GC夹对三种食源性致病菌的rpoB-PCR-DGGE图谱的影响

发布时间：2017-05-31 16:16

  本文关键词：GC夹对三种食源性致病菌的rpoB-PCR-DGGE图谱的影响，由笔耕文化传播整理发布。

【摘要】：旨在探讨不同的GC夹以及GC夹连接引物的不同位置对3种食源性致病菌的DGGE图谱结果的影响,合成6对RNA聚合酶β亚基编码基因rpo B引物(rpo B 1-6),含3种不同GC夹(GC-1,GC-2,GC-3),且每种GC夹分别连接于正反引物5'端。应用rpo B-PCR-DGGE对副溶血性弧菌(5株),单增李斯特菌(5株)和沙门氏菌(3株)进行分析,并与V3-PCR-DGGE和ERIC-PCR的图谱及聚类分析结果进行比较。结果显示,GC-3夹连接于反引物上的rpo B-PCR-DGGE分辨效果最好,分辨力指数达0.9,与ERIC-PCR相同,高于V3-PCR-DGGE。GC夹序列和连接引物位置均对rpo B-PCR-DGGE图谱结果产生影响。选择或设计无连续鸟嘌呤(G)排列的GC夹序列且将其连接于反引物5'端,均能有效提高rpo B-PCR-DGGE对食源性致病菌检测与分型的效果。
【作者单位】： 上海海洋大学食品学院;农业部水产品贮藏保鲜质量安全风险评估实验室(上海);上海水产品加工及贮藏工程技术研究中心;
【关键词】： 副溶血性弧菌 单增李斯特菌 沙门氏菌 GC夹 rpo B-PCR-DGGE
【基金】：国家自然科学基金面上项目(31271870) 上海市科委科技创新行动计划项目(14DZ1205100,14320502100) 上海市科技兴农重点攻关项目(沪农科攻字2014第3-5号,2005第4-8号) 上海市水产品加工及贮藏工程技术研究中心(11DZ2280300)
【分类号】：R378
【正文快照】： 3.上海水产品加工及贮藏工程技术研究中心,上海201306)近年来随着分子生物学技术的迅速发展,出现了一系列的食源性致病菌流行病学调查方法,如脉冲电场凝胶电泳(PFGE)[1]、扩增片段长度多态性(AFLP)[2]、随机扩增多态性(RAPD)[3]、重复元素多态性(REP-PCR)[4],以及多位点序列分

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本文编号：410007