基于基因分型测序（GBS）的檫木景观遗传学研究

发布时间：2024-04-02 00:03

　　檫木(Sassafras tzumu.Hemsl),隶属于樟科(Lauraceae)檫木属(Sassafras)。主要分布在我国大陆地区和北美,材料用途广泛。目前对于檫木的研究集中在探究其生理生化特性方面。作为在长江以南地区广泛分布的物种,将檫木作为代表,利用檫木的分布信息研究该地区物种的分布及预测其应对气候变化的响应对于物种的保护等方面具有重要的参考意义。此外,结合基因分型测序技术(GBS)和景观遗传学的研究,能够揭示其代表性类群的遗传结构和谱系地理分布之间的关系,解析不同进化力量对物种的影响,并利用此关联预测未来气候变化对该物种的遗传结构和遗传多样性的影响。本研究通过13个群体共计106个个体的基因分型测序的结果,探究檫木的遗传多样性和景观遗传学特性。使用Biomod2组合模型对檫木的分布进行模拟,组合模型模拟结果的AUC平均值大于0.89,表明预测结果良好。影响其分布的生物气候因子按照影响大小依次为:昼夜温差月均值(Bio02)、年平均温度(Bio01)、温度季节变化(Bio04)和最干月降水量(Bio14)。模型结果显示,在基准气候条件下,檫木的分布主要集中在长江以南大部分地区...

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【学位级别】：硕士

【部分图文】：

图2.1檫木分布点示意图

233个分布点，以下载自国家基础地理信息系统网站（http：//ngcc.sbsm.gov.cn）的中国行政区划图和下载自寒区旱区科学数据中心（http://westdc.westgis.ac.cn/）的数字高程模型作为底图，将233个分布点可视化表达，檫木分布点见图2.1。图2....

图2.3物种分布模型概述

通过R语言软件包Biomod2(https://cran.r-project.org/web/packages/biomod2/)来对檫木不同时期的适宜生境进行预测（图2.3），Biomod2(BiodiversityModelling2)是由欧盟FP5....

图3.3基准气候条件下檫木适宜生境Fig.3.3SuitablehabitatforS.tzumuunderbaselineclimatecondition

此外，包括海拔和土壤酸碱度在内的其他环境因子对模型图3.2各个环境变量对檫木分布的重要性.2ImportanceofeachenvironmentalvariableforthedistributionofS.tzum适宜生境0.000.100.200.....

图3.6不同气候情景下檫木分布质心变化图

28图3.6不同气候情景下檫木分布质心变化图Fig.3.6ChangesincentroiddistributionofS.tzumuunderdifferentclimaticscenarios3.2景观遗传学研究结果3.2.1遗传结构与遗传多样....

本文编号：3945508