应用16S rRNA高通量测序法比较人与常用实验动物口腔菌群的异同

发布时间：2017-08-30 10:22

  本文关键词：应用16S rRNA高通量测序法比较人与常用实验动物口腔菌群的异同

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【摘要】：目的应用16S rRNA高通量测序法测定几种常用实验动物(西藏小型猪、比格犬、猕猴、新西兰兔、Wistar大鼠)的口腔菌群,并和人的口腔菌群进行对比分析,为口腔微生态的动物模型研究提供基础性资料。方法用一次性棉拭子采集西藏小型猪、比格犬、猕猴、新西兰兔、Wistar大鼠和人的口腔菌群标本,提取样品总DNA,使用带标签的通用引物扩增16S rRNA V4区片段,Illumina测序,经BIPES以及QIIME分析比较菌群多样性及结构。结果人与5种常用实验动物口腔菌群的丰富度均差异显著(P0.05),不同种类动物有其各自独特的口腔菌群,但猴的口腔菌群与人最为相似。结论根据与人口腔某类菌群的相似程度,5种动物中,猴口腔的梭菌属(Fusobacterium)、卟啉菌属(Porphyromonas)水平与人最相似,提示猴可能是研究人口腔菌群较适宜的模型动物。从特定菌门角度,西藏小型猪可能是研究与变形菌门(Proteobacteria)相关疾病的较适宜模型动物;比格犬可能是研究与螺旋体门(Spirochaetes)相关疾病的较适宜模型动物。
【作者单位】： 南方医科大学实验动物中心;南方医科大学公共卫生与热带医学学院;广东医科大学;南方医科大学珠江医院检验医学部;
【关键词】： 实验动物 口腔菌群 S rRNA 西藏小型猪 比格犬 猕猴 新西兰兔 Wistar大鼠
【基金】：广东省科技计划项目(编号:2013B030300040,2015A030302076) 东莞松山湖高新区生物医药外包服务基地建设(编号:2012B011000004)
【分类号】：R-332
【正文快照】： communities from those animals were compared with that of humans using BIPES and QIIME analysis after Illuminasequencing of 16S rRNA V4 fragments.Results The richness of the oral microbial communities of humans and the fivespecies of laboratory animals w

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本文编号：758741