结核分枝杆菌higA基因的扩增及生物信息学分析

发布时间：2018-03-07 01:29

  本文选题：分枝杆菌　切入点：结核　出处：《重庆医学》2017年14期 　论文类型：期刊论文

【摘要】：目的对结核分枝杆菌的higA基因进行扩增,同时利用生物信息学方法分析其编码蛋白的结构和功能。方法从结核分枝杆菌标准株H37Rv基因组DNA中扩增higA基因,对扩增产物进行测序。利用生物信息学网站和软件分析higA蛋白的理化性质、信号肽、空间结构、抗原表位等。结果 higA基因扩增产物与预期一致,大小为450bp。higA蛋白共149个氨基酸,理论等电点7.93,脂溶性系数94.30,不稳定系数36.57,预测该蛋白为稳定蛋白。higA蛋白无信号肽,含10个磷酸化位点和多个潜在的抗原表位。结论成功扩增出结核分枝杆菌higA基因。
[Abstract]:Objective to amplify the higA gene of Mycobacterium tuberculosis and analyze the structure and function of its encoded protein by bioinformatics. Methods the higA gene was amplified from the genomic DNA of Mycobacterium tuberculosis standard strain H37Rv. The amplified products were sequenced. The physicochemical properties, signal peptide, spatial structure and antigen epitope of higA protein were analyzed by bioinformatics website and software. Results the amplified product of higA gene was in accordance with the expectation, with the size of 450 bp.higA protein of 149 amino acids. The theoretical isoelectric point was 7.93, the fat solubility coefficient was 94.30, and the instability coefficient was 36.57. It was predicted that the protein was a stable protein. HigA protein contained 10 phosphorylation sites and several potential antigen epitopes. Conclusion the higA gene of Mycobacterium tuberculosis was successfully amplified.
【作者单位】： 潍坊医学院医学检验学系;潍坊医学院临床学院病原生物学教研室;
【基金】：国家自然科学基金资助项目(81470001,81170080)
【分类号】：Q811.4;R378.911

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