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嗜肺军团菌效应蛋白SdeA修饰泛素的结构基础

发布时间:2020-05-21 02:38
【摘要】:泛素化是蛋白质翻译后修饰的一种方式,控制真核细胞中几乎所有的生理过程。目前,嗜肺军团菌中的一个效应蛋白SdeA经研究发现可以以一种特殊的方式催化泛素化过程,其可对泛素(Ub)的第42位精氨酸进行两步修饰,使泛素转变成为ADP核糖基泛素(ADPrUb),然后再转变为磷酸核糖基泛素(PrUb)。这两个过程依次由单ADP-核糖基转移酶(mART)和磷酸二酯酶(PDE)两个结构域催化。ADPrUb和PrUb也被证明是新颖和重要的泛素修饰,可以影响宿主泛素化和去泛素化系统,然而SdeA催化的泛素化过程机理仍然未知。在本论文工作中,我们分别解析了 SdeA231-1190的无配体、Ub结合和Ub-NADH结合态的晶体结构,揭示了 SdeA的mART和PDE结构域形成了一个催化核心。当Ub结合后,SdeAmART中的ARTT和PNloop发生显著的构象变化。在结构上,UbR72比UbR42更接近SdeAmART的活性位点。结合生物化学和分子动力学模拟分析,这些结果表明UbR72发挥类似“探针”的作用先与SdeAmART相互作用,然后在泛素ADP-核糖基化期间UbR72和UbR42的侧链发生明显的构象变化,使得UbR42靠近活性中心。总之,我们的研究揭示了 SdeA介导的泛素修饰的机制,并为设计针对SdeA家族的小分子药物,作为潜在的抗生素以治疗军团菌肺炎,以及进一步研究ADPrUb和PrUb的功能提供了重要的结构基础。
【图文】:

示意图,泛素,结构示意图,泛素化


形成多种方式的泛素链,,但不同的方式具有不同的生理功能,其中最常见的是在K48逡逑和K63生成的泛素链,被称为典型泛素化。随着研[偟纳钊耄堑湫头核亓淳哂械纳义侠砉δ芤苍嚼丛奖谎绣橙嗽彼粗兀郏叮撸福荨M迹保参核卣褰峁故疽馔肌e义霞珏义希畬翦义贤迹保卜核亟峁故疽馔煎义希疲椋纾澹保插澹樱悖瑁澹恚幔簦椋沐澹洌椋幔纾颍幔礤澹铮驽澹酰猓椋瘢酰椋簦椋铄义希保保撤核鼗掷噱义戏核鼗鹘诎诙嘀稚砉蹋煌纳砉逃刹煌掷嗟姆核鼗骺兀溴义现兄饕嘈头治海ǎ保┑シ核鼗T谝桓瞿康牡鞍字什谢砑拥ザ赖模眨猓梢杂跋煜噱义贤鞍灼渌蹋⑶业シ核鼗瞧渌嘈头核鼗谋匾跫#ǎ玻┒喾核鼗<父鲥义侠蛋彼嵊胪桓龇核胤从Α#ǎ常┗旌戏核亓础A吹难由焓怯刹煌牧唇惶媪樱淳咤义希插义

本文编号:2673595

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