基于PCR-DGGE分析宣威火腿的细菌群落结构

发布时间：2021-09-03 19:37

　　以不同加工年份（1年、2年和3年）的宣威火腿为对象,采用聚合酶链式反应-变性梯度凝胶电泳（polymerase chain reaction-denaturing gradient gel electrophorsis,PCR-DGGE）技术,通过PCR扩增、优势条带切胶、克隆测序等研究不同加工年份宣威火腿表面及内部的细菌群落结构及多样性,为进一步研究宣威火腿品质提供理论依据。结果表明:马胃葡萄球菌、木糖葡萄球菌、表皮葡萄球菌、戊糖葡萄球菌等葡萄球菌属以及嗜盐四联球菌、变异微球菌等是宣威火腿中的主要细菌,其中葡萄球菌属和嗜盐四联球菌分别为宣威火腿中的优势菌属与优势菌种;宣威火腿中还检测出了未培养细菌。多样性分析表明,加工3年的宣威火腿表面细菌群落多样性最高,加工1年火腿表面细菌群落多样性最低。加工3年火腿内部细菌群落多样性最高,加工2年火腿内部细菌群落多样性最低。 

【文章来源】：食品研究与开发. 2020,41(23)北大核心

【文章页数】：7 页

【部分图文】：

宣威火腿样品细菌DNA电泳图

宣威火腿样品细菌组16S r DNA的PCR扩增结果见图2。以GC-338F和518R为引物，从不同加工年份宣威火腿的表面和内部6个样品中提取的总DNA为模板进行16S r DNA片段扩增，得到200 bp的DNA片段（图2），所有样品条带清晰，符合DGGE分析。

用DGGE图谱中条带数来反映细菌多样性，泳道中各条带均代表一种不同的细菌，条带亮度用来反映细菌的丰富度[16]。由图3和图4可以看出，明显分离的条带有40条，显示出宣威火腿中丰富的细菌种类，其中1年腿表面有16个主要条带，内部有16个；2年腿表面有23个，内部有15个；3年腿表面有29个，内部有22个，多数条带为每个泳道共有，说明有共有的细菌类型存在于不同加工年份宣威火腿表面和内部。另外共有条带的亮度也存在一定的差异，说明其中细菌群落数量存在差异。图4 宣威火腿样品的DGGE条带强度示意图

【参考文献】：
期刊论文
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博士论文
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硕士论文
[1]饲养密度对笼养蛋鸡小肠组织结构和盲肠细菌种群的影响[D]. 赵乾宇.黑龙江八一农垦大学 2015



本文编号：3381735