人巨细胞病毒US31基因序列特征分析及B细胞表位预测

发布时间：2017-08-06 12:08

  本文关键词：人巨细胞病毒US31基因序列特征分析及B细胞表位预测

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【摘要】：目的:分析人巨细胞病毒(HCMV)US31基因序列,预测US31基因编码蛋白的B细胞优势表位。方法:基于US31基因编码蛋白的氨基酸序列,结合亲水性参数、可及性参数、抗原性参数、柔韧性参数及二级结构方案对HCMV US31基因编码各型蛋白的B细胞表位进行预测,参照已建立的预测方法综合评价US31基因B细胞优势表位。结果:US31核苷酸序列变异较少,大部分是同义突变,氨基酸序列高度保守;其编码蛋白全长为162个氨基酸,相对分子质量20 k D,等电点7.66,为可溶性蛋白,二级结构中以无规则卷曲为主。经综合分析,US31基因的B细胞优势表位可能存在于氨基酸序列N端的5~19、32~47、58~68、110~124区段。结论:多参数预测HCMV p US31的B细胞优势表位,为进一步研究蛋白特征、制备单克隆抗体及表位疫苗提供依据。
【作者单位】： 温州医科大学微生物学与免疫学教研室分子病毒与免疫研究所热带医学研究所;温州医科大学第二临床医学院;温州医科大学附属第一医院胃肠外科;
【关键词】： 人巨细胞病毒 US基因 B细胞表位
【基金】：国家自然科学基金资助项目(81472308,81672707) 浙江省大学生新苗计划(2014R413058,2015R413069)
【分类号】：R373
【正文快照】： 2016-04-25人巨细胞病毒(human cytomegalovirus,HCMV)属疱疹病毒科β亚科,为双链DNA病毒,基因组全长约230~240 kb,含208个开放读码框,由长独特序列(unique long domains,UL)和短独特序列(uniqueshort domains,US)2个片段组成。US31基因是US1基因家族成员,5’端和3’端分别与U，

本文编号：629758