MEK1/2全长结构及磷酸化激活的分子机理的计算结构生物学研究

发布时间：2024-06-11 22:16

　　多种信号经由相同或类似信号分子传递,导致不同生物学效应,是一种广泛存在的细胞信号转导现象,有关其中共同通路部分如何对不同信号进行分拣和传递,其详细的分子构象过程和机理目前并不完全清楚。 ERK/MAPK信号通路就是这样一条重要的细胞内共同通路。与胞外信号分子结合后,多种细胞表面受体都可引发MEK和ERK的依次磷酸化激活,磷酸化激活的ERK可再与上百种下游蛋白底物(如转录调控因子)相互作用,从而调节多种基因的表达并引起相应的细胞变化。研究表明,不同信号经ERK/MAPK信号通路传递后可产生不同甚至相反的细胞生物学效应。值得注意的是,MEK作为该通路中的一个关键节点分子,只包括两个蛋白分子(MEK1和MEK2),而且其蛋白序列具有很高的相似性,却可以分别传递如此众多的不同信号,势必与其细微的构象变化密切相关,但具体机理目前并不清楚。因此,研究MEK蛋白分子在各种功能状态下的三维结构动态性,将为解释此类共同通路的信号分拣传递原理提供非常好的范例。 经过多年努力,目前已获得MEK分子的多个三维结构,但无一例外,它们都缺失三部分的构象信息,即N端区、PR区和C端区;分析认为这三个部分都具有相当的...

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【学位级别】：硕士

【部分图文】：

图1.MAPK信号通路示意图

军事医学科学院硕士学位论文前言receptor）、PDGFR（platelet-derivedgrowthfactorreceptor）和TRK（tyrosinekinasereceptor）A，B等。活化的RAF可将MEK的两个特定丝氨酸磷酸化，使MEK....

图31S9件为

军事图2*号插入有明序列这种ERK事医学科学院硕2.MEK1和表示相同氨入的空格。MEK1和明显构象差列比对显示种序列差异K/MAPK通硕士学位论文MEK2的序氨基酸，:表序列比对软MEK2具有差异（图3）。示，MEK1和异与其功能通路在MEK序列比对图表示保....

图1.1，利用SOPMA服务器[35]对MEK1和MEK2进行二级结构预测的结果

军事医学科学院硕士学位论文第一部分MEK分子完整三维结构的构建致，因此在该区域很可能会形成一个长螺旋。因此我们选择对MEKN端缺失部分进行单独手动构建多肽并进行分子动力学模拟，通过对其模拟轨迹的分析研究它的从头折叠过程，从而获得合适的构象后进行MEK完整三维结构的....

图1.2，M64和M68初始结构图

覆盖二级结构预测显示的螺旋区域（MEK1中的Ala26-Glu62，MEK2中的Ser30-Glu66），这样选择的好处是可以获得一个完整的螺旋，有下一步进行结构构建；四，MEK1和MEK2选择的序列必须要符合比对的结果，便于进一步MEK1和MEK2的N端....

本文编号：3992797