同域分布的核桃和铁核桃群体遗传及选择基因生物信息学研究
发布时间：2021-09-22 03:08
核桃（Juglans regia L.）和铁核桃（J.sigillata Dode.）均隶属于壳斗目胡桃科（Juglandaceae）胡桃属（Juglans）胡桃组（Section Dioscaryon或Sect.Juglans）,为第三纪“孑遗植物”。其中核桃广泛分布于北半球温带地区,为重要的经济树种,因其坚果和木材具有很高的营养和药用价值,生态价值,故而体现出超高的经济价值。铁核桃为胡桃属植物中国特有种,与广泛栽培的核桃亲缘关系密切。由于在中国西南部核桃与铁核桃表现出显著的同域分布模式,因此探讨该两个近缘种同域分布种间基因渐渗具有重要的研究价值。近年来,大多数研究只针对该组某一物种进行群体遗传学研究,缺乏对胡桃属内两个近缘种的综合比较,没有完全揭示出它们之间的基因渐渗以及两个近缘种种间深层次的物种系统发育关系。本研究利用课题组从胡桃属五个物种筛选出的25对EST-SSR位点对中国西南部（云南、贵州、四川）同域分布的核桃及其近缘种铁核桃间的遗传多样性、遗传结构、基因渐渗进行了研究。此外,对两个近缘种基于转录组选择消除分析筛选出的10个受选择基因序列进行生物信息学方面的分析。主要得出以...
【文章来源】：西北大学陕西省 211工程院校
【文章页数】：105 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
核桃与铁核桃坚果形态比较
第二章 实验材料和方法PCR 扩增产物用 2%琼脂糖凝胶进行电泳检测，DL2000 Marker 点样 1.5 μL（购自西安润德生物技术有限公司）和扩增产物 3μL。检测条带明亮的个体（部分扩增产物检测结果如图 2.2 所示）送至上海生工生物工程有限公司（Sangon,Shanghai,China）进行 STR测序。
受选择位点检测
【参考文献】：
期刊论文
[1]核桃种质资源果实性状的遗传多样性分析[J]. 陈新,徐丽,张力思,张士刚,魏海蓉,刘庆忠. 安徽农业科学. 2017(26)
[2]拟南芥RING finger结构域AtHHR1基因的功能初步研究[J]. 赵白芬,齐辉辉,李旭锋,刘志斌. 四川大学学报(自然科学版). 2017(02)
[3]番茄GRAS转录因子家族的生物信息学分析[J]. 牛义岭,姜秀明,许向阳. 中国农学通报. 2016(21)
[4]马铃薯块茎形成相关基因STI-LIKE在拟南芥植株发育中的功能验证[J]. 平海涛,王玉萍,王东霞,周晓洁. 生物技术通报. 2014(11)
[5]蜜柚泛素蛋白连接酶RING-H2 finger基因的克隆与表达分析[J]. 金晓琴,康振,刘伟娜,潘永娟,王梨嬛,郭卫东,杨莉. 园艺学报. 2014(08)
[6]植物非生物逆境胁迫相关RING finger蛋白[J]. 刘丽娟,刘爱玲,陈信波. 生物技术通报. 2014(07)
[7]植物PPR蛋白家族研究进展[J]. 丁安明,屈旭,李凌,孙玉合. 中国农学通报. 2014(09)
[8]杂交-渐渗的遗传进化效应与栽培作物野生近缘种多样性保护[J]. 卢宝荣. 科学通报. 2014(06)
[9]小果油茶与普通油茶居群遗传结构及种间杂交渐渗[J]. 黄勇. 应用生态学报. 2013(08)
[10]美国黑核桃SSR反应体系优化[J]. 赵鹏,Keith E.Wosete,程飞,张硕新. 植物研究. 2012(02)
博士论文
[1]甘蓝型油菜细胞质雄性不育系SaNa-1A败育的细胞学和分子基础[D]. 杜坤.扬州大学 2016
[2]苏皖4种同域分布栎树的遗传变异与基因渐渗[D]. 魏高明.南京林业大学 2015
[3]水稻抗稻瘟病基因Pid3的抗性同源基因发掘与人工进化研究[D]. 吕启明.四川农业大学 2013
[4]丽江云杉复合体及其近缘种的谱系地理与物种形成[D]. 彭晓莉.兰州大学 2008
