基于高通量测序的黑胸大蠊转录组分析

发布时间：2017-08-24 03:00

  本文关键词：基于高通量测序的黑胸大蠊转录组分析

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【摘要】：目的利用转录组技术获得非模式生物黑胸大蠊的大量转录组数据,为今后开展分子生物学研究打下基础。方法利用Illumina测序技术对黑胸大蠊Periplaneta fuliginosa进行转录组测序。测序结果取阈值e≤10~(-10)在SwissProt、NR、KEGG、COG、GO和Pfam等公共序列数据库进行比对。结果获得黑胸大蠊转录组信息数据量13.63 G,39576个unigene,总长度32 297 597 bp,最长27 693 bp,平均长度816 bp。共获得61 167个注释结果。发现黑胸大蠊单核苷酸的多态性位点(SNP)置换33 955个,颠换16 561个,找到2 666个微卫星序列。结论数量巨大的转录组信息为黑胸大蠊新基因的克隆和基因组学研究提供了有价值的信息。
【作者单位】： 浙江出入境检验检疫局;温州出入境检验检疫局;西南大学;
【关键词】： 黑胸大蠊 高通量测序 转录组
【基金】：国家质检总局科技计划项目(2015IK303) 浙江出入境检验检疫局科技计划项目(2015-ZKZ-02)
【分类号】：R384
【正文快照】： 黑胸大蠊(Periplaneta fuliginosa)是南方常见的大蠊种类,属蜚蠊目(Blattodea),蜚蠊科(Blattidae),大蠊属(Peripalneta),是我国重要的病媒生物。适应能力、繁殖能力、行动能力很强,能机械携带痢疾杆菌、大肠杆菌等肠道病原菌、病毒、霉菌和蛔虫卵,对公共卫生安全造成影响[1]。

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1 徐绍锐;汪世平;吴仕筠;肖小芹;曾少华;余俊龙;戴橄;罗臣;;黑胸大蠊室内繁殖、发育的生物学特性研究[J];中国人兽共患病学报;2006年10期

2 柳建发;汪世平;蒋雯雯;张R奸，

本文编号：728805