基于高通量测序技术巴彦淖尔市酸粥中细菌多样性分析
发布时间：2021-09-30 20:31
采用Illumina Mi Seq高通量测序技术对采集自内蒙古自治区巴彦淖尔市的10份酸粥样品中的细菌多样性进行解析,同时基于细菌属水平对其进行围绕中心点的划分（PAM）,并基于PICRUSt和Bug Base软件对细菌的基因功能及表型进行预测。结果表明,所有酸粥样品中的细菌隶属于9个细菌门的55个属,样品间细菌多样性和丰度存在明显差异,但优势细菌门均为硬壁菌门（Firmicutes）和变形菌门（Proteobacteria）,优势细菌属均为乳杆菌属（Lactobacillus）和醋杆菌属（Acetobacter）。所有酸粥样品可分为两个聚类,聚类I以醋杆菌属（Acetobacter）为主,聚类II以乳杆菌属（Lactobacillus）为主;两个聚类中细菌对于碳水化合物的利用和细菌的生长繁殖等存在显著差异（P<0.05）,隶属于聚类I的酸粥样品中,其细菌的代谢和繁殖更加迅速。
【文章来源】：中国酿造. 2020,39(09)北大核心
【文章页数】：5 页
【部分图文】：
酸粥样品中优势菌门和优势菌属相对含量的比较分析
进一步对酸粥样本中OTU出现的频率和平均相对含量进行分析，以便于对酸粥样品中的核心细菌类群进行研究，结果见图2。由图2可知，独有OTU数（仅在一个样品中出现）占总数的88.26%，拥有序列数3 900条，占全部序列数的1.81%。而在所有样品中出现的OTU数为0。由图2亦可知，酸粥样品中共有OTU（在80%的样品中出现）数有6个，其所包含的序列数占全部序列数的10.08%，其中醋杆菌属、农杆菌属（Agrostis）和乳杆菌属的平均相对含量分别为9.01%、0.55%和0.45%。由此说明，虽然酸粥样本中存在大量的核心菌群，但每份样本中均存在许多独特的细菌类型。酸粥中乳杆菌属平均相对含量>60%，但其共有OTU的比例<0.50%，说明酸粥中隶属于乳杆菌属的细菌在种或株水平上存较大的差异。
由图3可知，酸粥在两份坐标轴的空间排布并不相同，图3a坐标轴中的样本在空间排布上较为分散，而图3b坐标轴中的样本在空间排布上呈现明显的聚类趋势。由此说明，酸粥中存在着许多低丰度物种，且不同样本中低丰度物种之间存在着较大差异，而不同酸粥样本中优势菌的差异却相对较小。为进一步探究不同酸粥样本在属水平上的差异，本研究基于属水平对10份酸粥样品进行PAM分析，结果见图4。
【参考文献】：
期刊论文
[1]传统清香型白酒发酵过程中细菌群落结构及其动态演替[J]. 贾丽艳,荆旭,田宇敏,王晓勇,刘帅,耿添霈,韩英. 中国食品学报. 2020(02)
[2]基于高通量测序的缢蛏及其养殖池塘菌群结构的季节变化[J]. 王鑫毅,谢骁,金珊,竺俊全,赵青松,周素明. 应用生态学报. 2019(12)
[3]传统食品酸粥的发酵工艺[J]. 秦慧彬,黄志伟,张志强,张茜茜,李东航,乔治军,杨洪江. 食品与发酵工业. 2019(17)
[4]退化和正常窖泥微生物多样性的比较分析[J]. 郭壮,葛东颖,尚雪娇,刘文汇,杨少勇,张振东. 食品工业科技. 2018(22)
[5]基于Mi Seq高通量测序技术内蒙古地区酸粥细菌多样性研究[J]. 王玉荣,折米娜,刘康玲,张振东,双全. 食品工业科技. 2018(19)
[6]鲊广椒细菌多样性评价及其对风味的影响[J]. 王玉荣,沈馨,董蕴,尚雪娇,郭壮. 食品与机械. 2018(04)
[7]内蒙古西部地区自然发酵酸粥化学成分及微生物组成分析[J]. 薛建岗,陈永福,于海静,张和平. 食品科技. 2013(07)
博士论文
[1]传统发酵乳中细菌多样性及其功能基因研究[D]. 姚国强.内蒙古农业大学 2017
本文编号：3416587
【文章来源】：中国酿造. 2020,39(09)北大核心
【文章页数】：5 页
【部分图文】：
酸粥样品中优势菌门和优势菌属相对含量的比较分析
进一步对酸粥样本中OTU出现的频率和平均相对含量进行分析，以便于对酸粥样品中的核心细菌类群进行研究，结果见图2。由图2可知，独有OTU数（仅在一个样品中出现）占总数的88.26%，拥有序列数3 900条，占全部序列数的1.81%。而在所有样品中出现的OTU数为0。由图2亦可知，酸粥样品中共有OTU（在80%的样品中出现）数有6个，其所包含的序列数占全部序列数的10.08%，其中醋杆菌属、农杆菌属（Agrostis）和乳杆菌属的平均相对含量分别为9.01%、0.55%和0.45%。由此说明，虽然酸粥样本中存在大量的核心菌群，但每份样本中均存在许多独特的细菌类型。酸粥中乳杆菌属平均相对含量>60%，但其共有OTU的比例<0.50%，说明酸粥中隶属于乳杆菌属的细菌在种或株水平上存较大的差异。
由图3可知，酸粥在两份坐标轴的空间排布并不相同，图3a坐标轴中的样本在空间排布上较为分散，而图3b坐标轴中的样本在空间排布上呈现明显的聚类趋势。由此说明，酸粥中存在着许多低丰度物种，且不同样本中低丰度物种之间存在着较大差异，而不同酸粥样本中优势菌的差异却相对较小。为进一步探究不同酸粥样本在属水平上的差异，本研究基于属水平对10份酸粥样品进行PAM分析，结果见图4。
【参考文献】：
期刊论文
[1]传统清香型白酒发酵过程中细菌群落结构及其动态演替[J]. 贾丽艳,荆旭,田宇敏,王晓勇,刘帅,耿添霈,韩英. 中国食品学报. 2020(02)
[2]基于高通量测序的缢蛏及其养殖池塘菌群结构的季节变化[J]. 王鑫毅,谢骁,金珊,竺俊全,赵青松,周素明. 应用生态学报. 2019(12)
[3]传统食品酸粥的发酵工艺[J]. 秦慧彬,黄志伟,张志强,张茜茜,李东航,乔治军,杨洪江. 食品与发酵工业. 2019(17)
[4]退化和正常窖泥微生物多样性的比较分析[J]. 郭壮,葛东颖,尚雪娇,刘文汇,杨少勇,张振东. 食品工业科技. 2018(22)
[5]基于Mi Seq高通量测序技术内蒙古地区酸粥细菌多样性研究[J]. 王玉荣,折米娜,刘康玲,张振东,双全. 食品工业科技. 2018(19)
[6]鲊广椒细菌多样性评价及其对风味的影响[J]. 王玉荣,沈馨,董蕴,尚雪娇,郭壮. 食品与机械. 2018(04)
[7]内蒙古西部地区自然发酵酸粥化学成分及微生物组成分析[J]. 薛建岗,陈永福,于海静,张和平. 食品科技. 2013(07)
博士论文
[1]传统发酵乳中细菌多样性及其功能基因研究[D]. 姚国强.内蒙古农业大学 2017
本文编号：3416587
本文链接：https://www.wllwen.com/wenshubaike/jieribaike/3416587.html
