黄栌的景观基因组学研究
发布时间：2021-11-22 17:10
环境可以通过施加选择性压力和限制迁移来影响生物的进化轨迹。物种对环境响应的适应性进化是分子生态学和进化生物学的关键问题。在缺乏强大选择压力的地区,物种的适应性分化方向通常是多样的。然而,区域物种自适应分化的驱动机制至今尚未确定。在本研究中,我们使用了景观基因组学方法来推断中国的暖温带地区黄栌的适应性进化。黄栌（Cotinus coggygria）,落叶小乔木或灌木,是我国重要的观赏红叶树种,著名的北京香山红叶就是本树种。该树种原产于东亚到中亚的大部分地区和中国北部的喜马拉雅山。它广泛的分布在中国暖温带地区,其生长的海拔范围在330-2400米。在中国主要分布在河北,河南,湖北,陕西,山东和山西省。景观基因组学通过鉴定适应性遗传变异的环境驱动因素和揭示相关景观格局来研究其适应性分化。在本次实验中,我们选用黄栌为研究对象,对其适应性遗传印记和环境异质性之间的关系进行研究,结果如下:（1）我们用SCo T分子标记对黄栌进行景观基因组学研究。实验中共选取了9个SCo T引物用来研究黄栌种群遗传结构,共选用1131个的SCo T位点。对所有位点进行贝叶斯分析表明,15个黄栌种群被分成东部、西部两...
【文章来源】：河南农业大学河南省
【文章页数】：81 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
图115个采样地黄栌种群的位置
图 2 部分 PCR 产物的电泳图谱Fig. 2 The electrophorograms of some PCR productsker 2.2.0 （SoftGenetics, State College, Pennsylvania, USA）观基因概率，选择峰值在 60-1000 bp 之间，高度在 300 以上的波。 1.0（Vekemans et al., 2002）计算每个群体的遗传参数。主要性等位基因百分比（PPA）、Nei 的基因多样性（HE）（Nei et个等位基因的基因频率。分析，用 STRUCTURE 2.3.4（Pritchard et al., 2000）软件对黄中，选择了一个不含独立等位基因频率的非混合模型。为了计试，对每个 K 值独立运行进行了 10 次。马尔可夫链--蒙特卡计算方法。K 的最佳值的选择是基于 Evanno 等人提出的方法（工具 Structure Harvester（Earl et al., 2012）分析。运用 STR
表 4 排序轴与环境变量的相关性.Table 4 Correlations between environmental variables and the ordination axes.ironmental variable Axis 1 Axis 2 Axis 3 Axis 4Bio3 0.327 -0.523*0.436 0.475Bio5 0.251 -0.702**-0.082 0.065Bio6 0.283 0.062 -0.459 -0.303Bio7 0.053 -0.846**0.282 0.321Bio11 0.297 -0.213 -0.332 -0.185Bio12 0.331 0.750**-0.270 -0.257Bio14 0.471 0.444 -0.166 -0.403Bio15 0.192 -0.637**-0.063 0.510*Bio18 0.689**0.415 -0.323 -0.071
【参考文献】：
期刊论文
[1]承德市黄栌常见病虫害综合防治方法[J]. 崔立明,刘红梅,徐军生,王世平. 北方园艺. 2016(24)
[2]景观遗传学中Mantel检验和dbRDA统计方法的对比分析[J]. 李晓谦,朱京海,宋有涛. 辽宁大学学报(自然科学版). 2015(04)
[3]中国暖温带山地植被生态学研究进展[J]. 上官铁梁,李晋鹏,郭东罡. 山地学报. 2009(02)
[4]黄栌的抗凝血作用[J]. 崔恩贤,龙丽辉,刘静,曹永孝. 中药材. 2007(02)
[5]美国红栌的组培快繁试验[J]. 李双云,冯建华,刘翠兰,李丽. 山东林业科技. 2005(05)
[6]黄栌的组织培养研究[J]. 苗青,曲波,邵美妮,翟强,陈之应. 辽宁林业科技. 2005(01)
[7]暖温带若干落叶阔叶林群落物种多样性及其与群落动态的关系[J]. 高贤明,马克平,陈灵芝. 植物生态学报. 2001(03)
[8]黄栌冲剂的制备及质控方法[J]. 李建华,张正臣,申庆亮. 中成药. 1992(10)
本文编号：3512119
【文章来源】：河南农业大学河南省
【文章页数】：81 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
图115个采样地黄栌种群的位置
图 2 部分 PCR 产物的电泳图谱Fig. 2 The electrophorograms of some PCR productsker 2.2.0 （SoftGenetics, State College, Pennsylvania, USA）观基因概率，选择峰值在 60-1000 bp 之间，高度在 300 以上的波。 1.0（Vekemans et al., 2002）计算每个群体的遗传参数。主要性等位基因百分比（PPA）、Nei 的基因多样性（HE）（Nei et个等位基因的基因频率。分析，用 STRUCTURE 2.3.4（Pritchard et al., 2000）软件对黄中，选择了一个不含独立等位基因频率的非混合模型。为了计试，对每个 K 值独立运行进行了 10 次。马尔可夫链--蒙特卡计算方法。K 的最佳值的选择是基于 Evanno 等人提出的方法（工具 Structure Harvester（Earl et al., 2012）分析。运用 STR
表 4 排序轴与环境变量的相关性.Table 4 Correlations between environmental variables and the ordination axes.ironmental variable Axis 1 Axis 2 Axis 3 Axis 4Bio3 0.327 -0.523*0.436 0.475Bio5 0.251 -0.702**-0.082 0.065Bio6 0.283 0.062 -0.459 -0.303Bio7 0.053 -0.846**0.282 0.321Bio11 0.297 -0.213 -0.332 -0.185Bio12 0.331 0.750**-0.270 -0.257Bio14 0.471 0.444 -0.166 -0.403Bio15 0.192 -0.637**-0.063 0.510*Bio18 0.689**0.415 -0.323 -0.071
【参考文献】：
期刊论文
[1]承德市黄栌常见病虫害综合防治方法[J]. 崔立明,刘红梅,徐军生,王世平. 北方园艺. 2016(24)
[2]景观遗传学中Mantel检验和dbRDA统计方法的对比分析[J]. 李晓谦,朱京海,宋有涛. 辽宁大学学报(自然科学版). 2015(04)
[3]中国暖温带山地植被生态学研究进展[J]. 上官铁梁,李晋鹏,郭东罡. 山地学报. 2009(02)
[4]黄栌的抗凝血作用[J]. 崔恩贤,龙丽辉,刘静,曹永孝. 中药材. 2007(02)
[5]美国红栌的组培快繁试验[J]. 李双云,冯建华,刘翠兰,李丽. 山东林业科技. 2005(05)
[6]黄栌的组织培养研究[J]. 苗青,曲波,邵美妮,翟强,陈之应. 辽宁林业科技. 2005(01)
[7]暖温带若干落叶阔叶林群落物种多样性及其与群落动态的关系[J]. 高贤明,马克平,陈灵芝. 植物生态学报. 2001(03)
[8]黄栌冲剂的制备及质控方法[J]. 李建华,张正臣,申庆亮. 中成药. 1992(10)
本文编号：3512119
本文链接：https://www.wllwen.com/wenyilunwen/huanjingshejilunwen/3512119.html
