陆地棉产量性状的全基因组关联分析
发布时间：2021-10-02 01:06
棉花作为重要的经济作物,在纺织业和食用油利用中发挥着巨大的作用。培育高产优质棉、打破棉花产量瓶颈一直是我国育种家的目标,挖掘产量相关基因具有重要意义。本研究构建了349份陆地棉种质资源的自然群体,通过10×重测序技术对陆地棉全基因组变异检测,结合两年两点共三个环境12个产量性状表型数据进行全基因组关联分析,挖掘产量性状相关SNP位点,为后续陆地棉产量性状遗传基础解析提供基础。主要结果如下:1.产量性状的变异分析和相关性分析:铃数、总生殖数、单株籽棉产量、棉柴比这四个性状在多环境下变异系数均较大,表型数据存在广泛变异。产量相关性状间相关性较复杂,株高、果枝数、果枝节位、铃数、总生殖数等多数产量相关数据与产量间呈正相关关系,汇总三个环境和BLUP值中产量性状与产量间相关性,其相关系数排序为铃数>总生殖数>铃重>果枝数>株高>铃壳重>子指>衣分。2.群体结构和连锁不平衡分析:通过平均深度为11.65×的重测序,共产生了25Tb数据和198万个高质量SNP位点,利用构建系统发育树、主成分分析和ADMIXTURE软件进行群体结构分析,综合分析结果将349...
【文章来源】：山西大学山西省
【文章页数】：61 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
我国棉花种植面积、单产、总产变化趋势（2005-2018年）
第一章文献综述9传变异，利用生物信息学和统计方法研究该自然群体群体结构，消除全基因组关联分析中的假阳性，表型数据与基因组数据相结合，通过全基因组关联分析，挖掘与产量性状相关SNP位点，为陆地棉种质创新和分子聚合育种打好基矗1.4.2技术路线图1.2技术路线图Figure1.2Technologyroadmap
陆地棉产量性状的全基因组关联分析14本一致，在2018年石家庄中均值较小，铃壳重的分布在地点上存在差异。子指在三环境间分布情况较为一致。衣分在2019年运城中均值最高，在2018年石家庄和2018年运城间分布范围和均值差别较小，衣分在地点间的分布差异较大。单株籽棉产量在2018年运城中分布范围最广，均值最大。棉柴比在2018年石家庄中均值最小，而2018年运城和2019年运城棉柴比均值均大于1，说明在石家庄地区棉花有轻微徒长，在运城地区陆地棉种植中存在早衰的现象，尤其是在2019年运城中早衰现象更为严重。图2.1产量性状多环境分布情况Figure2.1Multi-environmentdistributionofyieldtraits
【参考文献】：
期刊论文
[1]Genetic variations in plant architecture traits in cotton（Gossypium hirsutum） revealed by a genomewide association study[J]. Tianwang Wen,Baosheng Dai,Tao Wang,Xinxin Liu,Chunyuan You,Zhongxu Lin. The Crop Journal. 2019(02)
[2]我国2007―2018年转基因抗虫棉品种审定情况评析[J]. 梁晋刚,姜伟丽,宋贤鹏,王丽,朱香镇,张秀杰,马艳. 中国棉花. 2019(04)
[3]中国棉花产业发展现状及展望[J]. 卢秀茹,贾肖月,牛佳慧. 中国农业科学. 2018(01)
[4]陆地棉常规品种(系)与杂交组合性状相关性的比较分析[J]. 罗海华,邵德意,陈功,徐秀敏,高欣,袁长凯,彭金剑,汤飞宇. 作物杂志. 2017(05)
[5]机采棉杂交后代主要株型性状与产量和品质的关系[J]. 齐海坤,严根土,王宁,乔文青,石建斌,许庆华,周红,黄群. 棉花学报. 2017(05)
[6]我国棉花生产成本与收益分析[J]. 李培良,魏晓文. 中国棉花. 2017(02)
[7]中国棉花高产育种研究进展[J]. 喻树迅,范术丽,王寒涛,魏恒玲,庞朝友. 中国农业科学. 2016(18)
[8]2001～2014年河北省中熟转基因抗虫棉品种主要性状改良分析[J]. 田海燕,崔瑞敏,李俊兰,崔淑芳,刘志芳,王广恩,周永萍. 河北农业科学. 2016(05)
[9]“十三五”时期我国重要农产品消费趋势、影响与对策[J]. 张雯丽,沈贵银,曹慧,徐雪高,王慧敏. 农业经济问题. 2016(03)
