DNA调控网络分析与数字化表征

发布时间：2017-03-19 05:03

  本文关键词：DNA调控网络分析与数字化表征，，由笔耕文化传播整理发布。

【摘要】：电子系统受到复杂电磁环境的影响可能会导致失灵甚至损毁,而传统的电磁防护存在防护主动性和自我修复性差等缺点,因此急需寻找新的电子系统抗扰及防护方式。由于生物网络具有“自组织、自适应和自修复”等特性,使得生物体在复杂电磁环境中能够保持自身内环境的稳定性。因此,对生物网络的特性进行研究能够为电磁防护提供新的思想和解决方案。基因调控网络是一种重要的生物网络,具有复杂性、稳定性等特性,基因调控网络中具有代表性的是P53基因调控网络,本文基于布尔网络建模方法,对P53基因调控网络进行分析,研究网络的逻辑特性及数字化表达。主要工作如下:1、实现了P53基因调控网络的可视化,通过可视化得到了P53基因调控网络中各节点的入度分布,根据入度分布构建了单中心基因的连接类型及对应逻辑电路。2、对P53基因调控网络进行数据处理,通过编程实现了各节点连接类型的自动选择,并结合权值矩阵对各连接类型的输入进行判断,为P53网络中各基因选择了相关的连接类型及对应的逻辑电路,并对基因调控网络逻辑电路的稳定性进行了初步的分析。3、从模体的角度对P53基因调控网络进行了分析,构建了三种不同的随机网络,分别对P53基因调控网络进行模体检测,对检测到的模体进行了逻辑电路的转化,并对其稳定性进行了分析。
【关键词】：基因调控网络 布尔网络 网络数字化 子网搜索 模体识别
【学位授予单位】：河北工业大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2015
【分类号】：R3416
【目录】：

• 摘要4-5
• ABSTRACT5-8
• 第一章 绪论8-20
• 1.1 研究背景8-9
• 1.2 基因调控网络9-15
• 1.2.1 中心法则9-10
• 1.2.2 基因调控网络数据来源10-11
• 1.2.3 P53基因调控网络11-12
• 1.2.4 基因调控网络常用数学模型12-15
• 1.3 基因调控网络国内外研究现状15-18
• 1.3.1 国内研究进展15-16
• 1.3.2 国外研究进展16-18
• 1.4 本文的主要工作18-20
• 第二章 基因调控网络可视化及逻辑分析20-28
• 2.1 基因调控网络构建的描述20-21
• 2.2 基因调控网络图的可视化21-23
• 2.3 基因连接逻辑关系表达23-27
• 2.4 本章小结27-28
• 第三章 基于基因调控网络布尔模型的逻辑电路构建28-38
• 3.1 标志位的设置28-29
• 3.2 基因调控网络的数据处理29-31
• 3.3 网络节点的类型选择31-34
• 3.4 基因调控网络逻辑电路的稳定性分析34-36
• 3.5 本章小结36-38
• 第四章 基因调控网络模体研究38-48
• 4.1 基因调控网络的模体38-39
• 4.2 网络模体识别39-42
• 4.2.1 构建随机网络39-40
• 4.2.2 子图搜索算法40-41
• 4.2.3 评价模体的参数41-42
• 4.3 对P53调控网络进行模体检测42-44
• 4.4 P53网络模体的逻辑分析44-46
• 4.5 本章小结46-48
• 第五章 结论48-50
• 5.1 总结48-49
• 5.2 工作展望49-50
• 参考文献50-54
• 致谢54

【共引文献】

中国期刊全文数据库 前2条

1 郭子龙;纪兆华;涂华伟;梁艳春;;基因调控网络的研究内容及其数据分析方法[J];电脑知识与技术;2008年15期

2 刘齐军;王正华;郭昊;孙汉昌;刘万霖;朱云平;;一种新的度量生物复杂网络模块性的方法[J];计算机工程与科学;2010年08期

中国博士学位论文全文数据库 前2条

1 徐红林;基因调控网络的建模及其结构分解方法研究[D];江南大学;2010年

2 刘齐军;生物学网络的功能模块性分析与模块识别方法研究[D];国防科学技术大学;2010年

  本文关键词：DNA调控网络分析与数字化表征，由笔耕文化传播整理发布。

本文编号：255538