱼类学分会、中国动物学会鱼类学分会2012年学术研讨会论文摘要汇编[C];2012年

9 王旭波;张全启;庄伟;翟腾;王志刚;齐洁;王兴莲;;半滑舌鳎(Cynoglossus semilaevis)雌鱼基因组研究[A];中国遗传学会第八次代表大会暨学术讨论会论文摘要汇编（2004-2008）[C];2008年

10 柳淑芳;马慧;马骞;庄志猛;;半滑舌鳎早期发育过程中骨骼发育及骨骼畸形[A];中国海洋湖沼学会鱼类学分会、中国动物学会鱼类学分会2012年学术研讨会论文摘要汇编[C];2012年

中国重要报纸全文数据库 前10条

1 特约通讯员 梁锦秋;[N];广东科技报;2006年

2 王玉峰;[N];中国渔业报;2004年

3 驻嵊泗记者 郑元丹　通讯员 胡园园 鲍后龙;[N];舟山日报;2011年

4 王玉峰;[N];中国渔业报;2005年

5 黄海所;[N];中国渔业报;2007年

6 蒋怡;[N];中国渔业报;2009年

7 孙德强;[N];中国渔业报;2005年

8 记者 谭大跃　通讯员 王静思 郭中丹;[N];深圳特区报;2010年

9 姜英俊;[N];中国渔业报;2011年

10 本报记者 郝玉玲;[N];中国渔业报;2005年

中国博士学位论文全文数据库 前10条

1 刘峰;半滑舌鳎经济性状的遗传评估及基因组选择初步研究[D];上海海洋大学;2015年

2 龙昊;半滑舌鳎（Cynoglossus semilaevis）免疫相关基因HMGB2和IFIT1功能研究[D];中国科学院研究生院(海洋研究所);2015年

3 张正;养殖半滑舌鳎常见疾病的病理学观察与感染微生态分析[D];中国海洋大学;2012年

4 孙业盈;半滑舌鳎性腺差异表达基因的克隆鉴定与表达分析[D];中国海洋大学;2008年

5 郑媛;半滑舌鳎（Cynoglossus semilaevis）细胞培养及细胞系建立研究[D];中国海洋大学;2012年

6 邵长伟;半滑舌鳎（Cynoglossus semilaevis）性别决定的基因组学研究[D];中国海洋大学;2012年

7 吴莹莹;半滑舌鳎精子发生及其受精过程[D];中国海洋大学;2008年

8 庄志猛;半滑舌鳎早期发育生物学与种质资源研究[D];中国海洋大学;2006年

9 姜黎明;半滑舌鳎遗传连锁图谱的构建及染色体定位的初步研究[D];中国海洋大学;2013年

10 陈彩芳;四种细胞色素P450酶在半滑舌鳎繁殖生理机能中的作用研究[D];中国海洋大学;2010年

中国硕士学位论文全文数据库 前10条

1 赵敏;饲料中不同水平牛磺酸和磷虾粉对半滑舌鳎繁殖性能及后代质量的影响[D];上海海洋大学;2015年

2 邢贺飞;半滑舌鳎抗病相关SNP标记的筛选及两种免疫相关基因的克隆与初步分析[D];上海海洋大学;2015年

3 吴娅红;半滑舌鳎LGR8基因克隆和CSW3基因的功能验证[D];上海海洋大学;2015年

4 修旺珊;半滑舌鳎DKKL-1基因的克隆与表达分析[D];大连海洋大学;2015年

5 向晋松;半滑舌鳎补体调控因子I的鉴定、重组表达、功能分析及C3-1基因的初步研究[D];上海海洋大学;2015年

6 宋超;半滑舌鳎性别分化的遗传特性研究[D];甘肃农业大学;2015年

7 史学营;养殖半滑舌鳎无眼侧黑化机制的初步研究[D];上海海洋大学;2015年

8 刘田田;半滑舌鳎(Cynoglossus semilaevis）R-spondin1和R-spondin3基因的克隆与表达分析[D];中国海洋大学;2015年

9 杨芳;半滑舌鳎（Cynoglossus semilaevis）R-spondin2基因的分子克隆、表达模式及其在肌肉发育过程中功能的初步探究[D];中国海洋大学;2015年

10 黄政举;半滑舌鳎IGF1和IGF2基因SNP与mRNA表达和生长性状的相关性研究[D];中国海洋大学;2015年

  本文关键词：半滑舌鳎IGF1和IGF2基因SNP与mRNA表达和生长性状的相关性研究，由笔耕文化传播整理发布。

，

本文编号：218418