[10]陆地棉表型性状与主要育种性状的相关性分析[J]. 刘存敬,江振兴,师树新,张建宏,唐丽媛,田海燕,崔瑞敏,张素君,张香云. 河北农业科学. 2015(04)
博士论文
[1]陆地棉早熟与产量纤维品质性状的全基因组关联分析及候选基因筛选[D]. 宿俊吉.西北农林科技大学 2017
[2]短季棉遗传多样性分析及其重要农艺和经济性状的QTL定位[D]. 于霁雯.华中农业大学 2006
硕士论文
[1]陆地棉衣分性状的全基因组关联分析及候选基因的鉴定[D]. 宋成祥.长江大学 2019
本文编号：3417698
【文章来源】：山西大学山西省
【文章页数】：61 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
我国棉花种植面积、单产、总产变化趋势（2005-2018年）
第一章文献综述9传变异，利用生物信息学和统计方法研究该自然群体群体结构，消除全基因组关联分析中的假阳性，表型数据与基因组数据相结合，通过全基因组关联分析，挖掘与产量性状相关SNP位点，为陆地棉种质创新和分子聚合育种打好基矗1.4.2技术路线图1.2技术路线图Figure1.2Technologyroadmap
陆地棉产量性状的全基因组关联分析14本一致，在2018年石家庄中均值较小，铃壳重的分布在地点上存在差异。子指在三环境间分布情况较为一致。衣分在2019年运城中均值最高，在2018年石家庄和2018年运城间分布范围和均值差别较小，衣分在地点间的分布差异较大。单株籽棉产量在2018年运城中分布范围最广，均值最大。棉柴比在2018年石家庄中均值最小，而2018年运城和2019年运城棉柴比均值均大于1，说明在石家庄地区棉花有轻微徒长，在运城地区陆地棉种植中存在早衰的现象，尤其是在2019年运城中早衰现象更为严重。图2.1产量性状多环境分布情况Figure2.1Multi-environmentdistributionofyieldtraits
【参考文献】：
期刊论文
[1]Genetic variations in plant architecture traits in cotton（Gossypium hirsutum） revealed by a genomewide association study[J]. Tianwang Wen,Baosheng Dai,Tao Wang,Xinxin Liu,Chunyuan You,Zhongxu Lin. The Crop Journal. 2019(02)
[2]我国2007―2018年转基因抗虫棉品种审定情况评析[J]. 梁晋刚,姜伟丽,宋贤鹏,王丽,朱香镇,张秀杰,马艳. 中国棉花. 2019(04)
[3]中国棉花产业发展现状及展望[J]. 卢秀茹,贾肖月,牛佳慧. 中国农业科学. 2018(01)
[4]陆地棉常规品种(系)与杂交组合性状相关性的比较分析[J]. 罗海华,邵德意,陈功,徐秀敏,高欣,袁长凯,彭金剑,汤飞宇. 作物杂志. 2017(05)
[5]机采棉杂交后代主要株型性状与产量和品质的关系[J]. 齐海坤,严根土,王宁,乔文青,石建斌,许庆华,周红,黄群. 棉花学报. 2017(05)
[6]我国棉花生产成本与收益分析[J]. 李培良,魏晓文. 中国棉花. 2017(02)
[7]中国棉花高产育种研究进展[J]. 喻树迅,范术丽,王寒涛,魏恒玲,庞朝友. 中国农业科学. 2016(18)
[8]2001～2014年河北省中熟转基因抗虫棉品种主要性状改良分析[J]. 田海燕,崔瑞敏,李俊兰,崔淑芳,刘志芳,王广恩,周永萍. 河北农业科学. 2016(05)
[9]“十三五”时期我国重要农产品消费趋势、影响与对策[J]. 张雯丽,沈贵银,曹慧,徐雪高,王慧敏. 农业经济问题. 2016(03)
[10]陆地棉表型性状与主要育种性状的相关性分析[J]. 刘存敬,江振兴,师树新,张建宏,唐丽媛,田海燕,崔瑞敏,张素君,张香云. 河北农业科学. 2015(04)
博士论文
[1]陆地棉早熟与产量纤维品质性状的全基因组关联分析及候选基因筛选[D]. 宿俊吉.西北农林科技大学 2017
[2]短季棉遗传多样性分析及其重要农艺和经济性状的QTL定位[D]. 于霁雯.华中农业大学 2006
硕士论文
[1]陆地棉衣分性状的全基因组关联分析及候选基因的鉴定[D]. 宋成祥.长江大学 2019
本文编号：3417698
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