硕士论文
[1]胡桃组植物遗传标记开发应用和中国核桃谱系进化历史研究[D]. 冯晓佳.西北大学 2018
[2]麻栎的谱系地理学和遗传多样性研究[D]. 孟旭.西北大学 2017
[3]枹栎和短柄枹栎的居群遗传结构和谱系地理学研究[D]. 王雁红.西北大学 2015
[4]马尾松与黄山松种间基因渐渗研究[D]. 阎毛毛.南京林业大学 2011
[5]一个水稻RING指蛋白基因OsBIRF1的分子鉴定[D]. 吴叶飞.浙江大学 2006
本文编号：3403014
【文章来源】：西北大学陕西省 211工程院校
【文章页数】：105 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
核桃与铁核桃坚果形态比较
第二章 实验材料和方法PCR 扩增产物用 2%琼脂糖凝胶进行电泳检测，DL2000 Marker 点样 1.5 μL（购自西安润德生物技术有限公司）和扩增产物 3μL。检测条带明亮的个体（部分扩增产物检测结果如图 2.2 所示）送至上海生工生物工程有限公司（Sangon,Shanghai,China）进行 STR测序。
受选择位点检测
【参考文献】：
期刊论文
[1]核桃种质资源果实性状的遗传多样性分析[J]. 陈新,徐丽,张力思,张士刚,魏海蓉,刘庆忠. 安徽农业科学. 2017(26)
[2]拟南芥RING finger结构域AtHHR1基因的功能初步研究[J]. 赵白芬,齐辉辉,李旭锋,刘志斌. 四川大学学报(自然科学版). 2017(02)
[3]番茄GRAS转录因子家族的生物信息学分析[J]. 牛义岭,姜秀明,许向阳. 中国农学通报. 2016(21)
[4]马铃薯块茎形成相关基因STI-LIKE在拟南芥植株发育中的功能验证[J]. 平海涛,王玉萍,王东霞,周晓洁. 生物技术通报. 2014(11)
[5]蜜柚泛素蛋白连接酶RING-H2 finger基因的克隆与表达分析[J]. 金晓琴,康振,刘伟娜,潘永娟,王梨嬛,郭卫东,杨莉. 园艺学报. 2014(08)
[6]植物非生物逆境胁迫相关RING finger蛋白[J]. 刘丽娟,刘爱玲,陈信波. 生物技术通报. 2014(07)
[7]植物PPR蛋白家族研究进展[J]. 丁安明,屈旭,李凌,孙玉合. 中国农学通报. 2014(09)
[8]杂交-渐渗的遗传进化效应与栽培作物野生近缘种多样性保护[J]. 卢宝荣. 科学通报. 2014(06)
[9]小果油茶与普通油茶居群遗传结构及种间杂交渐渗[J]. 黄勇. 应用生态学报. 2013(08)
[10]美国黑核桃SSR反应体系优化[J]. 赵鹏,Keith E.Wosete,程飞,张硕新. 植物研究. 2012(02)
博士论文
[1]甘蓝型油菜细胞质雄性不育系SaNa-1A败育的细胞学和分子基础[D]. 杜坤.扬州大学 2016
[2]苏皖4种同域分布栎树的遗传变异与基因渐渗[D]. 魏高明.南京林业大学 2015
[3]水稻抗稻瘟病基因Pid3的抗性同源基因发掘与人工进化研究[D]. 吕启明.四川农业大学 2013
[4]丽江云杉复合体及其近缘种的谱系地理与物种形成[D]. 彭晓莉.兰州大学 2008
硕士论文
[1]胡桃组植物遗传标记开发应用和中国核桃谱系进化历史研究[D]. 冯晓佳.西北大学 2018
[2]麻栎的谱系地理学和遗传多样性研究[D]. 孟旭.西北大学 2017
[3]枹栎和短柄枹栎的居群遗传结构和谱系地理学研究[D]. 王雁红.西北大学 2015
[4]马尾松与黄山松种间基因渐渗研究[D]. 阎毛毛.南京林业大学 2011
[5]一个水稻RING指蛋白基因OsBIRF1的分子鉴定[D]. 吴叶飞.浙江大学 2006
本文编号：3403014
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