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大鼠良性前列腺增生完全去神经支配后基因表达谱动态变化研究

发布时间:2023-03-04 06:43
  目的:探索大鼠BPH组织完全去神经支配后进行性萎缩过程中全基因表达谱动态变化情况。方法:29周龄雄性自发性高血压大鼠(SHR,已自发形成BPH)12只,9只手术切断前列腺全部支配神经。分别于手术当天取对照组(C)3只、术后3 d(D3)、7 d(D7)、11 d(D11)SHR各3只,取前列腺腹侧叶进行组织病理学检查和RNA提取,所有RNA样本进行全基因表达谱芯片检测、实时荧光PCR验证和生物信息学分析。结果:完全去神经支配后大鼠BPH组织进行性萎缩。各样本全基因组表达谱芯片检测均成功完成,随机选择的6个差异表达基因的实时荧光PCR结果证实芯片检测可靠。分层聚类分析显示:D3/C表达上调基因108个,下调基因175个;D7/C上调基因462个,下调基因189个;D11/C上调基因548个,下调基因256个。GO功能富集分析显示各比较组差异表达的基因涉及数百上千数量不等的分子功能、生物学进程和细胞组分。Pathway通路富集分析显示各比较组差异表达的基因涉及数百条信号通路,其中多条信号通路在各比较组均能富集到且排名靠前,其涉及的基因大部分都表达上调,且大多数与补体系统激活相关。结论:完全...

【文章页数】:7 页

【文章目录】:
1 材料与方法
    1.1 实验动物
    1.2 手术操作
    1.3 分组、标本收集和处理
    1.4 苏木素-伊红(HE)染色
    1.5 RNA提取
    1.6 全基因表达谱芯片检测及数据分析
    1.7 生物信息学和统计学分析
        1.7.1 分层聚类分析(hierarchical clustering analysis)
        1.7.2 基因本体(gene ontology, GO)功能富集分析
        1.7.3 pathway通路富集分析
    1.8 实时荧光PCR验证分析
2 结果
    2.1 组织病理学变化
    2.2 微阵列检测结果及基因组差异表达情况
    2.3 GO功能富集分析
    2.4 pathway通路富集分析
    2.5 实时荧光PCR验证情况
3 讨论



本文编号:3753905

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